Page 67 - 《广西植物》2025年第5期

５ 期 熊霜等: 三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析 ８ ７ １

ＬＩ ＪＨꎬ ＢＯＧＬＥ ＡＬꎬ ＫＬＥＩＮ ＡＳꎬ １９９９ａ. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ＴＩＬＬＩＣＨ Ｍꎬ ＬＥＨＷＡＲＫ Ｐꎬ ＰＥＬＬＩＺＺＥＲ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７.
ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ: ｅｖｉｄｅｎｃｅ ｆｒｏｍ ｔｈｅ ＧｅＳｅｑ — ｖｅｒｓａｔｉｌｅ ａｎｄ ａｃｃｕｒａｔｅ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ ｏｒｇａｎｅｌｌｅ
ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｅ ｍａｔＫ [Ｊ]. Ｐｌａｎｔ ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ４５(Ｗ１): Ｗ６－Ｗ１１.
Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ２１８(３/ ４): ２０５－２１９. ＶＡＮ ＤＥＲ ＢＵＲＧＴ Ａꎬ ＪＡＳＨＮＩ ＭＫꎬ ＢＡＨＫＡＬＩ ＡＨꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ
ＬＩ ＪＨꎬ ＢＯＧＬＥ ＡＬꎬ ＫＬＥＩＮ ＡＳꎬ １９９９ｂ. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ２０１４. Ｐｓｅｕｄｏｇｅｎｉｚａｔｉｏｎ ｉｎ ｐａｔｈｏｇｅｎｉｃ ｆｕｎｇｉ ｗｉｔｈ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ
ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ ｉｎｆｅｒｒｅｄ ｆｒｏｍ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｈｏｓｔ ｐｌａｎｔｓ ａｎｄ ｌｉｆｅｓｔｙｌｅｓ ｍｉｇｈｔ ｒｅｆｌｅｃｔ ｔｈｅｉｒ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｐａｓｔ
ｏｆ ｉｎｔｅｒｎａｌ ｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｓｐａｃｅｒｓ (ＩＴＳ) ｏｆ ｎｕｃｌｅａｒ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ [Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｌａｎｔ Ｐａｔｈｏｌｏｇｙꎬ １５(２): １３３－１４４.
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ＬＩＵ Ｘꎬ ＣＨＡＮＧ ＥＭꎬ ＬＩＵ ＪＦꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９. Ｃｏｍｐｌｅｔｅ [Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｉｎｔｅｇｒａｔｉｖｅ Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ ５３(４): ３２４－３３４.
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＷＡＮＧ ＮＪꎬ ＣＨＥＮ ＳＦꎬ ＸＩＥ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ
Ｑｕｅｒｃｕｓ ｂａｗａｎｇｌｉｎｇｅｎｓｉｓ Ｈｕａｎｇꎬ Ｌｉ ｅｔ Ｘｉｎｇꎬ ａ ｖｕｌｎｅｒａｂｌｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｔｈｒｅｅ Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ ｓｐｅｃｉｅｓ:
ｏａｋ ｔｒｅｅ ｉｎ Ｃｈｉｎａ [Ｊ]. Ｆｏｒｅｓｔｓꎬ １０(７): ５８７. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｅｓ [ Ｊ]. Ｅｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ
ＮＧＵＹＥＮ ＬＴꎬ ＳＣＨＭＩＤＴ ＨＡꎬ ＶＯＮ ＨＡＥＳＥＬＥＲ Ａꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ １２(２): ｅ８６３７.
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ｅｓｔｉｍａｔｉｎｇ ｍａｘｉｍｕｍ￣ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｅｓ [ Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｆｒｅｑｕｅｎｔ ｐｓｅｕｄｏｇｅｎｉｚａｔｉｏｎ ａｎｄ ｌｏｓｓ ｏｆ ｔｈｅ ｐｌａｓｔｉｄ￣ｅｎｃｏｄｅｄ
Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ３２(１): ２６８－２７４. ｓｕｌｆａｔｅ￣ｔｒａｎｓｐｏｒｔ ｇｅｎｅ ｃｙｓＡ ｔｈｒｏｕｇｈｏｕｔ ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ
ＮＩＥ Ｘꎬ ＤＥＮＧ Ｐꎬ ＦＥＮＧ Ｋꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１４. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｌｉｖｅｒｗｏｒｔｓ [ Ｊ ]. Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ ９８(８):
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ＮＩＥ Ｘꎬ ＬＶ Ｓꎬ ＺＨＡＮＧ Ｙꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２. Ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔꎬ ａｎｄ ｎｕｃｌｅａｒ ＤＮＡｓ [ Ｊ]. Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ
ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ａ ｍａｊｏｒ ｉｎｖａｓｉｖｅ ｓｐｅｃｉｅｓꎬ ｃｒｏｆｔｏｎ ｗｅｅｄ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ ｏｆ
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ＰＥＮＧ Ｙꎬ ＹＡＮＧ Ｌꎬ ＷＥＩ Ｊꎬ ２０２０. Ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ａｎｃｉｅｎｔ ａｎｄ ｒｅｃｅｎｔ ｄｉｓｐｅｒｓａｌｓ ｉｎ ｔｈｅ ｐａｎｔｒｏｐｉｃａｌ
ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｓｙｃｏｐｓｉｓ ｓｉｎｅｎｓｉｓ Ｏｌｉｖｅｒ [Ｊ]. Ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ＤＮＡ Ｈａｍａｍｅｌｉｄａｃｅａｅ [ Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｇｅｏｇｒａｐｈｙꎬ ４６ (１１):
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ｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅ ａｎｄ ｐｏｌｙｐｈｅｎｏｌ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ [ Ｊ ]. Ｐｌａｎｔ １４(２): ３７８.
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ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｌａｒｇｅ ｄａｔａ ｓｅｔｓ [ Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｏｅａ ｈｙｇｒｏｍｅｔｒｉｃａ: Ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｉｎｔｏ ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｐｌａｎｔ
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ＳＨＡＲＰ ＰＭꎬ ＥＭＥＲＹ ＬＲꎬ ＺＥＮＧ Ｋꎬ ２０１０. Ｆｏｒｃｅｓ ｔｈａｔ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｒｅｓｓꎻ Ｓｔ. Ｌｏｕｉｓ: Ｍｉｓｓｏｕｒｉ Ｂｏｔａｎｉｃａｌ Ｇａｒｄｅｎ Ｐｒｅｓｓ:
ｉｎｆｌｕｅｎｃｅ ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｄｏｎ ｂｉａｓ [ Ｊ]. Ｐｈｉｌｏｓｏｐｈｉｃａｌ １８－４２.
Ｔｒａｎｓａｃｔｉｏｎｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｒｏｙａｌ Ｓｏｃｉｅｔｙ Ｂ￣ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ ＺＨＯＵ Ｍꎬ ＷＥＩ Ｌꎬ ＸＩＡ Ｌꎬ ２００８. Ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｓｙｎｏｎｙｍｏｕｓ ｃｏｄｏｎ
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ＳＨＩＭＤＡ Ｈꎬ ＳＵＧＩＵＲＯ Ｍꎬ１９９１. Ｆｉｎｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｆｅａｔｕｒｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｅｃｏｓｙｓｔｅｍｓꎬ １０(４): ２３５－２４２.
ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ: ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｄ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ １９(５): ９８３－９９５. (责任编辑 周翠鸣)