Page 15 - 《广西植物》2025年第7期
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7 期        陈东亮等: 大豆荫蔽胁迫响应基因 GmYUC2 的克隆、自然变异分析及 KASP 分子标记开发                                1 2 0 7

            2001)ꎬIAA 的生物合成途径受 YUC 基因家族诸多                      供基因资源ꎬ也为大豆种质的耐荫性分子标记快
            蛋白的表达调控( Mashiguchi et al.ꎬ 2011ꎻ Cao et           速鉴定提供新的参考ꎮ
            al.ꎬ 2019)ꎮ YUC 基因家族诸多基因在不同植物
            物种中广泛存在ꎬWang 等(2016) 已在大豆中鉴定                       1  材料与方法

            了 22 个 GmYUC 基因(GmYUC1-GmYUC22)ꎬWang
            等 ( 2016ꎬ 2019 ) 研 究 表 明ꎬ 大 豆 GmYUC1 -             1.1 材料种植
            GmYUC22 在不同逆境胁迫的诱导下会表现出不同                              本研究选择本课题组前期选出的 394 份中国

            的逆境适应性ꎮ 目前ꎬ有关 GmYUC 基因的克隆、                         南方大豆自然群体材料ꎬ来自中国南方 12 个省、
            自然变异特征、分子标记开发及其与大豆耐荫性                              自治区ꎬ其中春播大豆 175 份、夏播大豆 219 份ꎬ
            的适应关系等方面的研究甚少ꎬ在大豆中尚未发                              材料来源分布如表 1 所示ꎮ 对 394 份材料在广西
            现 GmYUC 基因响应荫蔽胁迫的相关报道ꎮ 本课                          农业科学院里建科研基地( 南宁市武鸣区)3 个环
            题组前期通过对 394 份中国南方大豆自然变异群                           境进行耐荫性鉴定( 张志鹏ꎬ2019)ꎮ 分别是 2015
            体重测序ꎬ并进行限制性二阶段多位点全基因组                              年夏播(7 月 1 日)、2016 年春播(3 月 20 日) 和夏
            关 联 分 析 ( restricted two ̄stage multi ̄locus genome  播(7 月 1 日)ꎮ 材料种植在 30%遮光度的遮荫棚
            wide association studyꎬRTM ̄GWAS)ꎬ在 5 号染色体          内ꎬ遮荫棚参考孙祖东等(2017) 的设计ꎮ 材料随
            上检测到与大豆耐荫性相关的显著单核苷酸多态                              机区组排列ꎬ以自然光下种植为对照ꎬ遮荫棚和自
            性 ( single nucleotide polymorphismꎬ SNP ) 位 点      然光下种植的材料均设 3 次重复ꎮ 每份材料种植
            (Gm05 _ LDB _ 40869887 _ 40886042 ) ( 张 志 鹏ꎬ       3 行ꎬ行长 1.2 mꎬ行距 0.4 mꎬ株距 0.1 mꎬ施肥灌水
            2019)ꎬ该 SNP 位点的候选区域中鉴定到的候选基                        保持均匀ꎬ常规田间管理ꎮ
            因 Glyma.05g231100 编码的蛋白是吲哚 ̄3 ̄丙酮酸
            单 加 氧 酶ꎬ 该 基 因 在 拟 南 芥 中 的 同 源 基 因                      表 1  394 份中国南方大豆自然群体材料
            AT4G13260 编码 YUC2 蛋白ꎬ而 YUC2 是生长素合                      Table 1  Natural population materials of 394
                                                                           soybeans in southern China
            成中的限速酶之一(Müller ̄Moulé et al.ꎬ 2016ꎻ Cao
            et al.ꎬ 2019ꎻ 张 志 鹏ꎬ 2019 )ꎮ 因 此ꎬ 将 基 因                 材料来源         春播大豆      夏播大豆
                                                                                  Soybean   Soybean   总计
                                                                    Source of
            Glyma.05g231100 命名为 GmYUC2 基因ꎮ                                        sowing    sowing    Total
                                                                     material
                                                                                  in spring  in summer
                 本研究在前期工作的基础上展开以下研究:
                                                                   安徽 Anhui         3        23        26
            (1) 以大豆极耐荫品种‘ 贡豆 7 号’ 为材料ꎬ采用
                                                                   福建 Fujian        21       19        40
            PCR 基因扩增技术进行 GmYUC2 基因克隆ꎻ( 2)
            基于中国南方 394 份大豆自然变异群体的重测                               广东 Guangdong      29       10        39
                                                                   广西 Guangxi       28       19        47
            序数据及 3 个环境下的耐荫指数( shade ̄tolerant
                                                                   贵州 Guizhou       19       22        41
            indexꎬSTI) 表型鉴定数据ꎬ借助 SoyBase 数据库ꎬ
            通过生物信息学方法分析 GmYUC2 基因序列的                               湖北 Hubei         8        20        28
                                                                   湖南 Hunan         16       13        29
            SNP 自 然 变 异 特 征ꎬ 并 利 用 关 联 分 析 法 挖 掘
            GmYUC2 基因的 SNP 变异和主要单倍型与荫蔽                             江苏 Jiangsu       8        23        31
            胁迫表型的关系ꎻ(3) 以大豆强耐荫品种( ‘ 矮脚                             江西 Jiangxi       12       18        30
            早’ 和‘ 贡豆 7 号’ ) 与不耐荫品种( ‘ 齐佩华’ 和                       四川 Sichuan       15       10        25
            ‘ 直 子 豆 ’ ) 为 材 料ꎬ 采 用 qRT ̄PCR 技 术 分 析                 云南 Yunnan        2        23        25
            GmYUC2 基因的表达模式ꎻ( 4) 利用 GmYUC2 基                        浙江 Zhejiang      14       19        33
                                                                    总计 Total       175       219       394
            因 的 SNP 变 异 开 发 KASP ( kompetitive allele ̄
            specific PCR) 分子标记ꎬ并以 18 份耐荫性已知的
            大豆材料对开发的 KASP 分子标记进行验证ꎮ 以                          1.2 表型采集
            期为深入解析大豆 GmYUC2 基因的主要功能和                               播种后 50 d 记录株高( plant heightꎬPH) 和主
            表达调控机制提供参考ꎬ为大豆耐荫生物育种提                              茎节数ꎬ计算 平 均 节 间 长 ( mean internode lengthꎬ
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