Page 122 - 《广西植物》2025年第12期
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２ ２ ６ ４ 广 西 植 物 ４５ 卷
表 ５ 叶绿体密码子基本特征
Ｔａｂｌｅ ５ Ｂａｓｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｃｏｄｏｎｓ
ＧＣ １ 含量 ＧＣ ２ 含量 ＧＣ ３ 含量 ＧＣ ａｌｌ 含量
物种 有效密码子数
ＧＣ １ ｃｏｎｔｅｎｔ ＧＣ ２ ｃｏｎｔｅｎｔ ＧＣ ３ ｃｏｎｔｅｎｔ ＧＣ ａｌｌ ｃｏｎｔｅｎｔ
Ｓｐｅｃｉｅｓ ＥＮＣ
(％) (％) (％) (％)
棱枝槲寄生
Ｖｉｓｃｕｍ ｄｉｏｓｐｙｒｏｓｉｃｏｌａ ４５.５１ ３７.１１ ２８.２８ ３６.９６ ４６.９６
枫香槲寄生
Ｖ. ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒｉｃｏｌａ ４５.３５ ３７.０４ ２８.１６ ３６.８５ ４６.９５
槲寄生
Ｖ. ｃｏｌｏｒａｔｕｍ ４５.５２ ３７.１３ ２８.２７ ３６.９７ ４７.０８
瘤果槲寄生
Ｖ. ｏｖａｌｉｆｏｌｉｕｍ ４５.２３ ３７.１７ ２８.４８ ３６.９６ ４７.２０
扁枝槲寄生
Ｖ. ａｒｔｉｃｕｌａｔｕｍ ４６.６８ ３８.３０ ３０.５４ ３８.５１ ４８.４６
图 ６ ５ 种槲寄生属植物叶绿体基因组 ＲＳＣＵ 分析
Ｆｉｇ. ６ ＲＳＣＵ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ ｆｉｖｅ ｐｌａｎｔｓ ｏｆ Ｖｉｓｃｕｍ
实际值ꎬ表明这部分基因主要受到自然选择的影 ２.５ 系统发育分析
响ꎬ受到突变压力影响的基因较少ꎮ 基于 １８ 种檀香目物种叶绿体基因组序列ꎬ以
对 ５ 个槲寄生属物种中编码氨基酸第 ３ 位上 五加科人参属人参( Ｐａｎａｘ ｇｉｎｓｅｎｇ) 作为外类群物
的 Ａ、Ｇ、Ｔ、Ｃ 进行 ＰＲ２ 分析ꎬ由图 ９ 可知ꎬ各基因 种构建系统发育树ꎬ利用 ＯｒｔｈｏＦｉｎｄｅｒ 软件进行直
不均匀分布在 ４ 个区域内且大部分基因位于图的 系同源基因分析ꎬ构建系统进化树ꎮ 结果( 图 １０)
右下方 ＴＧ 区ꎬ密码子第 ３ 位碱基的使用频率为Ｔ> 表明ꎬ１８ 种檀香目物种主要分为桑寄生科和檀香
Ａ、Ｇ>Ｃꎬ表明密码子使用偏好性主要受到自然选 科 ２ 个分支ꎬ其中槲寄生属物种聚为一支ꎻ组内亲
择的影响ꎬ同时还受到碱基突变的共同作用ꎮ 缘关系显示ꎬ棱枝槲寄生与枫香槲寄生聚为一支ꎬ
２.４.４ 最优密码子分析 如表 ６ 所示ꎬ本研究依据 亲缘关系最近ꎮ
槲寄生属 ５ 个物种叶绿体基因组的密码子 ＲＳＣＵ
和△ＲＳＣＵ 值ꎬ发现它们的高表达优越密码子介于 ３ 讨论与结论
１５ ~ ２０ 个ꎬ其中枫香槲寄生的高表达优越密码子
最少ꎬ为 １５ 个ꎻ棱枝槲寄生的高表达优越密码子 本文通过对棱枝槲寄生叶绿体基因组序列特
最高ꎬ有 ２０ 个ꎮ 经筛选出共同的最优密码子有 ４ 征的多角度解析ꎬ结果表明其与槲寄生属植物叶
个ꎬ分别是 ＧＣＵ、ＡＵＵ、ＣＧＡ、ＡＣＵꎬ均以 Ａ / Ｕ 结尾ꎬ 绿体基因组结构相似ꎬ均为典型的环状四分体结
表明槲寄生属叶绿体基因组密码子偏好以 Ａ / Ｕ 构且叶绿体基因的含量、组成和 ＧＣ 含量等基因组
结尾ꎮ 特征均较为相似( Ｐｅｔｅｒｓｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０１５)ꎮ 本研究
