Page 162 - 《广西植物》2023年第9期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｓｅｐｔ. ２０２３ꎬ ４３(９): １７１０－１７２０
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２２０３０８６
刘雄盛ꎬ 尹国平ꎬ 肖玉菲ꎬ 等ꎬ ２０２３. 枫香叶片变色期全长转录组测序及分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４３(９): １７１０－１７２０.
ＬＩＵ ＸＳꎬ ＹＩＮ ＧＰꎬ ＸＩＡＯ ＹＦꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｆｒｏｍ Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ ｆｏｒｍｏｓａｎａ
ｌｅａｖｅｓ ｉｎ ｄｉｓｃｏｌｏｒａｔｉｏｎ ｓｔａｇｅ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４３(９): １７１０－１７２０.
枫香叶片变色期全长转录组测序及分析
刘雄盛ꎬ 尹国平ꎬ 肖玉菲ꎬ 蒋燚ꎬ 王仁杰ꎬ 黄荣林ꎬ 姜 英ꎬ 王 勇 ∗
( 广西壮族自治区林业科学研究院ꎬ 广西优良用材林资源培育重点实验室ꎬ 南宁 ５３０００２ )
摘 要: 枫香因其树形优美ꎬ入秋后叶色红艳或橙黄ꎬ极具观赏价值ꎬ是优良的景观生态树种ꎮ 为了解枫香
叶片变色及其次级代谢过程的遗传基础ꎬ该文以枫香 ５ 个叶片变色期叶片混合样品为材料ꎬ利用单分子实
时测序技术(ＰａｃＢｉｏ 平台)对其进行全长转录组测序ꎮ 结果表明:(１)全长转录组测序共获得 ４１.０４ Ｇｂ 的高
质量数据ꎬ从中鉴定出全长非嵌合序列 ５６３ １８０ 条ꎬ通过聚类和去冗余ꎬ获得 ２７ ２６９ 条高质量全长转录本ꎮ
在 ２７ ２６９ 条全长转录本中预测到 ２ ０３５ 条长链非编码 ＲＮＡ( ｌｎｃＲＮＡ)ꎬ并检测出 １４ ８９２ 个简单重复序列
(ＳＳＲ)位点和１ ８５６个转录因子ꎮ ( ２) 基因注释结果表明ꎬＮＲ、ＧＯ、ＣＯＧ、ＫＥＧＧ 等 ８ 个数据库共注释了
２４ ８５７条转录本ꎬＫＥＧＧ 数据库共获得了 １２４ 个条代谢途径ꎬ主要有核糖体、碳代谢、氨基酸生物合成等ꎬ在
类黄酮和叶绿素代谢途径中分别有 ４９ 和 ７１ 个转录本参与ꎮ 上述结果初步揭示了枫香叶片变色期转录组
信息以及功能特性ꎬ为后续研究枫香叶片变色分子机制、色素代谢合成途径和调控、相关功能基因克隆以及
叶色改良提供基础数据ꎮ
关键词: 枫香ꎬ 叶片变色期ꎬ 单分子实时测序技术ꎬ 全长转录组ꎬ 基因功能注释
中图分类号: Ｑ７８１ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２３)０９￣１７１０￣１１
Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｆｒｏｍ
Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｌｅａｖｅｓ ｉｎ ｄｉｓｃｏｌｏｒａｔｉｏｎ ｓｔａｇｅ
ＬＩＵ Ｘｉｏｎｇｓｈｅｎｇꎬ ＹＩＮ Ｇｕｏｐｉｎｇꎬ ＸＩＡＯ Ｙｕｆｅｉꎬ ＪＩＡＮＧ Ｙｉꎬ ＷＡＮＧ Ｒｅｎｊｉｅꎬ
∗
ＨＵＡＮＧ Ｒｏｎｇｌｉｎꎬ ＪＩＡＮＧ Ｙｉｎｇꎬ ＷＡＮＧ Ｙｏｎｇ
( Ｇｕａｎｇｘｉ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｕｐｅｒｉｏｒ Ｔｒｅｅｓ Ｒｅｓｏｕｒｃｅ Ｃｕｌｔｉｖａｔｉｏｎꎬ Ｇｕａｎｇｘｉ Ｚｈｕａｎｇ
Ａｕｔｏｎｏｍｏｕｓ Ｒｅｇｉｏｎ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅꎬ Ｎａｎｎｉｎｇ ５３０００２ꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒ ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｉｓ ａｎ ｅｘｃｅｌｌｅｎｔ ｌａｎｄｓｃａｐｅ ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ ｔｒｅｅ ｓｐｅｃｉｅｓ ｂｅｃａｕｓｅ ｉｔｓ ｂｅａｕｔｉｆｕｌ ｔｒｅｅ ｓｈａｐｅ ａｎｄ
ｒｅｄ ｏｒ ｏｒａｎｇｅ ｌｅａｖｅｓ ｉｎ ａｕｔｕｍｎ. Ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄ ｔｈｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｂａｓｉｓ ｏｆ ｄｉｓｃｏｌｏｒａｔｉｏｎ ａｎｄ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ｏｆ
Ｌ. ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｌｅａｖｅｓꎬ ｔｈｅ ｍｉｘｅｄ ｓａｍｐｌｅｓ ｏｆ Ｌ. ｆｏｒｍｏｓａｎａ ｌｅａｖｅｓ ｉｎ ｆｉｖｅ ｌｅａｆ ｄｉｓｃｏｌｏｒａｔｉｏｎ ｓｔａｇｅｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｆｏｒ ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ
ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｕｓｉｎｇ ｓｉｎｇｌｅ￣ｍｏｌｅｃｕｌｅ ｒｅａｌ￣ｔｉｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ (ＰａｃＢｉｏ ｐｌａｔｆｏｒｍ). Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｗｅｒｅ ａｓ
收稿日期: ２０２２－０６－０４
基金项目: 广西优良用材林资源培育重点实验室自主课题(２０１９￣Ａ￣０３￣０２)ꎻ广西林业科技推广示范项目(桂林科研 [２０２１]２６ 号)ꎮ
第一作者: 刘雄盛(１９８８－)ꎬ硕士ꎬ副研究员ꎬ主要从事林木遗传育种研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)５１７２６１６５４＠ ｑｑ.ｃｏｍꎮ
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通信作者: 王勇ꎬ硕士ꎬ高级工程师ꎬ主要从事森林生态研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)１２０８４４７４＠ ｑｑ.ｃｏｍꎮ
