Page 65 - 《广西植物》2024年第10期
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10 期 黄艳英等: 连作木薯对根际与非根际土壤真菌群落结构演替的影响 1 8 6 7
行定量检测ꎮ 使用试剂盒 NEXTFLEX Rapid DNA ̄ 薯根际土壤的真菌群落多样性逐年减小ꎬ非根际
Seq Kit(Bioo ScientificꎬUSA) 构建文库ꎬ委托上海 土壤真菌群落多样性在连作 2 茬后显著增大ꎮ 此
美吉生物医药科技有限公司利用 Illumina MiSeq 外ꎬ连作 0 茬和 1 茬根际土壤的 Ace 指数和 Chao1
PE300 平台进 行 高 通 量 测 序ꎮ 原 始 数 据 上 传 至 指数均大于非根际土壤ꎬ但未达显著水平ꎬ说明连
NCBI SRA 数据库( 项目登录号为 PRJNA999067ꎬ 作两年ꎬ 土 壤 真 菌 群 落 开 始 受 木 薯 根 系 分 泌 物
样品序列号为 SRR25439107-SRR25439124)ꎮ 影响ꎮ
分 别 利 用 Trimmomatic ( version 0. 32 ) 和
FLASH(version 1.2.11) 进行原始序列的质控和拼 表 1 各土壤样本 Sobs 指数方差分析
接ꎬ于 97%相似度下使用 UPARSE Version 7.1 对 Table 1 Variance analysis of Sobs indices for all samples
序列进行操作分类单元(operational taxonomic unitꎬ 因子 F 值 P 值
OTU)聚类ꎮ 基于 Silva 数据库ꎬ于 70% 比对阈值 Factor F value P value
下ꎬ在 RDP classifier( http: / / rdp.cme.msu.edu / ) 上 土壤类型 Soil type (S) 1.596 0.225
对筛选后的非嵌合序列进行物种分类注释ꎮ 真菌 年份 Year (Y) 2.193 0.146
α 多样性及 OTU 丰富度分别使用 Mothur ( version 土壤类型 × 年份 S × Y 3.403 0.038∗
v. 1. 30. 2) 和 Past 3. 0 软 件 ( http: / / fold. uio. no / 注: ∗表示差异显著(P<0.05)ꎮ
Note: ∗ indicates significant differences (P<0.05).
ohammer / past)进行计算ꎮ 使用 R( version 3.3.1)
vegan 包 进 行 主 成 分 分 析 ( principal component
2.1.2 对 β 多样性的影响 基于 OTU 水平对连作木
analysisꎬPCA)、置换多因素方差分析(per ̄mutational
multivariate analysis of varianceꎬ PERMANOVA)、 相 薯非根际与根际土壤进行主成分分析( PCA)ꎮ 由
图 1 可知ꎬ 在非根际与根际土壤中ꎬ 第一主成分
关性分析和冗余分析( redundancy analysisꎬRDA)ꎮ
使用 stats 包对真菌在属水平上的组间差异显著性 (PC1)均把 2021 年与 2019 年、2020 年的土壤样本
划分为 2 个不同群体ꎬ分别解释总方差的 22.32%和
进行检验和制图ꎮ
1.4 统计分析 21.50%ꎬ说明连作 2 茬的土壤真菌群落结构及组成
与连作 0 茬和 1 茬存在较大差异ꎮ 基于真菌菌落半
分别 使 用 Microsoft Excel 2010 和 IBM SPSS
度量距离(Bray ̄Curtis) 和未加权的 Unifrac 距离ꎬ使
Statistics 25.0 软件进行整理和统计分析ꎮ
用置换多因素方差分析(PERMANOVA) 方法ꎬ分别
2 结果与分析 计算单个因素对真菌群落变化的贡献ꎬ结果表明连
作年限是影响连作木薯土壤真菌群落分类和系统
2.1 连作年限对木薯根际和非根际土壤真菌群落 发育 β 多样性差异的主要因素ꎬ土壤类型对 β 多样
多样性的影响 性影响不显著(表 3)ꎮ
2.1.1 对 α 多样性的影响 对连作三年的根际与 2.2 连作对木薯根际和非根际土壤真菌群落结构
非根 际 土 壤 样 品 进 行 18S 测 序 分 析ꎬ 共 获 得 的影响
713 640条有效序列ꎮ 其中ꎬ根际土壤共有 395 429 2.2.1 对真菌群落组成的影响 由图 2 和图 3 可
条优质序列ꎬ平均长度为 381.210 bpꎻ非根际土壤 知ꎬ不同连作年限木薯根际和非根际土壤的真菌
共有402 223条优质序列ꎬ平均长度为 381.239 bpꎮ 门水平和纲水平群落结构组成基本相同ꎮ 所有土
对各土壤样本 OTU 丰富度进行方差分析( 表 1)ꎬ 壤 样 品 中 占 主 导 地 位 的 均 是 子 囊 菌 门
结果表明连作年限与土壤类型互作对真菌群落 (Ascomycota)、担子菌门( Basidiomycota)、毛霉门
Sobs 指数存在显著影响( P<0.05ꎬ下同)ꎮ 各处理 ( Mucoromycota)ꎬ 分 别 占 比 77. 95% ~ 89. 43%、
的 OTU 文库覆盖率均大于 99.00%(表 2)ꎬ2020 年 1.87% ~ 8.37%、1.55% ~ 5.15%ꎬ占总相对丰度的
的根际土壤 Sobs 指数显著高于非根际土壤ꎮ 非根 89.95% ~ 94.33%ꎻ三年试验期内ꎬ根际土壤的子囊
际土壤 2021 年的 Shannon 指数显著大于 2020 年ꎬ 菌门相对丰度逐年下降ꎬ担子菌门和毛霉门逐年
而 Simpson 指数逐年下降ꎻ根际土壤的 Shannon 指 上升( 图 2)ꎮ 在纲分类水平ꎬ土壤真菌的主要优
数逐年下降ꎬ而 Simpson 指数逐年上升ꎮ 这说明木 势菌落有粪壳菌纲( Sordariomycetes) 、散囊菌纲