Page 126 - 《广西植物》2025年第12期

２ ２ ６ ８ 广 西 植 物 ４５ 卷

图 １０ 基于叶绿体基因组序列构建的系统发育树

Ｆｉｇ. １０ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ

Ｌｅｅꎬ２０１８ꎻ王马寅等ꎬ２０２３ꎻ蒋明等ꎬ２０２３)ꎮ Ｌｉｌｉｕｍ [Ｄ]. Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ: Ｊｉｌｉｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ. [毕
综上所述ꎬ本研究首次完成了棱枝槲寄生叶 彧ꎬ ２０１８. 百合属的比较叶绿体基因组学研究 [Ｄ]. 长
绿体基因组的序列测序和组装注释ꎬ从基因水平 春: 吉林农业大学.]
'
揭示了棱枝槲寄生叶绿体基因组的基本特征和密 ＢＲＡＵＫＭＡＮＮ Ｔꎬ ＫＵＺＭＩＮＡ Ｍꎬ ＳＴＥＦＡＮＯＶＩ Ｃ Ｓꎬ ２０１３.
码子使用偏好性ꎬ为后续槲寄生属植物的遗传结 Ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ａｃｒｏｓｓ ｔｈｅ ｇｅｎｕｓ Ｃｕｓｃｕｔａ
(Ｃｏｎｖｏｌｖｕｌａｃｅａｅ): ｔｗｏ ｃｌａｄｅｓ ｗｉｔｈｉｎ ｓｕｂｇｅｎｕｓ Ｇｒａｍｍｉｃａ
构和遗传多样性研究奠定了重要的理论基础ꎮ 此
ｅｘｈｉｂｉｔ ｅｘｔｅｎｓｉｖｅ ｇｅｎｅ ｌｏｓｓ [ Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ
外ꎬ本研究基于 １９ 个物种完整的叶绿体基因组编
Ｂｏｔａｎｙꎬ ６４(４): ９７７－９８９.
码序列ꎬ进一步展开系统发育分析ꎬ阐明了檀香目 ＢＵＮＧＡＲＤ ＲＡꎬ ２００４. Ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｉｎ ｐａｒａｓｉｔｉｃ
中桑寄生科和檀香科之间的系统发育关系ꎬ为檀 ｐｌａｎｔｓ: Ｉｎｓｉｇｈｔ ｆｒｏｍ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ [Ｊ]. ＢｉｏＥｓｓａｙｓꎬ
２６(３): ２３５－２４７.
香科槲寄生属的系统分类研究提供科学依据ꎮ
ＣＡＶＡＬＩＥＲ￣ＳＭＩＴＨ Ｔꎬ ２００２. Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ:Ｓｅｃｏｎｄａｒｙ
ｓｙｍｂｉｏｇｅｎｅｓｉｓ ａｎｄ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｌｏｓｓｅｓ [ Ｊ]. Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ
参考文献: １２(２): Ｒ６２－Ｒ６４.
ＣＨＥＮ ＣＪꎬ ＣＨＥＮ Ｈꎬ ＺＨＡＮＧ Ｙꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. ＴＢｔｏｏｌｓ: Ａｎ
ＡＭＩＲＹＯＵＳＥＦＩ Ａꎬ ＨＹＶÖＮＥＮ Ｊꎬ ＰＯＣＺＡＩ Ｐꎬ ２０１８. ＩＲｓｃｏｐｅ: ｉｎｔｅｇｒａｔｉｖｅ ｔｏｏｌｋｉｔ ｄｅｖｅｌｏｐｅｄ ｆｏｒ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｅｓ ｏｆ ｂｉｇ
Ａｎ ｏｎｌｉｎｅ ｐｒｏｇｒａｍ ｔｏ ｖｉｓｕａｌｉｚｅ ｔｈｅ ｊｕｎｃｔｉｏｎ ｓｉｔｅｓ ｏｆ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｄａｔａ [Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｌａｎｔꎬ １３(８): １１９４－１２０２.
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ [ Ｊ ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓꎬ ３４(１７): ＤＵＡＮ ＨＲꎬ ＺＨＡＮＧ Ｑꎬ ＷＡＮＧ ＣＭꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ
３０３０－３０３１. ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ
ＡＬ￣ＪＵＨＡＮＩ Ｗꎬ ＡＬ ＴＨＡＧＡＦＩ ＮＴꎬ ＡＬ￣ＱＴＨＡＮＩＮ ＲＮꎬ Ｄｅｌｐｈｉｎｉｕｍ ｇｒａｎｄｉｆｌｏｒｕｍ Ｌ. ｒｅｖｅａｌｓ ａ ｐｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｆｏｒ ＡＴ￣
２０２２. Ｇｅｎｅ ｌｏｓｓｅｓ ａｎｄ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ ｅｎｄｉｎｇ ｃｏｄｏｎｓ ａｓ ａ ｒｅｓｕｌｔ ｏｆ ｍａｊｏｒ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｃｏｎｓｔｒａｉｎｔｓ
ｈｅｍｉｐａｒａｓｉｔｉｃ ｓｐｅｃｉｅｓ Ｐｌｉｃｏｓｅｐａｌｕｓ ａｃａｃｉａｅ ａｎｄ Ｐｌｉｃｏｓｅｐａｌｕｓ [Ｊ]. ＰｅｅｒＪꎬ ９: ｅ１０７８７.
ｃｕｒｖｉｆｌｏｒｕｓ: Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｅｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ Ｅｄｉｔｏｒｉａｌ Ｂｏａｒｄ ｏｆ Ｆｌｏｒａ ｏｆ Ｃｈｉｎａꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ
ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ａｍｏｎｇ ｓａｎｔａｌａｌｅｓ ｍｅｍｂｅｒｓ [ Ｊ ]. Ｐｌａｎｔｓꎬ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ １９７８. Ｆｌｏｒａ Ｒｅｉｐｕｂｌｉｃａｅ Ｐｏｐｕｌａｒｉｓ Ｓｉｎｉｃａｅ:
１１(１４): １８６９. Ｖｏｌ. ７２ [Ｍ]. Ｂｅｉｊｉｎｇ: Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｒｅｓｓ: １１９－１３６. [中国科学
ＡＳＡＦ Ｓꎬ ＷＡＱＡＳ Ｍꎬ ＫＨＡＮ ＡＬꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ 院中国植物志编辑委员会ꎬ １９８８. 中国植物志: 第七十二
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｗｉｌｄ ｒｉｃｅ ( Ｏｒｙｚａ ｍｉｎｕｔａ) ａｎｄ ｉｔｓ 卷 [Ｍ]. 北京: 科学出版社: １１９－１３６.]
ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｔｏ ｒｅｌａｔｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ [ Ｊ ]. Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ ｉｎ Ｐｌａｎｔ ＦＬＡＮＮＥＲＹ ＭＬꎬ ＭＩＴＣＨＥＬＬ ＦＪＧꎬ ＣＯＹＮＥ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ
Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ ８: ３０４. ２００６. Ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓａｔｉｏｎ ｉｎ Ｂｒａｓｓｉｃａ ａｎｄ
ＢＩ Ｙꎬ ２０１８. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｕｓ Ｂｒａｓｓｉｃａｃｅａｅ ｕｓｉｎｇ ａ ｎｅｗ ｓｅｔ ｏｆ ｎｉｎｅ ＳＳＲｓ [Ｊ]. Ｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌ