Page 124 - 《广西植物》2025年第12期

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图 ９ ＰＲ２￣ｐｌｏｔ 绘图分析
Ｆｉｇ. ９ ＰＲ２￣ｐｌｏｔ ｍａｐｐｉｎｇ ａｎａｌｙｓｉｓ

中共检测出 ５０ 条长重复序列和 ７９ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ ｐｓｂＥ、ｃｌｐＰ 和 ｙｃｆ１ 亦具有 ４ 个高突变热点可开发为
其中以单核苷酸重复 Ａ / Ｔ 为主要类型ꎬ此结果与 潜在的 ＤＮＡ 条形码ꎮ
桑寄生科植物叶绿体基因组(周建国ꎬ２０１９)相似ꎮ 密码子使用偏好性是指生物在长期进化演变
植物叶绿体基因组中的 ＩＲ 区域作为最为保守 过程中逐渐形成的偏好使用某种或某些密码子的
的区域ꎬ其边界区序列的收缩和扩张会导致相关 现象(肖明昆等ꎬ２０２３)ꎮ 本研究结果表明ꎬ棱枝槲
基因拷贝数的改变或边界区域假基因的产生( 胡 寄生叶绿体基因组的密码子偏向于使用以 Ａ 或 Ｕ
康等ꎬ２０２４)ꎮ 然而ꎬ在棱枝槲寄生与其他槲寄生 结尾的同义密码子ꎬ与百合属( 毕彧ꎬ２０１８) 和石斛
属 ４ 个物种中的四分体区域边界的侧翼基因类型 属(王晓双等ꎬ２０２２)等单子叶物种ꎬ以及山核桃属

和扩张程度均存在明显差异ꎬ棱枝槲寄生在 ＪＬＢ (Ｓｈｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０２２) 和龙血树属( 王子豪等ꎬ２０２３)
边界上的 ｒｐｌ２２ 基因由 ＩＲｂ 区跨越边界进入 ＬＳＣ 等双子叶物种的研究结论相似ꎮ 中性进化理论认
区ꎬ这些差异导致假基因的产生、基因重复和基因 为碱基突变和自然选择对密码子第 ３ 位碱基变化
缺失ꎬ而在部分檀香科植物中的 ＩＲ 区域扩张同样 的影响是中性或近中性的( 原晓龙等ꎬ２０２１)ꎬ通过

也是由于边界处基因区域倒置产生( 王马寅等ꎬ 中性绘图分析ꎬ本研究发现叶绿体基因分布相对
２０２３)ꎮ 植物叶绿体基因组序列经常被用作 ＤＮＡ 集中ꎬ说明密码子偏好在很大程度上受自然选择
条形码 的 分 子 标 记 进 行 物 种 鉴 别ꎬ 本 研 究 中 的 压力的影响ꎮ 此外ꎬＥＮＣ 绘图和 ＰＲ２￣ｐｌｏｔ 分析结
ｙｃｆ１、ａｔｐＡ、ｒｐｓ８－ｒｐｌ３６、ｒｒｎ５Ｓ－ｔｒｎＮ￣ＧＵＵ 具备较高的 果进一步说明ꎬ其密码子使用偏好性受自然选择
变异度ꎬ可作为物种鉴定和遗传多样性研究的潜 压力和碱基突变的影响ꎬ这与杨秀瑶等(２０２３)、王
在特征ꎮ 目前已有研究表明ꎬｙｃｆ１ 的 ＤＮＡ 条形码 晓双等(２０２２)、Ｄｕａｎ 等(２０２１) 的研究结果相似ꎬ
在胡颓子科( 罗晗睿等ꎬ２０２４)、悬钩子属( 江转转 因此槲寄生属密码子使用模式的主要影响因素与
等ꎬ２０２４)等的鉴定具有优异表现ꎬ在牛茄子叶绿 其他植物相似ꎬ皆是以自然选择为主要影响因素ꎬ
体基因组( 龚秋怡等ꎬ２０２４) 中 ｔｒｎＱ － ｐｓｂＫ、ｐｓｂＦ － 植物自身的碱基突变为辅ꎮ