Page 113 - 《广西植物》2025年第4期

４ 期 行冰楠等: 不同来源广藿香叶绿体基因组研究 ７ ２ ７

节点数值表示自展支持率ꎮ
Ｎｕｍｂｅｒｓ ａｔ ｎｏｄｅｓ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｔｈｅ ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｓｕｐｐｏｒｔ ｖａｌｕｅ.
图 ８ 基于广藿香 ２０ 条叶绿体全基因组构建的系统发育树(ＭＬ)
Ｆｉｇ. ８ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ (ＭＬ) ｂａｓｅｄ ｏｎ ２０ Ｐｏｇｏｓｔｅｍｏｎ ｃａｂｌｉｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ

绿体基因组共线性结果为单线型ꎬ未见重排或倒 各种生物体的基因检测( Ｂｅｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３)ꎮ 本研
置ꎬ说明本研究中广藿香样品的叶绿体基因组结 究检测出 ７４ ~ ７６ 个 ＳＳＲ 及 １５ ~ １８ 个回文重复序
构高度保守ꎮ 与以往广藿香叶绿体基因组研究相 列、１２ ~ １７ 个正向重复序列ꎬ首次报道广藿香叶绿
比ꎬＨｅ 等(２０１６)首次报道完整的广藿香叶绿体基 体基因组 ＬＳＣ 区存在 １ 个 ２０５ ｂｐ 的回文重复片
因组(ＮＣＢＩ 登录号:ＫＸ２３０８３４)ꎬ为广东阳春广藿 段ꎬ这些片段还需进一步深入验证ꎬ可能可用于广
香的叶绿体基因组ꎬ但经 ＭＵＭｍｅｒ ｖ３.２３ 检查ꎬ该 藿香物种的分子鉴定ꎮ
序列 ＬＳＣ 区的部分序列连接在 ＩＲａ 区之后ꎬ其与 同义密码子的使用是控制基因表达的基本且
广藿香参考基因组序列( ＮＣ＿０４２７９６.１) 共线性结 保守的机制ꎬ密码子的最优性对个体表达具有重
果不佳ꎮ 但是ꎬ与 Ｚｈａｎｇ 等(２０２０) 的研究相比ꎬ本 要性(Ｂａｒｒｉｎｇｔｏｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０２３)ꎮ 本研究检测到共有
研究样品来源更加丰富且具有代表性ꎮ 样品来源 ６４ 种密码子编码 ２０ 个氨基酸ꎬ同义密码子相对使
于广藿香不同的中国主产地ꎬ如云浮( ＹＦ２、Ｐ１、Ｐ３ 用度分析结果表明广藿香叶绿体基因组主要偏好
等)、肇庆(ＧＹ、ＺＱＸＹ、ＺＱＳＰ)、湛江遂溪( ＳＸ)、阳 第三位碱基为 Ａ 或 Ｕ 的密码子ꎬ这与已报道的大
春(ＹＣ、ＹＣ２)、海南( ＧＳＹ＿ＨＮ) 等ꎬ此外还涉及石 多数药 用 植 物 相 关 分 析 的 结 果 ( Ｍｏｒｔｏｎꎬ １９９３ꎻ
牌广藿香的保种地广东食品药品职业学院( ＧＳＹ＿ Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８ꎻ Ｗｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１ꎻ Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ
ＳＰ)ꎬ以及国外来源地如越南( ＧＳＹ＿ＹＮ)、马来西 ２０２２ꎻＧｕｏ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)相一致ꎮ
亚(ＧＳＹ＿ＭＬＸＹ) 等ꎮ 这 ２０ 个不同来源广藿香的 ３.２ 不同来源广藿香叶绿体基因组的差异
叶绿体基因组全长 １５２ ４６１ ~ １５２ ５１０ ｂｐꎬＧＣ 含量 ２０ 个不同来源广藿香叶绿体基因组中ꎬＧＳＹ＿
约为 ３８.２％ꎬ注释得到 １３２ 个基因ꎬ这些基因中包 ＭＬＸＹ 的基因组长度最大ꎬ为 １５２ ５１０ ｂｐꎬＰ７ 等次

含 ８７ 个 ＣＤＳ、３７ 个 ｔＲＮＡ 基因和 ８ 个 ｒＲＮＡ 基因ꎬ 之ꎬＰ１ 等 长 度 最 小ꎻ ＧＳＹ ＿ ＭＬＸＹ 的 ＳＳＣ 长 度 为
这也与大部分叶绿体基因组研究中的功能基因结 １７ ５７１ ｂｐꎬ其余均为 １７ ５８４ ｂｐꎻＧＳＹ＿ＭＬＸＹ 的 ＩＲ
果相似ꎮ 区长度为 ２５ ６６４ ｂｐꎬ其余均为 ２５ ６６２ ｂｐꎻＧＳＹ＿
ＳＳＲ 标记是基于 ＤＮＡ 的有效分子标记ꎬ用于 ＭＬＸＹ 的 ＬＳＣ 长度为 ８３ ６１１ ｂｐꎬ与 Ｐ１ 等和 Ｐ７ 等