Page 15 - 《广西植物》2025年第7期
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7 期 陈东亮等: 大豆荫蔽胁迫响应基因 GmYUC2 的克隆、自然变异分析及 KASP 分子标记开发 1 2 0 7
2001)ꎬIAA 的生物合成途径受 YUC 基因家族诸多 供基因资源ꎬ也为大豆种质的耐荫性分子标记快
蛋白的表达调控( Mashiguchi et al.ꎬ 2011ꎻ Cao et 速鉴定提供新的参考ꎮ
al.ꎬ 2019)ꎮ YUC 基因家族诸多基因在不同植物
物种中广泛存在ꎬWang 等(2016) 已在大豆中鉴定 1 材料与方法
了 22 个 GmYUC 基因(GmYUC1-GmYUC22)ꎬWang
等 ( 2016ꎬ 2019 ) 研 究 表 明ꎬ 大 豆 GmYUC1 - 1.1 材料种植
GmYUC22 在不同逆境胁迫的诱导下会表现出不同 本研究选择本课题组前期选出的 394 份中国
的逆境适应性ꎮ 目前ꎬ有关 GmYUC 基因的克隆、 南方大豆自然群体材料ꎬ来自中国南方 12 个省、
自然变异特征、分子标记开发及其与大豆耐荫性 自治区ꎬ其中春播大豆 175 份、夏播大豆 219 份ꎬ
的适应关系等方面的研究甚少ꎬ在大豆中尚未发 材料来源分布如表 1 所示ꎮ 对 394 份材料在广西
现 GmYUC 基因响应荫蔽胁迫的相关报道ꎮ 本课 农业科学院里建科研基地( 南宁市武鸣区)3 个环
题组前期通过对 394 份中国南方大豆自然变异群 境进行耐荫性鉴定( 张志鹏ꎬ2019)ꎮ 分别是 2015
体重测序ꎬ并进行限制性二阶段多位点全基因组 年夏播(7 月 1 日)、2016 年春播(3 月 20 日) 和夏
关 联 分 析 ( restricted two ̄stage multi ̄locus genome 播(7 月 1 日)ꎮ 材料种植在 30%遮光度的遮荫棚
wide association studyꎬRTM ̄GWAS)ꎬ在 5 号染色体 内ꎬ遮荫棚参考孙祖东等(2017) 的设计ꎮ 材料随
上检测到与大豆耐荫性相关的显著单核苷酸多态 机区组排列ꎬ以自然光下种植为对照ꎬ遮荫棚和自
性 ( single nucleotide polymorphismꎬ SNP ) 位 点 然光下种植的材料均设 3 次重复ꎮ 每份材料种植
(Gm05 _ LDB _ 40869887 _ 40886042 ) ( 张 志 鹏ꎬ 3 行ꎬ行长 1.2 mꎬ行距 0.4 mꎬ株距 0.1 mꎬ施肥灌水
2019)ꎬ该 SNP 位点的候选区域中鉴定到的候选基 保持均匀ꎬ常规田间管理ꎮ
因 Glyma.05g231100 编码的蛋白是吲哚 ̄3 ̄丙酮酸
单 加 氧 酶ꎬ 该 基 因 在 拟 南 芥 中 的 同 源 基 因 表 1 394 份中国南方大豆自然群体材料
AT4G13260 编码 YUC2 蛋白ꎬ而 YUC2 是生长素合 Table 1 Natural population materials of 394
soybeans in southern China
成中的限速酶之一(Müller ̄Moulé et al.ꎬ 2016ꎻ Cao
et al.ꎬ 2019ꎻ 张 志 鹏ꎬ 2019 )ꎮ 因 此ꎬ 将 基 因 材料来源 春播大豆 夏播大豆
Soybean Soybean 总计
Source of
Glyma.05g231100 命名为 GmYUC2 基因ꎮ sowing sowing Total
material
in spring in summer
本研究在前期工作的基础上展开以下研究:
安徽 Anhui 3 23 26
(1) 以大豆极耐荫品种‘ 贡豆 7 号’ 为材料ꎬ采用
福建 Fujian 21 19 40
PCR 基因扩增技术进行 GmYUC2 基因克隆ꎻ( 2)
基于中国南方 394 份大豆自然变异群体的重测 广东 Guangdong 29 10 39
广西 Guangxi 28 19 47
序数据及 3 个环境下的耐荫指数( shade ̄tolerant
贵州 Guizhou 19 22 41
indexꎬSTI) 表型鉴定数据ꎬ借助 SoyBase 数据库ꎬ
通过生物信息学方法分析 GmYUC2 基因序列的 湖北 Hubei 8 20 28
湖南 Hunan 16 13 29
SNP 自 然 变 异 特 征ꎬ 并 利 用 关 联 分 析 法 挖 掘
GmYUC2 基因的 SNP 变异和主要单倍型与荫蔽 江苏 Jiangsu 8 23 31
胁迫表型的关系ꎻ(3) 以大豆强耐荫品种( ‘ 矮脚 江西 Jiangxi 12 18 30
早’ 和‘ 贡豆 7 号’ ) 与不耐荫品种( ‘ 齐佩华’ 和 四川 Sichuan 15 10 25
‘ 直 子 豆 ’ ) 为 材 料ꎬ 采 用 qRT ̄PCR 技 术 分 析 云南 Yunnan 2 23 25
GmYUC2 基因的表达模式ꎻ( 4) 利用 GmYUC2 基 浙江 Zhejiang 14 19 33
总计 Total 175 219 394
因 的 SNP 变 异 开 发 KASP ( kompetitive allele ̄
specific PCR) 分子标记ꎬ并以 18 份耐荫性已知的
大豆材料对开发的 KASP 分子标记进行验证ꎮ 以 1.2 表型采集
期为深入解析大豆 GmYUC2 基因的主要功能和 播种后 50 d 记录株高( plant heightꎬPH) 和主
表达调控机制提供参考ꎬ为大豆耐荫生物育种提 茎节数ꎬ计算 平 均 节 间 长 ( mean internode lengthꎬ

