Page 108 - 《广西植物》2025年第4期
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表 3 广藿香叶绿体基因组基因功能注释与分类
Table 3 Functional annotation and classification of chloroplast genome genes in Pogostemon cablin
基因数
基因功能 基因分类 基因名
Gene
Gene function Gene category Gene name
number
光合作用 光系统 I psaAꎬ psaBꎬ psaCꎬ psaIꎬ psaJ 5
Photosynthesis Photosystem I
光系统Ⅱ psbAꎬ psbBꎬ psbCꎬ psbDꎬ psbEꎬ psbFꎬ psbHꎬ psbIꎬ psbJꎬ 15
Photosystem Ⅱ psbKꎬ psbLꎬ psbMꎬ psbNꎬ psbTꎬ psbZ
NADH 脱氢酶 ndhA∗ꎬ ndhB ∗ ( 2 )ꎬ ndhCꎬ ndhDꎬ ndhEꎬ ndhFꎬ 12
NADH dehydrogenase ndhGꎬ ndhHꎬ ndhIꎬ ndhJꎬ ndhK
细胞色素 b / f 复合体 petAꎬ petB∗ꎬ petD∗ꎬ petGꎬ petLꎬ petN 6
Cytochrome b / f complex
ATP 合成酶 atpAꎬ atpBꎬ atpEꎬ atpF∗ꎬ atpHꎬ atpI 6
ATP synthase
二磷酸核酮糖羧化酶大亚基 rbcL 1
RubisCO large subunit
自我复制 核糖体蛋白大亚基 rpl14ꎬ rpl16 ∗ꎬ rpl2 ∗ ( 2)ꎬ rpl20ꎬ rpl22ꎬ rpl23 ( 2)ꎬ 11
Self ̄replication Large subunit of ribosomal protein (LSU) rpl32ꎬ rpl33ꎬ rpl36
核糖体蛋白小亚基 rps11ꎬ rps12 ∗∗ ( 2 )ꎬ rps14ꎬ rps15ꎬ rps16 ∗ꎬ rps18ꎬ 14
Small subunit of ribosomal protein (SSU) rps19ꎬ rps2ꎬ rps3ꎬ rps4ꎬ rps7(2)ꎬ rps8
RNA 聚合酶 rpoAꎬ rpoBꎬ rpoC1∗ꎬ rpoC2 4
RNA polymerase
核糖体 RNA rrn16(2)ꎬ rrn23(2)ꎬ rrn4.5(2)ꎬ rrn5(2) 8
Ribosomal RNAs
转运 RNA trnA ̄UGC∗( 2)ꎬ trnC ̄ACA∗ꎬ trnC ̄GCAꎬ trnD ̄GUCꎬ 37
Transfer RNAs trnE ̄UUCꎬ trnF ̄GAAꎬ trnG ̄GCCꎬ trnH ̄GUGꎬ trnI ∗
(2)ꎬtrnK ̄UUU∗ꎬ trnL ̄CAA( 2)ꎬ trnL ̄UAA∗ꎬ trnL ̄
UAGꎬ trnM ̄CAU(3)ꎬ trnN ̄GUU(2)ꎬ trnP ̄UGGꎬ trnQ ̄
UUGꎬ trnR ̄ACG ( 2 )ꎬ trnR ̄UCUꎬ trnS ̄CGA ∗ꎬ trnS ̄
GCUꎬ trnS ̄GGAꎬ trnS ̄UGAꎬ trnT ̄GGUꎬ trnT ̄UGUꎬ
trnV ̄GAC(2)ꎬ trnW ̄CCAꎬ trnY ̄GUAꎬ trnfM ̄CAU
其他基因 成熟酶 matK 1
Other genes Maturase
蛋白酶 clpP∗∗ 1
Protease
包膜蛋白 cemA 1
Envelope membrane protein
乙酰辅酶 A 羧化酶 accD 1
Subunit of acetyl ̄CoA ̄carboxylase
C 型细胞色素合成酶 ccsA 1
C ̄type cytochrome synthase
翻译起始因子 infA 1
Translation initiation factor
未知功能基因 假定叶绿体阅读框(ycf) ycf1ꎬ ycf15(2)ꎬ ycf2(2)ꎬ ycf3∗∗ꎬ ycf4 7
Unknown function gene Hypothetical chloroplast reading frame (ycf)
注: ∗表示基因含有 1 个内含子ꎻ ∗∗表示基因含有 2 个内含子ꎻ ( )中数字表示多拷贝基因的拷贝数ꎮ
Note: ∗ indicates gene containing one intronꎻ ∗∗ indicates gene containing two intronsꎻ numbers in ( ) indicate the number of genes
with duplicate copies.

