Page 114 - 《广西植物》2024年第12期
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             A. SmPAD4 蛋白磷酸化位点ꎻ B. SmPAD4 蛋白二级结构预测  蓝色. α ̄螺旋ꎻ 红色. 延伸链ꎻ 绿色. β ̄折叠ꎻ 紫色. 无规卷曲ꎻ
             C. SmPAD4 蛋白三级结构预测ꎮ
             A. Phosphorylation sites of SmPAD4 proteinꎻ B. SmPAD4 protein secondary structure prediction   Blue. α ̄helixꎻ Red. Extended strandꎻ
             Green. β ̄sheetꎻ Purple. Random coilꎻ C. SmPAD4 protein tertiary structure prediction.
                                           图 4  SmPAD4 蛋白普通生物信息学分析
                                     Fig. 4  General bioinformatics analysis of SmPAD4 protein


            控ꎮ 通过结构域预测ꎬ发现 SmPAD4 基因 N 端有 α /                   控植物的生物及非生物胁迫ꎮ
            β 水解酶结构域ꎬ在菊科植物的进化过程中具有高                                在植物中ꎬ大多数含 TATA ̄box 的启动子主要
            度的保守性ꎬC 端包含着 EP 结构域ꎬ可以形成稳定                         参与组织特异性表达和胁迫反应ꎬ并且已知 AP2 /
            的异二聚化结构ꎮ PAD4 与同属于水解酶家族的                           ERF、bZIP、NAC、MYB 和 WRKY 是常见的参与病
            EDS1 的 N 端都有与酰基水解酶同源的结构域ꎬ使                         原体 防 御 的 启 动 子 元 件 ( Singh et al.ꎬ 2002ꎻ
            两者可为互作蛋白来响应逆境胁迫(Wiermer et al.ꎬ                    Gutterson & Reuberꎬ 2004ꎻ Molina & Grotewoldꎬ
            2005)ꎮ 种子植物中ꎬPAD4 和 EDS1 因具有同源结                    2005ꎻCiváň & Švecꎬ 2009ꎻNg et al.ꎬ 2018)ꎮ 本研
            构域特征能够形成异源二聚体ꎬ从而介导植物的细                             究发现ꎬSmPAD4 启动子区域除大量的 TATA ̄box
            胞死亡和免疫反应(Lapin et al.ꎬ 2019ꎬ 2020)ꎮ 在              和 CTAA ̄box 启动子顺式元件外ꎬ还包含光响应元
            被子植物的研究中ꎬ沉默 PAD4 基因 N 端的稳定复                        件(Box 4 和 GT1 ̄motif)、低氧应答元件( ARE)、茉
            合物并进行共表达ꎬ结果表明 PAD4 响应干旱、脱落                         莉 酸 甲 酯 应 答 元 件 ( CGTCA ̄motif 和 TGACG ̄
            酸以及生物胁迫( Baggs et al.ꎬ 2020)ꎮ 在拟南芥                 motif)、干旱 ( MBS) 和 生 长 素 应 答 元 件 ( AuxRR ̄
            中ꎬ通过表达 PAD4 基因的 N 端脂肪酶样结构域                         core)以及 WRKY 转录因子结合位点(W ̄box) 等顺
            (LLD)ꎬ不表达其 C 端 EP 结构域ꎬ发现 PAD4 可以                   式作用元件ꎮ 在雪莲 SikCDPK1 基因和玉米 GRAS
            作为二分蛋白发挥作用ꎬ说明 LLD 和 EP 结构域在                        基因家族启动子的研究中均包含了光信号、低氧、
            植物防御中发挥独特且可分离的作用( Dongus et                        干旱、生长素和 MeJA 相关的顺式元件从而参与植
            al.ꎬ 2020)ꎮ SmPAD4 独特的结构域使其可作为二                    物的生长发育和调控生物与非生物胁迫响应( 史
            分蛋白来响应水解代谢和免疫信号ꎬ进一步参与调                             光珍等ꎬ2022ꎻ吴占清等ꎬ2024)ꎬ与本研究结果一
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