Page 105 - 《广西植物》2025年第1期

１ 期 单筱涵等: 异质生境下山东银莲花的转录组分析及 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 分子标记开发 １ ０ １

２.３ ＳＳＲ 位点分析与引物开发
２.３.１ ＳＳＲ 位点总体特点 对山东银莲花转录组的
５３ ５３６ 条 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 序列进行搜索ꎬ共检出 ６ ００６ 条
Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 序列中含有 ７ １４６ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ平均分布

距离为 ８.１ ｋｂꎬＳＳＲ 长度在 １０ ~ ２２５ ｂｐ 之间ꎬＳＳＲ
出现频率( ＝ ＳＳＲ 个数 / 总 Ｕｎｉｇｅｎｅ 数) 为 １３.３５％ꎬ
ＳＳＲ 发生频率( ＝ 含 ＳＳＲ 的 Ｕｎｉｇｅｎｅ 数 / 总 Ｕｎｉｇｅｎｅ
数)为 １１. ２２％ꎮ 山 东 银 莲 花 含 有 ２ 个 及 以 上 的

ＳＳＲ 位点的序列有 ９０７ 条ꎬ占全部序列的 １.６８％ꎬ
含有复杂重复类型的 ＳＳＲ 位点的序列有 ４２０ 条ꎬ
占全部序列的 ０.７８％ꎮ 山东银莲花 ＳＳＲ 类型较为
丰富ꎬ共计 １０６ 种重复基序( 表 ４)ꎬ优势重复基序
为单核苷酸重复(３ ２４８ꎬ４５.５９％)ꎬ其次分别为三
核 苷 酸 重 复 ( ２ ０４１ꎬ ２８. ５６％)、 二 核 苷 酸 重 复
(１ ６４５ꎬ２３.０２％)、六核苷酸重复(１０１ꎬ１.４１％)、四
核苷 酸 重 复 ( ８１ꎬ １. １３％)、 五 核 苷 酸 重 复 ( ２０ꎬ
０.２８％)(图 ５)ꎮ
２.３.２ ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物的开发与筛选 利用 １％琼脂
１. 脱落酸代谢过程ꎻ ２. 香芹醇脱氢酶活性ꎻ ３. 胆碱激酶活
糖凝胶电泳对从山东银莲花转录组数据中挑选的
性ꎻ ４. 异哌啶醇脱氢酶活性ꎻ ５. 芳基醇脱氢酶( ＮＡＤＰ ＋)
１００ 对 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物进行检验ꎬ可得 ６８ 对有效扩
活性ꎻ ６. 硫脂生物合成过程ꎻ ７. 薄荷醇生物合成过程ꎻ
８. 核糖体的结构成分ꎻ ９. 细胞质翻译ꎻ １０. 细胞质大核糖 增引物ꎮ 为探究 ６８ 对 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物的多态性ꎬ采
体亚基ꎻ １１. 细胞质小核糖体亚基ꎻ １２. 翻译ꎻ １３. 对几丁 用 ８％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检验来源于烟
质的反应ꎻ １４. 核糖体ꎻ １５. 光合作用ꎬ光收集ꎻ １６. 核糖体
台昆 嵛 山 泰 礴 顶 ( ＹＤ１ )、 烟 台 昆 嵛 山 老 铁 山
生物发生ꎻ １７. 核糖体大亚基组装ꎻ １８. 细胞质翻译延伸ꎻ
(ＹＬ１)、青岛崂山崂顶景区丹炉峰附近( ＱＤ１)、青
１９. 光系统ꎻ ２０. ＤＮＡ 结合转录因子活性ꎻ ２１. 叶绿素结合ꎻ
２２. 光系统ꎻ ２３. 蛋白质标签ꎻ ２４. 序列特异性 ＤＮＡ 结合ꎻ 岛崂山滑溜口( Ｑ Ｌ１) 的山东银莲花 ＤＮＡ 扩增结
２５. 细胞外区域ꎻ ２６. (Ｓ)￣去甲乌药碱合成酶活性ꎻ ２７. 柠 果ꎬ６８ 对 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物均能在上述材料中扩增得
檬酸裂解酶复合物ꎻ ２８. 吞噬泡ꎻ ２９. 质体球ꎻ ３０. Ｓｅｔ３ 复
到清晰条带ꎬ其中有 １１ 对 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物具有多态
合物ꎮ
性(表 ５)ꎬ共扩增 ２４ 个多态性片段ꎮ 以上结果表
１. Ａｂｓｃｉｓｉｃ ａｃｉｄ ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ２. Ｃａｒｖｅｏｌ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ
明ꎬ基于山东银莲花转录组数据开发 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引
ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ３. Ｃｈｏｌｉｎｅ ｋｉｎａｓｅ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ４. Ｉｓｏｐｉｐｅｒｉｔｅｎｏｌ
ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ５. Ａｒｙｌ￣ａｌｃｏｈｏｌ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ(ＮＡＤＰ＋) 物是一种经济、可行的方法ꎬ可通过简单的 ＰＣＲ 扩
ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ６. Ｓｕｌｆｏｌｉｐｉｄ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ７. Ｍｅｎｔｈｏｌ
增效果验证得出 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引物的稳定性、可重复
ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ８. Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｃｏｎｓｔｉｔｕｅｎｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍｅꎻ ９.
性和多态性ꎮ
Ｃｙｔｏｐｌａｓｍｉｃ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎꎻ １０. Ｃｙｔｏｓｏｌｉｃ ｌａｒｇｅ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｓｕｂｕｎｉｔꎻ
１１. Ｃｙｔｏｓｏｌｉｃ ｓｍａｌｌ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｓｕｂｕｎｉｔꎻ １２. Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎꎻ １３.
３ 讨论与结论
Ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ｃｈｉｔｉｎꎻ １４. Ｒｉｂｏｓｏｍｅꎻ １５. Ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓꎬ ｌｉｇｈｔ
ｈａｒｖｅｓｔｉｎｇꎻ １６. Ｒｉｂｏｓｏｍｅ ｂｉｏｇｅｎｅｓｉｓꎻ １７. Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
ａｓｓｅｍｂｌｙꎻ １８. Ｃｙｔｏｐｌａｓｍｉｃ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎꎻ １９.
３.１ 异质生境中山东银莲花的适应机制分析
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍꎻ ２０. ＤＮＡ￣ｂｉｎｄｉｎｇ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ
高通量测序技术能全面快速地获得植物的转
２１. Ｃｈｌｏｒｏｐｈｙｌｌ ｂｉｎｄｉｎｇꎻ ２２. Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍꎻ ２３. Ｐｒｏｔｅｉｎ ｔａｇꎻ
２４. Ｓｅｑｕｅｎｃｅ￣ｓｐｅｃｉｆｉｃ ＤＮＡ ｂｉｎｄｉｎｇꎻ ２５. Ｅｘｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ ｒｅｇｉｏｎꎻ 录本序列信息ꎬ为植物基因发掘和次生代谢物调控
２６. ( Ｓ )￣ｎｏｒｃｏｃｌａｕｒｉｎｅ ｓｙｎｔｈａｓｅ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ２７. Ｃｉｔｒａｔｅ ｌｙａｓｅ
等研究提供了巨大便利(Ｌｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１０)ꎮ 本研究
ｃｏｍｐｌｅｘꎻ ２８. Ｐｈａｇｏｃｙｔｉｃ ｖｅｓｉｃｌｅꎻ ２９. Ｐｌａｓｔｏｇｌｏｂｕｌｅꎻ ３０. Ｓｅｔ３
利用高通量测序技术对异质生境中的山东银莲花
ｃｏｍｐｌｅｘ.
进行转录组测序ꎬ通过对其差异表达基因进行富集
图 ３ 差异表达基因 ＧＯ 富集 Ｔｏｐ３０ 气泡图
分析ꎬ发现山东银莲花适应两种异质生境的机制主
Ｆｉｇ. ３ Ｂｕｂｂｌｅ ｄｉａｇｒａｍ ｏｆ ＧＯ ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ ｏｆ
要表现在光合作用和类黄酮生物合成两方面ꎮ 光合
ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｔｏｐ３０