Page 19 - 《广西植物》2025年第7期

７ 期 陈东亮等: 大豆荫蔽胁迫响应基因 ＧｍＹＵＣ２ 的克隆、自然变异分析及 ＫＡＳＰ 分子标记开发 １ ２ １ １

Ａ. ＧｍＹＵＣ２ 基因的结构及各单倍型变异所在位置ꎻ Ｂ. ＧｍＹＵＣ２ 在大豆中的单倍型ꎮ
Ａ. ＧｍＹＵＣ２ ｇｅｎｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｔｈｅ ｌｏｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｅａｃｈ ｈａｐｌｏｔｙｐｅ ｖａｒｉａｎｔꎻ Ｂ. ＧｍＹＵＣ２ ｈａｐｌｏｔｙｐｅ ｉｎ ｓｏｙｂｅａｎ.
图 ４ ＧｍＹＵＣ２ 基因的单倍型分析
Ｆｉｇ. ４ Ｈａｐｌｏｔｙｐｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＧｍＹＵＣ２ ｇｅｎｅ

耐荫型ꎬ并 且 强 耐 荫 种 质 ‘ 天 隆 一 号’ ‘ 天 隆 二
号’ ‘ 矮脚早’ ‘ 贡豆 ７ 号’ ‘ 云霄乌子豆’ ‘ 石拄
猪腰子’ 等( 孙祖东等ꎬ２０１７) 都属于 Ｈａｐ２ 单倍
型ꎮ 比较 Ｈａｐ１ 和 Ｈａｐ２ 两种主要单倍型的耐荫
性指数 ＳＴＩꎬ结果如图 ５ 所示ꎬＨａｐ２ 的 ＳＴＩ 极显著
低于 Ｈａｐ１ 的 ＳＴＩꎬＳＴＩ 值越低ꎬ说明大豆耐荫性越
强ꎬ这表明携有 Ｈａｐ２ 的大豆种质耐荫性比携有
Ｈａｐ１ 要强ꎬ单倍型 Ｈａｐ２ 可能存在更多的人工选
择ꎬ以适应间套作响应荫蔽胁迫ꎮ 因此ꎬ单倍型
Ｈａｐ２ 可 作 为 辅 助 选 择 耐 荫 种 质 的 ＳＮＰ 分 子
标记ꎮ
２.６ 利用 ＫＡＳＰ 标记鉴定大豆资源的基因型
利用多功能酶标仪检测荧光ꎬ根据读取的荧
图 ５ ＧｍＹＵＣ２ 基因的各单倍型表型 ｔ 检验 光ꎬ分别计算 ＦＡＭ / ＲＯＸ 和 ＨＥＸ / ＲＯＸ 的比值ꎬ绘
Ｆｉｇ. ５ ｔ￣ｔｅｓｔ ｆｏｒ ｅａｃｈ ｈａｐｌｏｔｙｐｅ ｏｆ ＧｍＹＵＣ２ ｇｅｎｅ
制坐标图(图 ６)ꎮ 本研究分别在 Ｃｈｒ０５＿４０８８６６１１
( ＳＮＰ２ )、 Ｃｈｒ０５ ＿ ４０８８６６９９ ( ＳＮＰ３ ) 和 Ｃｈｒ０５ ＿
种质的 １５.９９％ꎻ有 ７ 份种质为 Ｈａｐ４ 单倍型ꎬ仅占 ４０８８８６０９(ＳＮＰ４)位点开发出了 ＫＡＳＰ 分子标记ꎬ

供试种质的 １.７８％ꎮ 利用该 ＫＡＳＰ 分子标记对 １８ 份大豆材料进行鉴
２.５ ＧｍＹＵＣ２ 基因不同单倍型种质材料耐荫性筛选 定ꎬ结果如表 ４ 所示ꎮ ＫＡＳＰ 标记清楚地将 ３ 种基
对 ３９４ 份中国南方大豆 自 然 变 异 群 体 材 料 因 型 分 开ꎬ 从 ８ 份 强 耐 荫 种 质 ( ｓｈａｄｅ￣ｔｏｌｅｒａｎｔ
２０１５ 年春、２０１６ 年春和 ２０１６ 年夏 ３ 个环境下的 ｇｅｒｍｐｌａｓｍꎬＳＧ) 中检测出 ７ 份材料携带 ＴＴＡ 等位
ＳＴＩ 进行综合比较发现ꎬ所有供试种质可分为耐 变异位点ꎬ对强耐荫材料的选择率为 ８７.５％ꎻ从 １０
荫、中间型和不耐荫 ３ 种类型ꎮ 比较 ２ 种主要单 份不耐 荫 种 质 ( ｎｅｇａｔｉｖｅ ｓｈａｄｅ￣ｔｏｌｅｒａｎｔ ｇｅｒｍｐｌａｓｍꎬ
倍型的耐荫性发现ꎬＨａｐ１ 的种质中有 １９.１５％ 种 ＮＳＧ)中检测出未携带变异位点的有 ９ 份ꎬ基因型
质为耐荫型ꎬ６２.２３％ 种质为中间型和 １８.６２％ 种 为 ＣＣＧꎬ对不耐荫材料的选择率为 ９０.０％( ＣＣＧ 型
质为不耐荫型ꎻＨａｐ２ 的种质中有 ７８.８３％ 为耐荫 为参考基因组)ꎻ 将 １８ 份材料的基因型与表型比
型ꎬ２０.４４％种质为中间型ꎬ仅有 ０.７３％ 种质为不 对后发现两者的鉴定结果具有 ８８.８９％的高度一