Page 86 - 《广西植物》2025年第3期
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Guihaia Mar. 2025ꎬ 45(3): 466-482
DOI: 10.11931/ guihaia.gxzw202312035
陈丽琼ꎬ 黎若竹ꎬ 李鑫ꎬ 等ꎬ 2025. 维管植物质体基因组多样性及其获取与应用研究进展 [ J]. 广西植物ꎬ 45(3):
466-482.
CHEN LQꎬ LI RZꎬ LI Xꎬ et al.ꎬ 2025. Plastome diversity of vascular plants and its acquisition and applications: A review [J].
Guihaiaꎬ 45(3): 466-482.
维管植物质体基因组多样性及其获取与应用研究进展
陈丽琼 ꎬ 黎若竹 ꎬ 李 鑫 ꎬ 姚 昕 ꎬ 杨俊波 ꎬ 李德铢 ꎬ 郁文彬 1ꎬ5∗
1ꎬ2
1
4
4
1
1ꎬ3
( 1. 中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心和云南省热带雨林与亚洲象保护重点实验室ꎬ 中国 云南 勐腊 666303ꎻ
2. 钦州市农业技术推广中心ꎬ 中国 广西 钦州 535000ꎻ 3. 奈良先端科学技术大学院大学 科学技术研究生院ꎬ
日本 奈良 6300192ꎻ 4. 中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库ꎬ 中国 昆明 650201ꎻ
5. 中国科学院东南亚生物多样性研究中心ꎬ 中国 云南 勐腊 666303 )
摘 要: 维管植物是地球生物多样性的重要组成部分ꎬ维管植物的系统分类、多样性起源和演化等问题一直
备受关注ꎮ 随着测序技术的发展ꎬ越来越多的维管植物质体基因组序列被解析和发表ꎬ为深入认识维管植
物多样性的起源和演化提供了新的证据ꎮ 该文介绍了维管植物质体基因组的基本特征和结构多样性ꎬ并以
寄生植物为例简述了质体基因组退化ꎻ回顾了当前主流的质体基因组的测序技术及组装策略ꎬ并探讨了获
取标本 DNA 和特殊类群的质体基因组时需要注意的问题ꎮ 此外ꎬ该文还探讨了质体基因组在系统发育和
超级 DNA 条形码研究中面临的问题与挑战ꎬ并提出了相应的建议ꎮ
关键词: 质体基因组演化ꎬ 基因组结构变异ꎬ 质体基因组获取ꎬ 系统发育ꎬ 超级条形码
中图分类号: Q943 文献标识码: A 文章编号: 1000 ̄3142(2025)03 ̄0466 ̄17
Plastome diversity of vascular plants and
its acquisition and applications: A review
1 1ꎬ2 1ꎬ3 1
CHEN Liqiong ꎬ LI Ruozhu ꎬ LI Xin ꎬ YAO Xin ꎬ
4 4 1ꎬ5∗
YANG Junbo ꎬ LI Dezhu ꎬ YU Wenbin
( 1. Center for Integrative Conservation and Yunnan Key Laboratory for the Conservation of Tropical Rainforests and Asian Elephantsꎬ Xishuangbanna
Tropical Botanical Gardenꎬ Chinese Academy of Sciencesꎬ Mengla 666303ꎬ Yunnanꎬ Chinaꎻ 2. Qinzhou Agricultural Technology Promotion Centerꎬ
Qinzhou 535000ꎬ Guangxiꎬ Chinaꎻ 3. Graduate School of Science and Technologyꎬ Nara Institute of Science and Technologyꎬ Nara 6300192ꎬ
Japanꎻ 4. The Germplasm Bank of Wild Speciesꎬ Kunming Institute of Botanyꎬ Chinese Academy of Sciencesꎬ Kunming 650201ꎬ Chinaꎻ
5. Southeast Asia Biodiversity Research Instituteꎬ Chinese Academy of Scienceꎬ Mengla 666303ꎬ Yunnanꎬ China )
Abstract: Vascular plants are crucial to global biodiversityꎬ so their systematic taxonomyꎬ origin and evolution of
diversity have been the hot topics. With the rapid development of sequencing technologyꎬ more and more vascular plant
收稿日期: 2024-06-26 接受日期: 2024-08-15
基金项目: 国家自然科学基金(31870196ꎬ 32371700)ꎻ 云南省兴滇人才专项(202405AS350019)ꎻ 中国科学院西部青年人才项目ꎻ
云南省基础研究专项重大项目(202101BC070003)ꎻ 海南省重点研发计划项目(ZDYF2023RDY201)ꎮ
第一作者: 陈丽琼(1996—)ꎬ硕士ꎬ研究方向为细胞器基因组演化ꎬ(E ̄mail)chenliqiong@ xtbg.ac.cnꎮ
∗
通信作者: 郁文彬ꎬ博士ꎬ研究员ꎬ研究方向为植物系统与演化ꎬ(E ̄mail)yuwenbin@ xtbg.ac.cnꎮ

