Page 79 - 《广西植物》2024年第7期
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7 期 曾婉俐等: 烟草香气相关基因 CRISPR / Cas9 编辑突变体库的构建 1 2 7 9
target editing of transgenic offspring using the tobacco variety ‘Honghua Dajinyuan’ as experimental material in this
study. The results were as follows: (1) After co ̄transformation of 100 sgRNAs mediated by Agrobacterium tumefaciensꎬ
77 of them were detected in 172 positive transformation strainsꎬ with a co ̄transformation rate of 77%. (2) Among 77
transgenic offspring carrying sgRNAꎬ 69 sgRNAs edited the target genesꎬ with an editing rate of 89.6%. (3) Sequencing
detection revealed that only one sgRNA produced off ̄target editing at a non ̄target siteꎬ indicating a very low probability
of off ̄target editing of CRISPR/ Cas9 in tobacco. In summaryꎬ it is feasible to construct a mutant library by the co ̄
transformation of a CRISPR/ Cas9 vector library to edit a large number of candidate target genes in tobacco. This method
has the characteristics of high co ̄transformation rateꎬ high editing rateꎬ and low probability of off ̄target editing.
Key words: tobaccoꎬ CRISPR/ Cas9ꎬ tabacco aromaꎬ on ̄target editingꎬ off ̄target editing
CRISPR / Cas9 基因编辑是一种在基因组水平 应 用 ( Schachtsiek & Stehleꎬ 2019ꎻ Zhang et al.ꎬ
上对 DNA 序列进行定点改造的遗 传 操 作 技 术ꎮ 2023)ꎬ预示着该技术在未来烟草育种中蕴藏着巨
CRISPR 基因编辑系统由 Cas9 核酸酶和引导 RNA 大的潜力ꎮ
(single guide RNAꎬ sgRNA) 组 成ꎮ sgRNA 的 一 段 烟草香味是烟叶及卷烟感官质量的重要指标
( ~ 20 bp)与靶基因互补的 DNA 序列可以特异性 之一ꎮ 烟草的香气前体物主要有质体色素、西柏烷
地识别靶 DNAꎬ而 Cas9 核酸酶对靶 DNA 进行切 和赖百当类菇醇、酚类化合物、氨基酸和还原糖、脂
割ꎬ造成双链靶 DNA 的断裂ꎬ诱发内源性 DNA 的 类、生物碱六大类(汪耀富等ꎬ2006)ꎮ 因其内在香
非同源末端修复机制( Jinek et al.ꎬ 2012)ꎮ DNA 气前体合成相关基因的表达不同ꎬ不同烟草品种的
修复过程会引起 DNA 核苷酸的缺失或增加等错 香气前体种类及含量不同(吕婧等ꎬ2014)ꎬ换言之ꎬ
配ꎬ导致基因移码突变ꎬ实现基因敲除ꎮ CRISPR / 烟草香气前体种类和含量很大程度上由烟草本身
Cas9 基因编辑系统也可以对目的基因进行特定修 的遗传因素决定ꎮ 随着烟草基因组测序的完成ꎬ次
饰(如点突变和基因插入)ꎮ 例如ꎬ在 CRISPR 基 生代谢产物相关合成酶的基因注释也日趋完善ꎮ
因敲除构建策略的基础上ꎬ添加计划插入修饰的 因此ꎬ从基因层面挖掘控制烟草香气前体物的关键
DNA 片段即可对特定基因插入和替换遗传修饰ꎮ 基因ꎬ通过遗传操作改变相关基因的表达水平可以
CRISPR / Cas9 基因编辑系统因其低成本、构 实现定向培育特定香味的烟草品种ꎮ 利用 CRISPR ̄
建简单和高效等优点ꎬ已经在人类、动物和植物等 Cas9 对烟叶香味基因进行高通量靶向突变ꎬ将为优
生物体中被广泛利用ꎬ目前已成为基因功能研究 异性状新种质的创建、重要功能基因的批量挖掘以
和基因定向修饰的一个有效工具( Knott & Doudna 及烟草分子设计育种奠定基础ꎮ
2018ꎻ Chen et al.ꎬ 2019)ꎮ 在植物中的应用表明ꎬ 传统烟草育种工作主要靠多亲本多组合ꎬ也
CRISPR / Cas9 系统不仅可高效诱导产生 DNA 突 就是将不同优良性状的烟草种质资源进行遗传整
变ꎬ而且诱导的突变可稳定遗传ꎮ 该技术可以在 合ꎬ构建优质烟草新品种ꎮ 但是ꎬ这种传统的杂交
基因组水平上对 DNA 序列进行定点改造以创制 育种方式不仅耗费大量人力及财力ꎬ而且要耗费
优异种质资源ꎮ 例如:Li 等(2023) 利用 CRISPR / 多年时间ꎮ 一些优异性状因联锁累赘而无法整合
Cas9 基因编辑技术将普通烟草中 N’ 基因的抗性 在同一品种里ꎬ也在一定程度上限制了优异品种
核心区域精准替换为野生烟中 N’ alata 基因的对 的创制ꎮ CRISPR / Cas9 基因编辑技术不仅可以不
应区域ꎬ使得栽培烟草获得了 TMV ̄U1 抗性ꎻQin 依赖于遗传杂交对紧密连锁的基因进行同时编
等(2021)利用 CRISPR 技术对 NIC 基因进行编辑 辑ꎬ还可以突破传统杂交育种无法将连锁优异位
产生了尼古丁含量极低的烟草新种质ꎻCRISPR / 点进行整合的限制ꎬ因此利用 CRISPR / Cas9 基因
Cas9 基因编辑技术还可用于水稻和番茄等作物的 组编辑技术有望加速烟草香味品质改良ꎮ
快速驯化( Lemmon et al.ꎬ 2018ꎻ Li et al.ꎬ 2018ꎻ 尽管基因编辑技术已被应用于构建水稻、玉
Yu et al.ꎬ 2021)ꎬ为加快新品种的创制奠定了基 米等突变体库ꎬ但尚未应用于烟草基因突变体库
础ꎮ CRISPR / Cas9 基因编辑技术在烟草中的成功 的构建ꎮ 本研究以烟草栽培品种‘红花大金元’ 为