Page 27 - 《广西植物》2025年第1期
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１ 期 王其刚等: 中甸刺玫的叶绿体基因组特征及种内变异 ２ ３
表 ５ 中甸刺玫叶绿体基因组的重复序列
Ｔａｂｌｅ ５ Ｒｅｐｅａｔ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｉｎ Ｒｏｓａ ｐｒａｅｌｕｃｅｎｓ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ
重复第 １ 个 重复长度 重复第 ２ 个 失配碱基
编号 重复类型 所在具体位置 所在区域
开始处 Ｓｉｚｅ 开始处 Ｍｉｓｍａｔｃｈ
Ｃｏｄｅ Ｒｅｐｅａｔ ｔｙｐｅ Ｌｏｃａｔｉｏｎ Ｒｅｇｉｏｎ
Ｒｅｐｅａｔ ｓｔａｒｔ １ (ｂｐ) Ｒｅｐｅａｔ ｓｔａｒｔ ２ (ｂｐ)
１ １００７７０ Ｆ ４０ １２２８１８ ０ ＩＧＳꎻ ｎｄｈＡ ＩＲｂꎬ ＳＳＣ
２ ４４９９７ Ｆ ３９ １００７７２ ０ ｙｃｆ３ꎻ ＩＧＳ ＬＳＣꎬ ＩＲｂ
３ ４４９９７ Ｆ ３８ １２２８２０ ０ ｙｃｆ３ꎻ ｎｄｈＡ ＬＳＣꎬ ＳＳＣ
４ ５９２５４ Ｆ ３４ ５９２８５ ０ ＩＧＳ ＬＳＣ
５ １２３０１０ Ｒ ３７ １２３０２３ －３ ｎｄｈＡ ＳＳＣ
６ １０９７３９ Ｆ ３２ １０９７７１ －２ ＩＧＳ ＩＲｂ
７ １３３６９６ Ｆ ３２ １３３７２８ －２ ＩＧＳ ＩＲａ
８ ６７４３６ Ｆ ２５ ６７４６０ ０ ＩＧＳ ＬＳＣ
９ ９８２２ Ｆ ２７ ３７７１４ －１ ｔｒｎＧ￣ＧＣＣꎬ ｔｒｎＧ￣ＵＣＣ ＬＳＣ
１０ ８３８０ Ｆ ２９ ３６６４０ －２ ｔｒｎＳ￣ＧＣＵꎬ ｔｒｎＳ￣ＵＧＡ ＬＳＣꎬ ＩＲｂ
１１ ９１１０８ Ｆ ２９ ９１１２９ －２ ｙｃｆ２ ＩＲｂ
１２ １５２３４１ Ｆ ２９ １５２３６２ －２ ｙｃｆ２ ＩＲａ
１３ ５１０３９ Ｆ ２２ ５１０６０ ０ ＩＧＳ ＬＳＣ
１４ ４３１９６ Ｆ ２５ １４７７４３ －１ ＩＧＳ ＬＳＣꎬ ＩＲａ
１５ ５８６１０ Ｆ ２５ ５８６３５ －１ ｒｂｃＬꎻ ＩＧＳ ＬＳＣ
１６ ３９９６２ Ｆ ３０ ４２１８６ －３ ｐｓａＢꎻ ｐｓａＡ ＬＳＣ
１７ １０４９９ Ｆ ２１ １０５２０ ０ ＩＧＳ ＬＳＣ
１８ ８７３３ Ｆ ２９ ６５１７２ －３ ＩＧＳ ＬＳＣ
１９ ８３６６１ Ｆ ２９ １２２８０８ －３ ｒｐｌ１６ꎬ ｎｄｈＡ ＬＳＣꎬ ＳＳＣ
２０ １０６２３ Ｆ ２０ １０６４７ ０ ＩＧＳ ＬＳＣ
２１ １３５７０ Ｆ ２０ ９０１０４ ０ ＩＧＳꎬｙｃｆ２ ＬＳＣꎬ ＩＲｂ
２２ ２８５８２ Ｆ ２０ ２８６０２ ０ ＩＧＳ ＬＳＣ
２３ ３３０４２ Ｒ ２０ ８６３２７ ０ ＩＧＳ ＬＳＣꎬ ＩＲｂ
２４ ６７５１１ Ｆ ２０ ６７５３０ ０ ＩＧＳ ＬＳＣ
２５ １２０１４４ Ｆ ２０ １２０１６４ ０ ＩＧＳ ＳＳＣ
２６ １３３７０５ Ｆ ２３ １３３７３７ －１ ＩＧＳ ＩＲａ
２７ ８６６９ Ｆ ２８ ３１２１４ －３ ＩＧＳ ＬＳＣ
２８ １２２２３ Ｆ ２８ ７２４２０ －３ ＩＧＳꎬｃｌｐＰ ＬＳＣ
２９ ８３６６７ Ｆ ２８ １２２８１４ －３ ｒｐｌ１６ꎬ ｎｄｈＡ ＬＳＣꎬ ＳＳＣ
３０ ７５９８ Ｒ ２５ ６１１８６ －２ ＩＧＳ ＬＳＣ
３１ ８３６７０ Ｆ ２５ １００７６９ －２ ｒｐｌ１６ꎬ ＩＧＳ ＩＲｂ
３２ ３７５８２ Ｆ ２２ ３７６０４ －１ ＩＧＳ ＬＳＣ
３３ ４３７６４ Ｆ ２２ ７３５３０ －１ ＩＧＳꎬｃｌｐＰ ＬＳＣ
３４ ４５６６２ Ｆ ２２ １４２４９９ －１ ｙｃｆ３ꎻ ＩＧＳ ＩＲａ
３５ １０９７４９ Ｆ ２２ １０９７８１ －１ ＩＧＳ ＩＲｂ
３６ ５２０３ Ｆ ２４ １２７７２６ －２ ＩＧＳꎻｙｃｆ１ ＳＳＣ
注: Ｆ 表示正向重复ꎻＲ 表示反向重复ꎮ
Ｎｏｔｅ: Ｆ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｆｏｒｗａｒｄ ｒｅｐｅａｔꎻ Ｒ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｒｅｖｅｒｓｅ ｒｅｐｅａｔ.
