Page 90 - 《广西植物》2025年第3期
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图 １ 已发表的维管植物质体基因组概况
Ｆｉｇ. １ Ｏｖｅｒｖｉｅｗ ｏｆ ｐｕｂｌｉｓｈｅｄ ｐｌａｓｔｏｍｅｓ ｉｎ ｖａｓｃｕｌａｒ ｐｌａｎｔｓ
ＩＲＬＣ 分支、牻牛儿苗科、菟丝子属和仙人掌科等) 真性下降ꎬ以及短串联重复序列被认为是驱动质
均有报道(Ｗｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１ꎻ Ｚｈｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６ꎻ Ｐｉｎｇ 体基 因 组 重 排 的 主 要 原 因 ( Ｗｅｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１４ꎻ
ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２ꎻ Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２４) ( 图 ２)ꎮ ＩＲ 区丢 Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６)ꎮ 在 ＤＮＡ 修复过程中ꎬ重复基
失的类群表现出更多的基因重排ꎬ由此推测 ＩＲ 区 因区域可参与结构的修复ꎬ而精度不同的修复可
可能具有 维 持 质 体 基 因 组 稳 定 的 作 用 ( Ｐａｌｍｅｒꎬ 能会导致结构变异(Ｃａｒｖａｌｈｏ ＆ Ｌｕｐｓｋｉꎬ ２０１６)ꎮ 通
１９８３ꎻ Ｓｉｎｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８)ꎮ 最新的一些研究结果表 常低复杂度的串联重复序列因相似性高而易发生
明ꎬＩＲ 区 变 化 与 基 因 重 排 不 存 在 明 显 的 关 联 性 复制移位和倒位ꎬ进而导致结构重排ꎬ如马兜铃科
(Ｊｉｎ ＤＭ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０)ꎬ可能是某种调控机制崩溃 马蹄香属( Ｓａｒｕｍａ) 和豆科的 ＩＲＬＣ 分支( Ｓｉｎｎ ｅｔ
造成 ＩＲ 区 变 化 和 基 因 重 排 同 时 发 生 ( Ｍｏｗｅｒ ＆ ａｌ.ꎬ ２０１８ꎻ Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎬ而长重复序列则可
Ｖｉｃｋｒｅｙꎬ ２０１８ꎻ Ｍａｃｉｓｚｅｗｓｋｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２ꎻ Ｗａｎｇ ｅｔ 阻碍 结 构 变 异 的 发 生 ( Ｍｏｗｅｒ ＆ Ｖｉｃｋｒｅｙꎬ ２０１８ꎻ
ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎮ 此外ꎬＩＲ 区变异具有很强的系统发育 Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎮ 同时ꎬ( 近) 回文序列由于能
信号ꎬ可以用于定义单系群ꎬ如豆科蝶形花亚科的 与编码链和模板链配对ꎬ构成十字型 ＤＮＡ 结构ꎬ
ＩＲＬＣ 分支共享 ＩＲ 区丢失(王银环ꎬ ２０１７)、菟丝子 因此可诱发重组导致基因组结构重排( Ｓｉｎｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ
亚属共享 ＩＲ 区丢失( Ｂａｎｅｒｊｅｅ ＆ Ｓｔｅｆａｎｏｖｉｃ'ꎬ ２０２０ꎻ ２０１８)ꎮ 此外ꎬＩＲ 区的扩张收缩也是质体基因组结
Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２４)ꎮ 构变异的驱动因素之一ꎬ如菟丝子属的 ＩＲ 扩张促
ＤＮＡ 复制、重组和修复系统的功能障碍和保 使 ｙｃｆ１ 基因镜像拷贝ꎬ随后 ＳＳＣ 区扩张使其丢失
