Page 102 - 《广西植物》2023年第11期
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２ ０ ６ ２ 广 西 植 物 ４３ 卷
核苷酸重复类型中ꎬ出现频率最高的是 ＡＧ / ＣＴ 和 用 ＥＳＴ￣Ｇｅｎｏｍｅ、Ｐｈｒａｐ、Ｃｌｕｓｔａｌｗ、ＢＬＡＳＴ 等 软 件 对
ＴＣ / ＧＡꎬ其次是 ＡＴ 和 ＴＡꎬ而 ＧＣ / ＣＧ 出现频率低ꎬ ＥＳＴ 序列进行精确分析以增加供试材料的基因型
这与 Ｙｉ 等 ( ２００６)、 Ｋａｎｔｅｔｙ 等 ( ２００２) 和 张 宇 等 与数量是提高 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记多态性和价值性的有
(２０１０)在辣椒上的研究结果基本一致ꎬ而且与珍 效途径( 张宇等ꎬ２０１０)ꎮ 因为 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 是对基因
珠粟 ( Ｓｅｌｔｈｉｌｖｅｌ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００８)、 石 蒜 ( 李 青 竹 等ꎬ 内部变异的一种直接评价ꎬ所以它将可能与某些
２０２１)、蝴蝶兰( 张水明等ꎬ２０１２) 和毛竹( 张智俊 表型、生理生化特征或某个特定的环境适应型相
等ꎬ２０１１)的结果相似ꎬ说明 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 在其发生和 联系ꎬ反映植物基因表达的转录部分( 姚利华等ꎬ
进化过程中具有高度保守性ꎮ ＧＡ / ＴＣ 在 ｍＲＮＡ 水 ２００８)ꎮ 挑选的 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记可用于遗传多样性
平上 可 以 代 表 遗 传 密 码 子 ＧＡＧ、 ＡＧＡ、 ＵＣＵ 和 分析与分子标记辅助育种ꎮ 由于其丰富的多态性
ＣＵＣꎬ并可以分别翻译成精氨酸、谷氨酸、丙氨酸 信息含量ꎬ因此 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 可为遗传连锁图谱构建
和亮氨酸ꎬ而丙氨酸和亮氨酸分别以 ８％和 １０％的 等奠定基础ꎮ 下一步可寻找与辣椒耐涝基因连锁
高频率存在于蛋白质中ꎬ这可能是 ＧＡ / ＴＣ 在 ＥＳＴ 的 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记ꎬ以应用于辣椒耐涝育种研究ꎮ
中高频出现的原因(Ｋａｎｔｅｔｙ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００２)ꎮ 在三核
苷酸中ꎬ出现频率高的是 ＴＴＧ / ＣＡＡ 和 ＡＣＡ / ＴＧＴꎬ
这与 Ｋｕｍｐａｔｌａ 等 ( ２００５) 和 Ｙｉ 等 ( ２００６) 对 辣 椒 参考文献:
ＥＳＴ￣ＳＳＲ 的研究结果相符合ꎮ 但刘峰等(２０１２) 研
ＡＮ Ｑꎬ ＦＥＮＧ ＹＨꎬ ＹＡＮＧ ＺＱꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ
究认为ꎬ除单核苷酸 Ａ / Ｔ 重复序列外ꎬ辣椒 ＥＳＴ￣ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｆｉｃ ｇｅｎｅｒａｌｉｔｙ ｏｆ Ａｌｂｉｚｚｉａ
ＳＳＲ 最 多 的 是 三 核 苷 酸 重 复 序 列 ＡＡＣ / ＧＴＴ 和 ｏｄｏｒａｔｉｓｓｉｍａ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４２(８): １３７４－１３８２. [安琪ꎬ 冯
源恒ꎬ 杨章旗ꎬ 等ꎬ ２０２２. 香合欢 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记开发及种
ＡＡＧ / ＣＴＴꎬ其次是二核苷酸重复序列ꎮ 这可能是
间通用性研究 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４２(８): １３７４－１３８２.]
由 ＳＳＲ 搜索标准(基序长度、重复次数等)、分析软 ＡＮＤＲＥＡＳ Ｕꎬ ＩＯＡＮＡ Ｃꎬ ＴＲＩＩＮＵ Ｋꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２. Ｐｒｉｍｅｒ ３￣
件及数据库大小不同所造成ꎮ ｎｅｗ ｃａｐａｂｉｌｉｔｉｅｓ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｆａｃｅｓ [ Ｊ ]. Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄ Ｒｅｓꎬ
３.３ 辣椒转录组 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 的多态性 ４０(１５): ｅ１１５.
ＣＨＥＮ ＹＷꎬ ＬＩＡＯ ＲＪꎬ ＹＥ ＢＨꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ＳＳＲ
在本研究中ꎬ共有 ６ ０１８ 条 ＳＳＲ 长度大于 ２０ ｌｏｃｉ ｉｎ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ
ｂｐꎬ占全部 ＳＳＲ 总数的 ２２.６５％ꎻ２０ ５５６ 条 ＳＳＲ 长 ｉｎ Ｐｏｌｙｇｏｎａｔｕｍ ｃｙｒｔｏｎｅｍａ [Ｊ]. Ｃｈｉｎ Ｔｒａｄｉｔ Ｈｅｒｂ Ｄｒｕｇｓꎬ
度介 于 １２ ~ １９ ｂｐ 之 间ꎬ 占 所 有 ＳＳＲ 总 数 的 ５１(１): １８２ － １８９. [ 陈 友 吾ꎬ 廖 荣 俊ꎬ 叶 碧 欢ꎬ 等ꎬ
２０２０. 多花黄精转录组 ＳＳＲ 位点分析及分子标记开发
７７.３５％ꎬ说 明 辣 椒 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 具 有 较 好 的 多 态 性
[Ｊ]. 中草药ꎬ ５１(１): １８２－１８９.]
(Ｔｅｍｎｙｋｈ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００１)ꎬ这与盛文涛等(２０１９) 的 ＦＵ ＨＦꎬ ＬÜ ＸＨꎬ ＣＨＥＮ ＪＹꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃａｐｓｉｃｕｍ ｇｅｒｍｐｌａｓｍ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｐｈｅｎｏｔｙｐｉｃ ｔｒａｉｔｓ
研究结果基本一致ꎬ可用于辣椒分子标记研究ꎮ
ｗｉｔｈ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒｓ [Ｊ]. Ｊ Ｎｕｃｌ Ａｇｒｉｃ Ｓｃｉꎬ ３２(７): １３０９－
根据 ２６ ５７４ 条 ＥＳＴ 序列设计了 １０ ００２ 对 ＳＳＲ 位 １３１９. [傅鸿妃ꎬ 吕晓菡ꎬ 陈建瑛ꎬ 等ꎬ ２０１８. 辣椒种质表
点特异性引物ꎬ从中随机挑选了 ３０ 对引物进行 型性状与 ＳＳＲ 分子标记的遗传多样性分析 [Ｊ]. 核农学
ＰＣＲ 验证ꎬ都可以实现有效扩增ꎬ较大的数据量和 报ꎬ ３２(７): １３０９－１３１９.]
ＧＵＡＮ ＪＪꎬ ＹＵ ＺＨꎬ ＹＡＮＧ ＸＨꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｓｔｕｄｙ ｏｎ ｔｈｅ
较高的拼接质量应是 ＥＳＴ 扩增效率高的原因ꎮ 在
ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒｓ ｉｎ ｐｅｐｐｅｒ ( Ｃａｐｓｉｃｕｍ ａｎｎｕｕｍ
３０ 对扩增引物中ꎬ有 ７ 对(２３.３％) 引物在 ３ 份辣 Ｌ.) ＤＵＳ ｔｅｓｔｉｎｇ [Ｊ]. Ｊ Ｐｌａｎｔ Ｇｅｎｅｔ Ｒｅｓｏｕｒꎬ ２０(２): ３９６－
椒中表现出多态性ꎬ低于李永平等(２０１６) 的研究 ４０５. [管俊娇ꎬ 余志慧ꎬ 杨晓洪ꎬ 等ꎬ ２０１９. ＳＳＲ 标记在
结果(３５.５％)ꎬ其原因可能与本研究所选用的 ３ 份 辣椒 ＤＵＳ 测试中的应用研究 [Ｊ]. 植物遗传资源学报ꎬ
２０(２): ３９６－４０５.]
辣椒 材 料 均 为 贵 州 地 方 品 种ꎬ 并 且 ‘ ＺＨＣ１’ 和 ＧＵＯ Ｈꎬ ＴＩＡＮ Ｈꎬ ＺＨＡＮＧ ＳＱꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｇｒｏｗｔｈ ａｎｄ
‘ＺＨＣ２’ 为朝天椒ꎬ材料间的遗传背景差异小有 ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ ｏｆ Ｃａｐｓｉｃｕｍ ｆｒｕｔｅｓｃｅｎｓ ｓｅｅｄｌｉｎｇｓ ｔｏ
关ꎮ ＥＳＴ￣ＳＳＲ 来自基因组转录区ꎬ而转录区的序列 ｗａｔｅｒｌｏｇｇｉｎｇ ｓｔｒｅｓｓ [Ｊ]. Ｎ Ｈｏｒｔｉｃꎬ (２): １－８. [郭豪ꎬ 田
浩ꎬ 张素勤ꎬ 等ꎬ ２０２２. 朝天椒苗期对水涝胁迫的生长及
通常比较保守ꎮ 因此ꎬ一般来讲ꎬＥＳＴ￣ＳＳＲ 所检测
生理响应 [Ｊ]. 北方园艺ꎬ (２): １－８.]
到的多态性要低于基因组 ＳＳＲꎮ 多态性检测能力 ＨＩＬＤＥＢＲＡＮＤＴ ＴＭꎬ ２０１８. Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｖｅｒｓｕｓ ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ:
的大小也与所测试的植物材料有关ꎬ如果所用的 Ｄｉｒｅｃｔｉｏｎｓ ｏｆ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ｄｕｒｉｎｇ Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ
ａｂｉｏｔｉｃ ｓｔｒｅｓｓ ｒｅｓｐｏｎｓｅ [Ｊ]. Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌꎬ ９８: １２１－１３５.
植物材料遗传背景差异较大ꎬ则标记检测的多态
ＨＩＬＤＥＢＲＡＮＤＴ ＴＭꎬ ＮＥＳＩ ＡＮꎬ ＡＲＡＵＪＯ ＷＬꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ
性就高ꎬ反之ꎬ则标记的多态性就会大大降低ꎮ 应 ２０１５. Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｃａｔａｂｏｌｉｓｍ ｉｎ ｐｌａｎｔｓ [ Ｊ]. Ｍｏｌ Ｐｌａｎｔꎬ
