Page 131 - 《广西植物》2025年第5期

５ 期 黄以书等: 太子参 Ｒ２Ｒ３￣ＭＹＢ 转录因子鉴定及表达分析 ９ ３ ５

表 ２ ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 蛋白基本信息及理化性质预测
Ｔａｂｌｅ ２ Ｂａｓｉｃ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｈｙｓｉｃｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｙ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ ｐｒｏｔｅｉｎ
氨基酸数量
编号 相对分子质量 不稳定指数 脂溶指数 亲疏水性
Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ 等电点 亚细胞定位
Ｓｅｒｉａｌ Ｒｅｌａｔｉｖｅ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｉｎｓｔａｂｉｌｉｔｙ Ａｌｉｐｈａｔｉｃ Ｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃ ａｎｄ
ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓ ｐＩ Ｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒ ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ
ｎｕｍｂｅｒ ｍａｓｓ (Ｄａ) ｉｎｄｅｘ ｉｎｄｅｘ ｈｙｄｒｏｐｈｏｂｉｃ
(ａａ)
ＰｈＭＹＢ１ ３１３ ３５ ３３１.１５ ４１.１１ ５７.９９ －０.８５４ ６.１６ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ２ ４５０ ５０ ９８２.４９ ５６.６１ ７３.８９ －０.６６８ ７.２１ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ３ ２７４ ３０ ９９３.１０ ３１.０５ ７６.５７ －０.７０７ ８.８２ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ４ ３２０ ３６ ６６５.６３ ６９.５０ ６５.９１ －０.７７８ ４.９４ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ５ ２９７ ３２ ５７５.７０ ４９.６４ ６８.３２ －０.６３０ ８.５９ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ６ ２６８ ３０ ９４０.００ ５４.９４ ７２.７２ －０.６８７ ８.７２ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ７ ３４１ ３８ ２２９.４７ ５７.０５ ６６.１０ －０.８５８ ６.４７ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ８ ２６７ ２９ ０５５.６６ ４４.８６ ６３.６０ －０.６５４ ９.１５ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ９ ２８７ ３１ ４１４.２５ ４７.２９ ６８.６４ －０.６１９ ６.９６ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ１０ ２７９ ３２ ２１８.３１ ４９.５２ ７０.１８ －０.８９０ ８.８６ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ１１ ２５０ ２７ ５２１.３３ ４９.０６ ５６.９２ －０.８３７ ６.０１ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ１２ ２８６ ３２ ４１８.６３ ５５.４４ ６１.４０ －０.８９２ ５.３０ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ１３ ２２１ ２４ ４７６.３６ ５５.１４ ６３.４８ －０.７５２ ６.８７ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ１４ ６６７ ７５ ８７２.４４ ５５.８９ ６５.１３ －０.９３０ ８.５１ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ
ＰｈＭＹＢ１５ １ ０１２ １１４ ３３５.７４ ４９.７７ ７３.９９ －０.９０４ ５.１９ 细胞核
Ｃｅｌｌ ｎｕｃｌｅｕｓ

２.２ ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 蛋白保守基序与特征结构域分析 复片段中都间隔 １ 个色氨酸残基( Ｗ)ꎮ 除了保守
分析 １５ 个太子参 ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 蛋白的保守 的色氨酸残基外ꎬＲ２ 特征结构域中还有其他保守
基序ꎬ 鉴 定 到 ５ 个 保 守 基 序 ( 图 １ )ꎬ 大 多 数 的氨基酸残基ꎬ如甘氨酸(Ｇ)、谷氨酸( Ｅ)、天冬氨
ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 家族成员都包含 Ｍｏｔｉｆ １、Ｍｏｔｉｆ ２ 和 酸(Ｄ)ꎻＲ３ 特征结构域中有甘氨酸( Ｇ)、谷氨酸
Ｍｏｔｉｆ ４ 这 ３ 个 高 度 保 守 的 基 序ꎬ 表 明 ＰｈＲ２Ｒ３￣ (Ｅ)、天冬氨酸( Ｄ)、异亮氨酸( Ｉ)、赖氨酸( Ｋ) 等
ＭＹＢ 家族基序保守性强且大多位于蛋白序列 Ｎ 保守氨基酸残基ꎮ
端ꎻ所有成员都含有 Ｍｏｔｉｆ ２ 基序ꎬ这是识别 Ｒ２Ｒ３￣ ２.３ 太子参 ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 转录因子的系统进化
ＭＹＢ 蛋白的重要标志ꎮ 结合系统进化分析发现ꎬ 分析
同一 ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 亚家族具有相似的基序种类与 利用鉴定的 ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 蛋白与 １２６ 个拟南

分布ꎬ不同亚家族在种类与分布上具有较大差异ꎮ 芥 Ｒ２Ｒ３￣ＭＹＢ 蛋白构建系统进化树( 图 ３)ꎮ 结合
进一步对上述 １５ 个蛋白的 Ｒ２Ｒ３￣ＭＹＢ 结构域进 拟南芥 Ｒ２Ｒ３￣ＭＹＢ 蛋白亚组的分类( Ｄｕｂｏｓ ｅｔ ａｌ.ꎬ
行多重序列比对ꎬ结果( 图 ２) 显示ꎬ所有蛋白成员 ２０１０)ꎬ将 １５ 个 ＰｈＲ２Ｒ３￣ＭＹＢ 转录因子分为 ８ 个
都具有 ＭＹＢ 结构域的重要特征ꎬ即每个 ＭＹＢ 重 亚组(Ｃ１－Ｃ８)ꎬ其中 ６ 个亚组能与拟南芥已分类