Page 125 - 《广西植物》2025年第12期
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１２ 期 张煜冰等: 棱枝槲寄生叶绿体基因组结构特征及系统发育分析 ２ ２ ６ ７
表 ６ 叶绿体基因组最优密码子的确定
Ｔａｂｌｅ ６ Ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｏｐｔｉｍａｌ ｃｏｄｏｎ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ
枫香槲寄生 槲寄生 瘤果槲寄生 扁枝槲寄生 棱枝槲寄生
Ｖｉｓｃｕｍ ｌｉｑｕｉｄａｍｂａｒｉｃｏｌａ Ｖ. ｃｏｌｏｒａｔｕｍ Ｖ. ｏｖａｌｉｆｏｌｉｕｍ Ｖ. ａｒｔｉｃｕｌａｔｕｍ Ｖ. ｄｉｏｓｐｙｒｏｓｉｃｏｌａ
密码子
Ｃｏｄｏｎ
ＲＳＣＵ ΔＲＳＣＵ ＲＳＣＵ ΔＲＳＣＵ ＲＳＣＵ ΔＲＳＣＵ ＲＳＣＵ ΔＲＳＣＵ ＲＳＣＵ ΔＲＳＣＵ
ＧＣＡ — — １.１９９ ７ ０.１７５ ６ １.２９４ ５ ０.２２３ ８ — — — —
ＧＣＵ １.３１１ １ ０.７５０ ７ １.３３７ ８ ０.６５０ ６ １.２５５ ７ ０.４５７ ８ １.２３３ ８ ０.０７２ ８ １.３６８ ７ ０.７８９ ５
ＵＧＵ １.２３８ ９ ０.５９４ ６ １.２８８ ９ ０.５８８ ２ １.２５７ ６ ０.５８０ ６ — — １.２３８ ２ ０.３４４ ６
ＧＡＵ — — — — — — １.３７５ １ ０.４９１ ５ — —
ＧＡＡ １.３５２ ７ ０.４５２ ６ １.３７３ ３ ０.４０３ ８ １.４２５ ５ ０.３８２ ５ — — １.３５４ ６ ０.４３２ ７
ＵＵＵ — — １.２９８ ４ ０.４５８ ６ １.３１３ ０ ０.４６７ ０ １.２６７ ９ ０.２７９ ３ １.２９５ ５ ０.３１４ ７
ＧＧＡ — — １.４８５ ３ ０.１００ ３ — — １.４７２ ９ ０.２３６ ２ — —
ＧＧＵ １.０４２ ９ １.２３２ ２ — — １.０１４ １ ０.７８４ ２ — — １.０４１ ６ ０.９２２ ８
ＣＡＵ — — — — — — １.４６１ ３ ０.１３６ ４ １.４３６ ９ ０.１５０ ８
ＡＵＡ — — — — — — — — １.０５５ ９ ０.２０６ ０
ＡＵＵ １.１９４ ３ ０.４４８ ３ １.２２３ ５ ０.３９８ ９ １.２３０ ４ ０.３６８ ４ １.２２２ ３ ０.０８８ ９ １.１５７ ４ ０.２５６ １
ＡＡＡ １.４６２ ５ ０.３９５ ５ １.４４６ ０ ０.２６８ ４ １.４５７ ４ ０.２６４ ７ — — １.４２３ ５ ０.３５１ ２
ＣＵＵ １.１９５ ７ ０.７４３ ０ — — — — １.２６０ ８ ０.１４５ ０ — —
ＵＵＡ １.３６５ ９ １.４０３ ３ １.４１６ ３ １.１６７ ４ １.２９９ ５ １.２８７ ２ — — １.２７８ ４ １.７６１ ３
ＵＵＧ — — １.２１０ ２ ０.１８９ ８ — — — — — —
ＡＡＵ — — — — — — １.３９０ ５ ０.００４ ７ — —
ＣＣＡ — — — — — — １.３５６ ９ ０.３３３ ４ １.３３４ ８ ０.１４４ ８
ＣＣＵ １.０８８ ８ ０.６５１ ４ １.１５３ ０ ０.７９４ ５ １.１０４ ４ ０.８８４ ３ — — １.０９２ ５ ０.８４２ ３
ＣＡＡ — — — — １.３８３ ２ — １.３４５ ５ ０.２７６ ３ １.３８１ ４ ０.２３３ ８
ＡＧＡ — — — — １.８９７ ２ — — — １.８７７ ０ ０.３０２ ３
ＡＧＧ — — — — １.１３７ ９ — １.０５０ ２ ０.５３１ ０ — —
ＣＧＡ １.１５７ ４ ０.８６１ ５ １.０６４ ６ ０.２８２ ５ １.１２８ ５ ０.１６１ ５ １.１９８ ７ ０.１６８ ３ １.１１７ ０ ０.４６６ ４
ＵＣＡ — — — — １.３００ ３ — １.２３２ ８ ０.４６５ ７ １.２４８ ５ ０.３０５ ７
ＵＣＣ — — １.０７３ ６ ０.１０２ ７ １.０７２ ４ ０.１０９ ９ １.０８９ ２ ０.５０３ ７ — —
ＵＣＵ １.４５２ ３ １.２６１ １ — — — — — — １.４１０ ３ ０.４１６ ０
ＡＣＡ — — １.２２１ ０ ０.０８９ １ １.１１４ ３ ０.１１８ ３ — — — —
ＡＣＵ １.２３１ ６ ０.７７６ ７ １.２０５ ４ ０.４４０ ４ １.２９９ ３ ０.３２２ ７ １.１６３ ４ ０.２５６ ２ １.２５２ ２ ０.５５２ ７
ＧＵＡ １.１７９ ９ ０.３０１ ５ １.１９１ ６ ０.９０５ ０ １.０８７ ３ ０.８０５ ５ — — — —
ＧＵＵ １.３６４ ４ ０.５７７ １ — — — — — — １.３８０ ５ ０.７３７ ７
ＵＡＵ １.４２７ １ ０.１５４ ７ １.４０３ ９ ０.１０５ ０ — — １.３７５ ３ ０.２４８ ５ １.４１７ ２ ０.１６９ ６
一直以来ꎬ槲寄生属植物的系统位置和亲缘 研究通过基于檀香目 １８ 个物种的完整叶绿体基
关系存在争议ꎬ物种界定及系统发育研究困难较 因组序列ꎬ以具有近缘关系的五加科人参属人参
大ꎮ 例如ꎬ韩荣兰等(２００４) 应用叶绿体 ＤＮＡ ｔｒｎＬ 作为外类群ꎬ结果表明 ２ 个主要的系统发育树分
内含子序列分析了檀香目各科间系统发育关系ꎬ 支为桑寄生科和檀香科ꎬ其中棱枝槲寄生与枫香
结果验证了桑寄生科和槲寄生科并不具备密切亲 槲寄生聚为一支ꎬ亲缘关系最近ꎬ说明聚类结果可
缘关系ꎬ槲寄生科从檀香科内独立出来ꎮ 因此ꎬ本 靠ꎬ与前人基于基因组的进化分析结论一致(Ｓｈｉｎ ＆
