Page 59 - 《广西植物》2025年第5期
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５ 期 熊霜等: 三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析 ８ ６ ３
表 ３ 三脉水丝梨叶绿体基因组密码子偏好性分析
Ｔａｂｌｅ ３ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｏｄｏｎ ｐｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ Ｓｙｃｏｐｓｉｓ ｔｒｉｐｌｉｎｅｒｖｉａ
氨基酸 密码子 数量 氨基酸 密码子 数量
ＲＳＣＵ ＲＳＣＵ
Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ
苯丙氨酸 Ｐｈｅ ＵＵＵ∗ ７３９ １.２７ 丙氨酸 Ａｌａ ＧＣＵ ５６７ １.８８
ＵＵＣ ４２２ ０.７３ ＧＣＣ １７４ ０.５８
亮氨酸 Ｌｅｕ ＵＵＡ ６９０ １.８６ ＧＣＡ ３４０ １.１３
ＵＵＧ ４６９ １.２７ ＧＣＧ １２５ ０.４１
ＣＵＵ∗ ４７１ １.２７ 终止密码子 ＴＥＲ ＵＡＡ ２７ １.５３
ＣＵＣ １４２ ０.３８ ＵＡＧ １３ ０.７４
ＣＵＡ ２９７ ０.８０ ＵＧＡ １３ ０.７４
ＣＵＧ １５２ ０.４１ 组氨酸 Ｈｉｓ ＣＡＵ ４０９ １.５４
异亮氨酸 Ｉｌｅ ＡＵＵ ８８５ １.４５ ＣＡＣ １２３ ０.４６
ＡＵＣ ３９１ ０.６４ 谷氨酰胺 Ｇｌｎ ＣＡＡ ５８８ １.５３
ＡＵＡ ５５９ ０.９１ ＣＡＧ １８３ ０.４７
甲硫氨酸 Ｍｅｔ ＡＵＧ ５０４ １.００ 天冬酰胺 Ａｓｎ ＡＡＵ∗ ８０１ １.５７
缬氨酸 Ｖａｌ ＧＵＵ ４１７ １.４１ ＡＡＣ ２２２ ０.４３
ＧＵＣ １３４ ０.４５ 赖氨酸 Ｌｙｓ ＡＡＡ ７９９ １.５１
ＧＵＡ∗ ４５３ １.５４ ＡＡＧ ２５９ ０.４９
ＧＵＧ １７５ ０.５９ 天冬氨酸 Ａｓｐ ＧＡＵ∗ ７１４ １.６０
丝氨酸 Ｓｅｒ ＵＣＵ ４４８ １.６７ ＧＡＣ １８１ ０.４０
ＵＣＣ ２５３ ０.９５ 谷氨酸 Ｇｌｕ ＧＡＡ ８７１ １.５２
ＵＣＡ∗ ３２４ １.２１ ＧＡＧ ２７８ ０.４８
ＵＣＧ １５４ ０.５８ 半胱氨酸 Ｃｙｓ ＵＧＵ １８９ １.５６
ＡＧＵ ３３８ １.２６ ＵＧＣ ５４ ０.４４
ＡＧＣ ８８ ０.３３ 色氨酸 Ｔｒｐ ＵＧＧ ３８１ １.００
脯氨酸 Ｐｒｏ ＣＣＵ ３７１ １.６５ 精氨酸 Ａｒｇ ＣＧＵ ２８５ １.３４
ＣＣＣ １６４ ０.７３ ＣＧＣ ８０ ０.３８
ＣＣＡ ２６２ １.１７ ＣＧＡ ２９２ １.３７
ＣＣＧ １０２ ０.４５ ＣＧＧ ９４ ０.４４
苏氨酸 Ｔｈｒ ＡＣＵ ４３５ １.５９ ＡＧＡ ３９２ １.８４
ＡＣＣ ２１１ ０.７７ ＡＧＧ １３７ ０.６４
ＡＣＡ∗ ３３３ １.２２ 甘氨酸 Ｇｌｙ ＧＧＵ ５０８ １.３５
ＡＣＧ １１２ ０.４１ ＧＧＣ １４８ ０.３９
酪氨酸 Ｔｙｒ ＵＡＵ∗ ６４８ １.６２ ＧＧＡ∗ ６１０ １.６２
ＵＡＣ １５３ ０.３８ ＧＧＧ ２４１ ０.６４
注: ∗表示最优密码子ꎮ
Ｎｏｔｅ: ∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｏｐｔｉｍａｌ ｃｏｄｏｎ.
高度保守的特点ꎮ 三脉水丝梨叶绿体基因组的总
３ 讨论与结论 ＧＣ 含量低于总 ＡＴ 含量且 ＩＲ 区的 ＧＣ 含量比 ＬＳＣ
区和 ＳＳＣ 区要高ꎮ ＡＴ 含量高可能是由于同义密码
３.１ 保守的叶绿体基因组结构 子大多以 Ａ/ Ｕ 结尾ꎬ这与进化过程中的自然选择和
三脉水丝梨叶绿体基因组在结构、大小、基因 突变有关 ( Ｓｈｉｍｄａ ＆ Ｓｕｇｉｕｒｏꎬ １９９１ꎻ Ｃｌｅｇｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ
的数量、总 ＧＣ 含量及 ４ 个区域的长度和 ＧＣ 含量上 １９９４ꎻ Ｌｉｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９)ꎮ 此外ꎬｒＲＮＡ 基因均位于 ＩＲ
均与金缕梅科檵木属、蜡瓣花属及蚊母树属物种基 区且自身具有较高的 ＧＣ 含量ꎬ因此 ＩＲ 区 ＧＣ 含量
本一致(Ｄｏｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１ꎻ Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎬ具有 相对更高(Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２ꎻ Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎮ
