Page 26 - 《广西植物》2025年第1期
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２ ２ 广 西 植 物 ４５ 卷
表 ４ 中甸刺玫的密码子－反密码子识别模式及密码子偏好
Ｔａｂｌｅ ４ Ｃｏｎｄｏｎ￣ａｎｔｉｃｏｄｏｎ ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ ｐａｔｔｅｒｎｓ ａｎｄ ｃｏｄｏｎ ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｏｆ Ｒｏｓａ ｐｒａｅｌｕｃｅｎｓ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ
氨基酸 密码子 数量 相对同义密码子 氨基酸 密码子 数量 相对同义密码子
Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｃｏｕｎｔ ＲＳＣＵ Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｃｏｕｎｔ ＲＳＣＵ
ＵＵＵ(Ｆ) １ ０９２ １.２１ ＵＣＵ(Ｓ) ５０４ １.２６
苯丙氨酸 Ｐｈｅ
ＵＵＣ(Ｆ) ７０６ ０.７９ ＵＣＣ(Ｓ) ４２２ １.０６
丝氨酸 Ｓｅｒ
ＵＵＡ(Ｌ) ５９７ １.３ ＵＣＡ(Ｓ) ４７７ １.１９
ＵＵＧ(Ｌ) ６１９ １.３４ ＵＣＧ(Ｓ) ３４２ ０.８６
ＣＵＵ(Ｌ) ５５６ １.２１ ＣＣＵ(Ｐ) ２６２ １.１
亮氨酸 Ｌｅｕ
ＣＵＣ(Ｌ) ３１９ ０.６９ ＣＣＣ(Ｐ) ２０７ ０.８７
脯氨酸 Ｐｒｏ
ＣＵＡ(Ｌ) ３９３ ０.８５ ＣＣＡ(Ｐ) ２７２ １.１４
ＣＵＧ(Ｌ) ２８１ ０.６１ ＣＣＧ(Ｐ) ２１１ ０.８９
ＡＵＵ(Ｉ) ９２５ １.３５ ＡＣＵ(Ｔ) ３５２ １.１４
异亮氨酸 Ｉｌｅ ＡＵＣ(Ｉ) ５１７ ０.７５ ＡＣＣ(Ｔ) ２８０ ０.９１
苏氨酸 Ｔｈｒ
ＡＵＡ(Ｉ) ６１５ ０.９ ＡＣＡ(Ｔ) ３７５ １.２２
甲硫氨酸 Ｍｅｔ ＡＵＧ(Ｍ) ５７１ １ ＡＣＧ(Ｔ) ２２３ ０.７３
ＧＵＵ(Ｖ) ４２１ １.３５ ＧＣＵ(Ａ) ２３９ １.２４
ＧＵＣ(Ｖ) ２０８ ０.６７ ＧＣＣ(Ａ) １７６ ０.９１
缬氨酸 Ｖａｌ
丙氨酸 Ａｌａ
ＧＵＡ(Ｖ) ３７２ １.２ ＧＣＡ(Ａ) ２２３ １.１６
ＧＵＧ(Ｖ) ２４４ ０.７８ ＧＣＧ(Ａ) １３４ ０.６９
ＵＡＵ(Ｙ) ８００ １.３３ ＵＧＵ(Ｃ) ３８２ １.１３
酪氨酸 Ｔｙｒ 半胱氨酸 Ｃｙｓ
ＵＡＣ(Ｙ) ４０５ ０.６７ ＵＧＣ(Ｃ) ２９２ ０.８７
ＵＡＡ(∗) ４８８ １.０７ 终止子 Ｓｔｏｐ ＵＧＡ(∗) ４４５ ０.９７
终止子 Ｓｔｏｐ
ＵＡＧ(∗) ４３９ ０.９６ 色氨酸 Ｔｒｐ ＵＧＧ(Ｗ) ５４２ １
ＣＡＵ(Ｈ) ３５２ １.３３ ＣＧＵ(Ｒ) ２１８ ０.７２
组氨酸 Ｈｉｓ
ＣＡＣ(Ｈ) １７８ ０.６７ ＣＧＣ(Ｒ) １４１ ０.４６
精氨酸
Ａｒｇ
ＣＡＡ(Ｑ) ５４７ １.３２ ＣＧＡ(Ｒ) ３０４ １
谷氨酰胺 Ｇｌｎ
ＣＡＧ(Ｑ) ２８３ ０.６８ ＣＧＧ(Ｒ) ２６１ ０.８６
ＡＡＵ(Ｎ) ９５７ １.３４ 丝氨酸 ＡＧＵ(Ｓ) ３６２ ０.９１
天冬酰胺 Ａｓｎ
ＡＡＣ(Ｎ) ４７０ ０.６６ Ｓｅｒ ＡＧＣ(Ｓ) ２９２ ０.７３
ＡＡＡ(Ｋ) １ ０１５ １.２６ ＡＧＡ(Ｒ) ５２６ １.７３
精氨酸
离氨酸 Ｌｙｓ
Ａｒｇ
ＡＡＧ(Ｋ) ５９０ ０.７４ ＡＧＧ(Ｒ) ３７０ １.２２
ＧＡＵ(Ｄ) ６２８ １.４６ ＧＧＵ(Ｇ) ３５０ ０.９８
天冬氨酸 Ａｓｐ
ＧＡＣ(Ｄ) ２３５ ０.５４ ＧＧＣ(Ｇ) ２２４ ０.６３
甘氨酸 Ｇｌｙ
谷氨酸 ＧＡＡ(Ｅ) ６９１ １.３ ＧＧＡ(Ｇ) ４５８ １.２８
Ｇｌｕ
ＧＡＧ(Ｅ) ３７５ ０.７ ＧＧＧ(Ｇ) ４００ １.１２
列位于 ＬＳＣ 区和 ＩＲ 区ꎬ还有 ９ 个重复序列在不同 ２.５ 中甸刺玫叶绿体基因组的简单重复序列
的区域开始ꎬ如第 １ 号重复的 ２ 个序列分别开始于 ＭＩＳＡ 软件在中甸刺玫的叶绿体基因组中共
ＩＲｂ 区和 ＳＳＣ 区ꎮ 找到 ７３ 个简单重复序列(ＳＳＲｓ)ꎬ其中单核苷酸 ＳＳＲｓ
