Page 105 - 《广西植物》2023年第11期
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Guihaia Nov. 2023ꎬ 43(11): 2065-2077
DOI: 10.11931/ guihaia.gxzw202206063
吴诗琪ꎬ 潘凤ꎬ 赵财ꎬ 2023. 西南地区野生刺梨的遗传多样性和遗传结构研究 [J]. 广西植物ꎬ 43(11): 2065-2077.
WU SQꎬ PAN Fꎬ ZHAO Cꎬ 2023. Genetic diversity and structure of wild Rosa roxburghii in Southwest China [J]. Guihaiaꎬ
43(11): 2065-2077.
西南地区野生刺梨的遗传多样性和遗传结构研究
吴诗琪ꎬ 潘 凤ꎬ 赵 财 ∗
( 贵州大学 生命科学学院/ 农业生物工程研究院ꎬ 山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室ꎬ 贵阳 550025 )
摘 要: 为了探究西南地区野生刺梨(Rosa roxburghii)的遗传多样性和起源演化ꎬ该研究基于 2 段单拷贝核
基因(GAPDH 和 ncpGS)和 3 段叶绿体基因(atpF-trnH、trnL-trnF 和 trnG-trnS)的拼接序列ꎬ对刺梨 27 个野
生居群共 320 个个体进行 PCR 扩增和测序ꎬ并用相关软件对测序结果进行分析ꎮ 结果表明:(1) 在单拷贝
核基因和叶绿体基因水平上刺梨均表现出较低的遗传多样性( scnDNA: Hd = 0. 469 2ꎬ π = 0. 000 49ꎻ
cpDNA: Hd = 0.653 4ꎬ π = 0.000 65)ꎬ并且不同居群间存在较大差异ꎮ (2) 分子方差分析(AMOVA) 结果均
显示ꎬ遗传变异主要发生在居群内ꎬ表明居群内的变异是野生刺梨遗传变异的主要来源ꎬ居群间存在明显的
遗传分化( cpDNA:F = 0.336 47ꎬG = 0.273ꎬN = 0.308ꎻscnDNA:F = 0.094 87ꎬN = 0.076ꎬG = 0.056)ꎬ
ST ST ST ST ST ST
刺梨的分布不具有明显的谱系地理结构(P>0.05)ꎮ (3)中性检验 Tajima’s D 值均为不显著负值ꎬ符合中性
进化模型ꎮ Fu’s Fs 值均为显著负值ꎬ结合失配分析曲线ꎬ推测刺梨种群在小范围内经历过扩张ꎬ但总体上
维持稳定状态ꎮ (4)根据单倍型多样性得出ꎬ毕节地区的居群遗传多样性水平较高并且拥有丰富的单倍型ꎬ
推测可能为冰期避难所ꎬ因此应对其实施就地保护ꎬ对于拥有特殊性状和特有单倍型的居群也应采取优先
保护措施ꎮ 该文为野生刺梨资源保护和遗传育种提供了一定的参考价值ꎮ
关键词: 刺梨ꎬ 单拷贝核基因ꎬ 叶绿体基因ꎬ 遗传多样性ꎬ 遗传结构
中图分类号: Q948 文献标识码: A 文章编号: 1000 ̄3142(2023)11 ̄2065 ̄13
Genetic diversity and structure of wild Rosa
roxburghii in Southwest China
WU Shiqiꎬ PAN Fengꎬ ZHAO Cai ∗
( Key Laboratory of Plant Resource Conservation and Germplasm Innovation in Mountainous Region (Ministry of Education)ꎬ College
of Life Sciences/ Institute of Agro ̄Bioengineeringꎬ Guizhou Universityꎬ Guiyang 550025ꎬ China )
Abstract: In order to study genetic diversity and the origin of wild Rosa roxburghii in Southwest China and provide some
bases for its utilization and protection. A survey was based on the splicing sequences of two single ̄copy nuclear genes
收稿日期: 2022-12-04
基金项目: 贵州科技支撑计划项目(黔科合支撑[2019] 2451 ̄2 号)ꎻ 贵州省教育厅教育部重点实验室开放课题( 黔教合 KY 字
[2019]033)ꎻ 贵州省生物学国内一流建设学科开放基金( GNYL[2017] 009)ꎻ 贵州省中药材现代产 业 技 术 体 系 建 设 项 目
(GZCYTX ̄03)ꎻ 贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室开放课题基金([2020]2003)ꎮ
第一作者: 吴诗琪(2000-)ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事植物遗传多样性研究ꎬ(E ̄mail)1109792803@ qq.comꎮ
∗
通信作者: 赵财ꎬ博士ꎬ副教授ꎬ主要从事植物多样性及保护研究ꎬ(E ̄mail)zhaocai_11@ 163.comꎮ