Page 108 - 《广西植物》2025年第4期
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7 2 2                                  广  西  植  物                                         45 卷
                                       表 3  广藿香叶绿体基因组基因功能注释与分类
                    Table 3  Functional annotation and classification of chloroplast genome genes in Pogostemon cablin

                                                                                                       基因数
                  基因功能        基因分类                             基因名
                                                                                                        Gene
                Gene function  Gene category                   Gene name
                                                                                                       number
                  光合作用        光系统 I                            psaAꎬ psaBꎬ psaCꎬ psaIꎬ psaJ              5
                Photosynthesis  Photosystem I

                              光系统Ⅱ                             psbAꎬ psbBꎬ psbCꎬ psbDꎬ psbEꎬ psbFꎬ psbHꎬ psbIꎬ psbJꎬ  15
                              Photosystem Ⅱ                    psbKꎬ psbLꎬ psbMꎬ psbNꎬ psbTꎬ psbZ
                              NADH 脱氢酶                         ndhA∗ꎬ ndhB ∗ ( 2 )ꎬ ndhCꎬ ndhDꎬ ndhEꎬ ndhFꎬ  12
                              NADH dehydrogenase               ndhGꎬ ndhHꎬ ndhIꎬ ndhJꎬ ndhK
                              细胞色素 b / f 复合体                   petAꎬ petB∗ꎬ petD∗ꎬ petGꎬ petLꎬ petN      6
                              Cytochrome b / f complex
                              ATP 合成酶                          atpAꎬ atpBꎬ atpEꎬ atpF∗ꎬ atpHꎬ atpI       6
                              ATP synthase
                              二磷酸核酮糖羧化酶大亚基                     rbcL                                      1
                              RubisCO large subunit
                  自我复制        核糖体蛋白大亚基                         rpl14ꎬ rpl16 ∗ꎬ rpl2 ∗ ( 2)ꎬ rpl20ꎬ rpl22ꎬ rpl23 ( 2)ꎬ  11
                Self ̄replication  Large subunit of ribosomal protein (LSU)  rpl32ꎬ rpl33ꎬ rpl36
                              核糖体蛋白小亚基                         rps11ꎬ rps12 ∗∗ ( 2 )ꎬ rps14ꎬ rps15ꎬ rps16 ∗ꎬ rps18ꎬ  14
                              Small subunit of ribosomal protein (SSU)  rps19ꎬ rps2ꎬ rps3ꎬ rps4ꎬ rps7(2)ꎬ rps8
                              RNA 聚合酶                          rpoAꎬ rpoBꎬ rpoC1∗ꎬ rpoC2                 4
                              RNA polymerase
                              核糖体 RNA                          rrn16(2)ꎬ rrn23(2)ꎬ rrn4.5(2)ꎬ rrn5(2)    8
                              Ribosomal RNAs

                              转运 RNA                           trnA ̄UGC∗( 2)ꎬ trnC ̄ACA∗ꎬ trnC ̄GCAꎬ trnD ̄GUCꎬ  37
                              Transfer RNAs                    trnE ̄UUCꎬ trnF ̄GAAꎬ trnG ̄GCCꎬ trnH ̄GUGꎬ trnI ∗
                                                               (2)ꎬtrnK ̄UUU∗ꎬ trnL ̄CAA( 2)ꎬ trnL ̄UAA∗ꎬ trnL ̄
                                                               UAGꎬ trnM ̄CAU(3)ꎬ trnN ̄GUU(2)ꎬ trnP ̄UGGꎬ trnQ ̄
                                                               UUGꎬ trnR ̄ACG ( 2 )ꎬ trnR ̄UCUꎬ trnS ̄CGA ∗ꎬ trnS ̄
                                                               GCUꎬ trnS ̄GGAꎬ trnS ̄UGAꎬ trnT ̄GGUꎬ trnT ̄UGUꎬ
                                                               trnV ̄GAC(2)ꎬ trnW ̄CCAꎬ trnY ̄GUAꎬ trnfM ̄CAU

                  其他基因        成熟酶                              matK                                      1
                 Other genes  Maturase
                              蛋白酶                              clpP∗∗                                    1
                              Protease
                              包膜蛋白                             cemA                                      1
                              Envelope membrane protein
                              乙酰辅酶 A 羧化酶                       accD                                      1
                              Subunit of acetyl ̄CoA ̄carboxylase
                              C 型细胞色素合成酶                       ccsA                                      1
                              C ̄type cytochrome synthase
                              翻译起始因子                           infA                                      1
                              Translation initiation factor
                未知功能基因        假定叶绿体阅读框(ycf)                    ycf1ꎬ ycf15(2)ꎬ ycf2(2)ꎬ ycf3∗∗ꎬ ycf4     7
             Unknown function gene  Hypothetical chloroplast reading frame (ycf)
              注: ∗表示基因含有 1 个内含子ꎻ ∗∗表示基因含有 2 个内含子ꎻ ( )中数字表示多拷贝基因的拷贝数ꎮ
              Note: ∗ indicates gene containing one intronꎻ ∗∗ indicates gene containing two intronsꎻ numbers in ( ) indicate the number of genes
            with duplicate copies.
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