Page 76 - 《广西植物》2025年第12期

２ ２ １ ８ 广 西 植 物 ４５ 卷
表 ２ 引物信息及 ＰＣＲ 反应程序 (图 ２:Ａ)ꎮ ｃｐＤＮＡ 单倍型网络图以 Ｈ２、Ｈ３、Ｈ１５
Ｔａｂｌｅ ２ Ｐｒｉｍｅｒ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ａｎｄ 为中心衍生出其他 ４０ 种单倍型ꎬ因此推测这 ３ 个
ＰＣＲ ｒｅａｃｔｉｏｎ ｐｒｏｃｅｄｕｒｅ
单倍型可能为较古老单倍型ꎬ并且各分支间相互
引物名称 引物序列(５′－３′) 交叉ꎬ联系较为紧密(图 ２:Ｂ)ꎮ
Ｐｒｉｍｅｒ ｎａｍｅ Ｐｒｉｍｅｒ ｓｅｑｕｅｎｃｅ (５′－３′)
２.４ 甘草居群的遗传多样性与遗传分化
ＩＴＳ Ｆ: ＣＣＴＴＡＴＣＡＴＴＴＡＧＡＧＧＡＡＧＧＡＧ
通过比较 Ｎ 和 Ｇ 数值大小ꎬ可以判断一个物
Ｒ: ＴＣＣＴＣＣＧＣＴＴＡＴＴＧＡＴＡＴＧＣ ｓｔ ｓｔ
种是否具有明显的谱系地理结构ꎮ 即 Ｎ > Ｇ 时ꎬ
ｍａｔＫ Ｆ: ＣＧＴＡＣＡＧＴＡＣＴＴＴＴＧＴＧＴＴＴＡＣＧＡＧ ｓｔ ｓｔ
表明物种居群具有明显的谱系地理结构ꎻ当 Ｎ <
Ｒ: ＡＣＣＣＡＧＴＣＣＡＴＣＴＧＧＡＡＡＴＣＴＴＧＧＴＴＣ ｓｔ
Ｇ 时ꎬ表明物种居群不具有明显的谱系地理结构
ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨ Ｆ: ＧＴＴＡＴＧＣＡＴＧＡＡＣＧＴＡＡＴＧＣＴＣ ｓｔ
(Ｐｏｎｓ ＆ Ｐｅｔｉｔꎬ １９９６)ꎮ 本研究利用 ＰｅｒｍｕｔＣｐＳＳＲ
Ｒ: ＣＧＣＧＣＡＴＧＧＴＧＧＡＴＴＣＡＣＡＡＴＣＣ
软件计算甘草总遗传多样性( Ｈ )、居群内平均遗
ｔ
ｔｒｎＳ－ｔｒｎＧ Ｆ: ＧＣＣＧＣＴＴＴＡＧＴＣＣＡＣＴＣＡＧＣ
传多样性(Ｈ )、遗传分化系数(Ｎ 、Ｇ )ꎬ结果得到
ｓ ｓｔ ｓｔ
Ｒ: ＧＡＡＣＧＡＡＴＣＡＣＡＣＴＴＴＴＡＣＣＡＣ
甘草总遗传多样性 Ｈ (ＩＴＳ: ０.２６６ꎻｃｐＤＮＡ: ０.９１４)
ｔ
均大 于 居 群 内 平 均 遗 传 多 样 性 Ｈ ( ＩＴＳ:０. １８５ꎻ
ｓ
(Ｐ )为 ０.０２６ ３９ꎮ 其中ꎬＧＳ１、ＧＳ３、ＳＨＸ１、ＸＪ１、ＳＨＸ１ ｃｐＤＮＡ: ０.７８３)ꎬ居群间的遗传分化系数 Ｎ ( ＩＴＳ:
ｉ ｓｔ
和 ＮＭＧ２ 居群的单倍型数量( ｈ) 最多ꎬ均为 ５ 个ꎬ ０. １５５ꎻ ｃｐＤＮＡ: ０. １０１) 均 小 于 Ｇ ( ＩＴＳ: ０. ３０６ꎻ
ｓｔ
ＧＳ１、ＧＳ２、ＧＳ３、ＱＨ３、ＸＪ１、ＳＨＸ１、ＱＸ３ 和 ＮＭＧ２ 居群 ｃｐＤＮＡ: ０.１４３)ꎬ表明甘草居群不具有明显的谱系
的单倍型多样性(Ｈ )最高ꎬ为 １.０００ꎬＱＨ３ 居群的核 地理结构ꎮ
ｄ
苷酸多样性(Ｐ ) 最高ꎬ为 ０.００９ ０６８ꎮ 共有单倍型 对不同甘草居群进行分子方差分析ꎬ结果( 表
ｉ
Ｈ２、Ｈ３、Ｈ１５ 在甘草居群中的覆盖度最广ꎬ其中 Ｈ２ ５) 得 到ꎬ 甘 草 居 群 内 遗 传 变 异 ( ＩＴＳ: ７８. ２３％ꎻ
存在于 １０ 个居群 ２４ 个甘草样本中ꎬＨ３ 存在于 ７ 个 ｃｐＤＮＡ: ８８.５９％)显著大于居群间遗传变异( ＩＴＳ:
居群 １４ 个甘草样本中ꎬＨ１５ 存在于 ７ 个居群 １０ 个 ２１.７７％ꎻｃｐＤＮＡ: １１. ４１％)ꎬ 遗 传 分 化 系 数 ( Ｆ )
ｓｔ
甘草样本中ꎬ其余 ３７ 个为特有单倍型ꎮ ( ＩＴＳ: ０.１５６ ４０ꎻｃｐＤＮＡ: ０.１１４ １１)均小于 ０.２５ꎬ表
２.３ 甘草居群的单倍型分布与谱系关系 明甘 草 居 群 间 遗 传 分 化 程 度 较 低 ( 王 乙 淋 等ꎬ
２.３.１ 甘草居群的单倍型地理分布 不同甘草居 ２０２３)ꎬ遗传分化主要来源于居群内ꎮ 甘草居群间
群的单倍型地理分布结果得到ꎬＩＴＳ 序列中共包含 基因流(Ｎ ) ( ＩＴＳ: １.３４９ꎻｃｐＤＮＡ: １.５２０) 均大于
ｍ
１０ 个单倍型( 图 １:Ａ)ꎬ其中共有单倍型 Ｈ１ 在宁 １ꎬ表明甘草居群间基因交流程度较高ꎬ不存在明
夏、甘肃、陕西、青海、山西、新疆和内蒙古均有分 显的地理隔离ꎮ
布ꎬ分布范围最广ꎬ而 Ｈ２－Ｈ９ 单倍型分别分布在 ２.５ 甘草单倍型系统发育关系
不同的居群中ꎮ ｃｐＤＮＡ 序列共包含 ４３ 个单倍型 利用 ＭＥＧＡ ７. ０ 基于最大似然法 ( ＭＬ) 进行
(图 １:Ｂ)ꎬ其中共有单倍型 Ｈ２、Ｈ３、Ｈ１５ 分布范围 ＩＴＳ、ｃｐＤＮＡ 单倍型系统发育树的构建ꎮ 结果得到ꎬ
最为广泛ꎬ单倍型 Ｈ２ 在宁夏、甘肃、陕西、青海、山 ＩＴＳ 单倍型 Ｈ１－Ｈ１０ 分为三组(图 ３:Ａ):第一组为
西、新疆和内蒙古均有分布ꎬ单倍型 Ｈ３ 分布在宁 单倍型 Ｈ６ 和 外 类 群 蓝 花 棘 豆 ( ＬＨＪＤ)、 苦 马 豆
夏、陕西、青海、新疆和内蒙古ꎬ单倍型 Ｈ１５ 分布在 (ＫＭＤ)ꎻ第二组包括 ３ 个单倍型ꎬ分别为 Ｈ５、Ｈ７ 和
甘肃、陕西、青海、新疆和内蒙古ꎬ其余单倍型仅分 Ｈ９ꎻ第三组为包括 Ｈ１ 在内的 ６ 种单倍型ꎬ分别为

布在少数居群中ꎮ Ｈ１、Ｈ２、 Ｈ３、 Ｈ４、 Ｈ８ 和 Ｈ１０ꎮ ｃｐＤＮＡ 单倍型 Ｈ１ －
２.３.２ 甘草居群单倍型的谱系关系 单倍型网络 Ｈ４３ 分为四组(图 ３:Ｂ):第一组为包括单倍型 Ｈ２
图可以直观地反映各单倍型之间的关系ꎮ 本研究 在内的 １３ 种单倍型ꎬ 分别为 Ｈ１、 Ｈ２、 Ｈ１９ － Ｈ２３、
基于 Ｍｅｄｉａｎ￣Ｊｏｉｎｉｎｇ 进行甘草祖先与后代间衍生关 Ｈ２５、Ｈ２６、Ｈ３１、Ｈ３４、Ｈ４１、Ｈ４３ꎻ第二组为包括单倍
系的推测ꎬ发现甘草的 ＩＴＳ 单倍型网络图以 Ｈ１ 为 型 Ｈ１５ 在内的 １２ 种单倍型ꎬ分别为 Ｈ８－Ｈ１２、Ｈ１４－
中心衍生出 Ｈ４、Ｈ５、Ｈ６ 和 Ｈ９ 共 ４ 种单倍型ꎬ又在 Ｈ１６、Ｈ３７、Ｈ３８、Ｈ４０、Ｈ４２ꎻ第三组为包括 Ｈ３ 在内的
Ｈ４ 和 Ｈ５ 的基础上衍生出 Ｈ２、Ｈ３、Ｈ７、Ｈ８ 和 Ｈ１０ ７ 种单倍型ꎬ分别为 Ｈ３、Ｈ４、Ｈ２４、Ｈ２７、Ｈ２８、Ｈ３２、
共 ５ 种单倍型ꎬ因此推测 Ｈ１ 可能为较古老单倍型 Ｈ３９ꎻ 第四组为单倍型 Ｈ２ 衍生出的后代单倍型ꎬ分