Page 167 - 《广西植物》2023年第9期
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９ 期 刘雄盛等: 枫香叶片变色期全长转录组测序及分析 １ ７ １ ５
１. 细胞组分ꎻ ２. 细胞ꎻ ３. 细胞器ꎻ ４. 膜结构ꎻ ５. 细胞器部分ꎻ ６. 高分子配合物ꎻ ７. 细胞膜组分ꎻ ８. 胞外区域部分ꎻ ９. 细胞连接ꎻ
１０. 膜封闭内腔ꎻ １１. 类核ꎻ １２. 胞外区部分ꎻ １３. 病毒体ꎻ １４. 病毒体组分ꎻ １５. 细胞外基质ꎻ １６. 催化活性ꎻ １７. 结合活性ꎻ １８. 转
运活性ꎻ １９. 结构分子活性ꎻ ２０. 电子载体活性ꎻ ２１. 核酸结合转录因子活性ꎻ ２２. 分子转导活性ꎻ ２３. 抗氧化活性ꎻ ２４. 酶调节活
性ꎻ ２５. 受体活性ꎻ ２６. 结合蛋白转录活性ꎻ ２７. 蛋白标签ꎻ ２８. 营养贮存活性ꎻ ２９. 金属伴侣蛋白活性ꎻ ３０. 鸟嘌呤核苷酸交换因
子活性ꎻ ３１. 翻译调节活性ꎻ ３２. 代谢进程ꎻ ３３. 细胞进程ꎻ ３４. 单组织生物过程ꎻ ３５. 应激反应ꎻ ３６. 生物调节ꎻ ３７. 定位ꎻ ３８. 细
胞组织部分ꎻ ３９. 发育进程ꎻ ４０. 多细胞进程ꎻ ４１. 信号传导ꎻ ４２. 有机体进程ꎻ ４３. 繁殖进程ꎻ ４４. 免疫系统进程ꎻ ４５. 生长ꎻ
４６. 繁殖ꎻ ４７. 节律进程ꎻ ４８. 生物相ꎻ ４９. 生物附着ꎻ ５０. 细胞活动ꎻ ５１. 细胞失活ꎮ
１. Ｃｅｌｌ ｐａｒｔꎻ ２. Ｃｅｌｌꎻ ３. Ｏｒｇａｎｅｌｌｅꎻ ４. Ｍｅｍｂｒａｎｅꎻ ５. Ｏｒｇａｎｅｌｌｅ ｐａｒｔꎻ ６. Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｃｏｍｐｌｅｘꎻ ７. Ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐａｒｔꎻ ８. Ｅｘｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ ｒｅｇｉｏｎꎻ ９. Ｃｅｌｌ
ｊｕｎｃｔｉｏｎꎻ １０. Ｍｅｍｂｒａｎｅ￣ｅｎｃｌｏｓｅｄ ｌｕｍｅｎꎻ １１. Ｎｕｃｌｅｏｉｄꎻ １２. Ｅｘｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ ｒｅｇｉｏｎ ｐａｒｔꎻ １３. Ｖｉｒｉｏｎꎻ １４. Ｖｉｒｉｏｎ ｐａｒｔꎻ １５. Ｅｘｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ ｍａｔｒｉｘꎻ
１６. Ｃａｔａｌｙｔｉｃ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ １７. Ｂｉｎｄｉｎｇꎻ １８. Ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ １９. Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｍｏｌｅｃｕｌｅ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２０. Ｅｌｅｃｔｒｏｎ ｃａｒｒｉｅｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２１. Ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ ｂｉｎｄｉｎｇ
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２２. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｔｒａｎｓｄｕｃｅｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２３. Ａｎｔｉｏｘｉｄａｎｔ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２４. Ｅｎｚｙｍｅ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２５. Ｒｅｃｅｐｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ
２６. Ｐｒｏｔｅｉｎ ｂｉｎｄｉｎｇ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２７. Ｐｒｏｔｅｉｎ ｔａｇꎻ ２８. Ｎｕｔｒｉｅｎｔ ｒｅｓｅｒｖｏｉｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２９. Ｍｅｔａｌｌｏｃｈａｐｅｒｏｎｅ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ３０. Ｇｕａｎｙｌ￣ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ
ｅｘｃｈａｎｇｅ ｆａｃｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ３１. Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ３２. Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ３３. Ｃｅｌｌｕｌａｒ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ３４. Ｓｉｎｇｌｅ￣ｏｒｇａｎｉｓｍ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ３５. Ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ
ｓｔｉｍｕｌｕｓꎻ ３６. Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎꎻ ３７. Ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎꎻ ３８. Ｃｅｌｌｕｌａｒ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ ｏｒ ｂｉｏｇｅｎｅｓｉｓꎻ ３９. Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ４０. Ｍｕｌｔｉｃｅｌｌｕｌａｒ
ｏｒｇａｎｉｓｍａｌ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ４１. Ｓｉｇｎａｌｉｎｇꎻ ４２. Ｍｕｌｔｉ￣ｏｒｇａｎｉｓｍ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ４３. Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ４４. Ｉｍｍｕｎｅ ｓｙｓｔｅｍ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ４５. Ｇｒｏｗｔｈꎻ
４６. Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎꎻ ４７. Ｒｈｙｔｈｍｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ４８. Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｈａｓｅꎻ ４９. Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ａｄｈｅｓｉｏｎꎻ ５０. Ｌｏｃｏｍｏｔｉｏｎꎻ ５１. Ｃｅｌｌ ｋｉｌｌｉｎｇ.
图 ５ 转录本 ＧＯ 功能分类统计
Ｆｉｇ. ５ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ ＧＯ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ
例最高ꎬ其次为转录(９.３４％)、转录信号转导机制 磷酸化(２９２)、ＲＮＡ 运转(２６９)、光合生物体中的
(８.８１％)以及复制、重组和生物发生( ８.２９％) 等 碳固定(２３９)、植物激素信号转导(２３５) 等注释的
(图 ６)ꎮ 转录本较多ꎮ
ＫＥＧＧ 数据库中共注释 １０ ６６６ 个转录本ꎬ根 ２.４ 转录因子
据代谢途径分为机体系统(２８９)、代谢(６ ５９６)、遗 使用 ｉＴＡＫ 软件共预测得到转 录 因 子 １ ８５６
传信息处理(２ ９２０)、环境信息处理(３０４)、细胞过 个ꎬ 分 属 １５９ 个 基 因 家 族ꎮ 其 中ꎬ ＲＬＫ￣Ｐｅｌｌｅ ＿
程(５４２)５ 个一级代谢通路和 １８ 个二级代谢通路 ＬＲＫ１０Ｌ￣２ 家族 转 录 因 子 最 多ꎬ 为 ９７ 个ꎬ 其 次 为
以及 １２４ 个三级代谢通路(图 ７)ꎮ 其中ꎬ碳水化合 ＲＬＫ￣Ｐｅｌｌｅ＿ＤＬＳＶꎬ为 ６６ 个ꎮ 图 ８ 显示了转录因子
物 代 谢 ( １ ９１９)、 翻 译 ( １ ７３５)、 全 局 和 概 述 图 数排名前 ２０ 的基因家族ꎮ
(１ ３１８)、氨基酸代谢(１ １６７) 以及折叠、分类、降
３ 讨论与结论
解(１ ０４４) 等二级代谢通路注释的转录本较多ꎮ
三级代谢通路中核糖体(６９３)、碳代谢(６１７)、氨
基酸的生物合成( ４７３)、内质网中的蛋白质加工 近年来ꎬＳＭＲＴ 测序已成为全长转录组研究的
(４３７)、剪接体(３４８)、糖酵解 / 糖异生(２９６)、氧化 最可靠、有效的策略ꎬ 特别是对于没有参考基因组
