Page 85 - 《广西植物》2025年第7期

７ 期 何斌等: 刺梨全长转录组测序分析及黄酮类化合物生物合成相关基因挖掘 １ ２ ７ ７

１. 细胞过程(１６ １４４)ꎻ ２. 代谢过程(１３ ６１４)ꎻ ３. 刺激响应(７ ７４３)ꎻ ４. 生物调节(７ ２０３)ꎻ ５. 生物过程的调节(６ ６６１)ꎻ ６. 发育
过程(４ ３０８)ꎻ ７. 多细胞生物过程(３ ８８３)ꎻ ８. 定位(３ ２４８)ꎻ ９. 信号(２ ７３７)ꎻ １０. 复制(２ ３８７)ꎻ １１. 生殖过程(２ ３７１)ꎻ １２. 物
种间相互作用的生物学过程(２ ２６９)ꎻ １３. 生物过程的负调控(１ ７８２)ꎻ １４. 生物过程的正调控(１ ６８１)ꎻ １５. 生长(１ ０８３)ꎻ １６. 细
胞解剖实体(１９ ８８４)ꎻ １７. 含蛋白质复合体(３ ２８１)ꎻ １８. 结合(１４ ３７６)ꎻ １９. 催化活性(１１ ９２０)ꎻ ２０. 转运蛋白活性(１ ７８７)ꎻ
２１. ＡＴＰ 依赖性活性(１ ５９０)ꎻ ２２. 转录调节因子活性(１ ４４１)ꎻ ２３. 分子传导器活性(５５８)ꎻ ２４. 分子功能调节因子活性(４６５)ꎻ
２５. 结构分子活性(３７４)ꎻ ２６. 翻译调节因子活性(２８６)ꎻ ２７. 细胞骨架马达活性(１４１)ꎻ ２８. 蛋白折叠伴侣(１３４)ꎻ ２９. 抗氧化活
性(１１０)ꎻ ３０. 分子适配器活性(８８)ꎻ ３１. 分子载体活性(６４)ꎻ ３２. 小分子传感器活性(６４)ꎮ
１. Ｃｅｌｌｕｌａｒ ｐｒｏｃｅｓｓ(１６ １４４)ꎻ ２. Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓ(１３ ６１４)ꎻ ３. Ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ｓｔｉｍｕｌｕｓ(７ ７４３)ꎻ ４. Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ(７ ２０３)ꎻ ５. Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ
ｏｆ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓ(６ ６６１)ꎻ ６. Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ｐｒｏｃｅｓｓ (４ ３０８)ꎻ ７. Ｍｕｌｔｉｃｅｌｌｕｌａｒ ｏｒｇａｎｉｓｍａｌ ｐｒｏｃｅｓｓ (３ ８８３)ꎻ ８. Ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ(３ ２４８)ꎻ
９. Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ(２ ７３７)ꎻ １０. Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ(２ ３８７)ꎻ １１. Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ ｐｒｏｃｅｓｓ(２ ３７１)ꎻ １２. Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓ ｉｎｖｏｌｖｅｄ ｉｎ ｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｅｓ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ
ｂｅｔｗｅｅｎ ｏｒｇａｎｉｓｍｓ(２ ２６９)ꎻ １３. Ｎｅｇａｔｉｖｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓ (１ ７８２)ꎻ １４. Ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓ (１ ６８１)ꎻ
１５. Ｇｒｏｗｔｈ(１ ０８３)ꎻ １６. Ｃｅｌｌｕｌａｒ ａｎａｔｏｍｉｃａｌ ｅｎｔｉｔｙ(１９ ８８４)ꎻ １７. Ｐｒｏｔｅｉｎ￣ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ ｃｏｍｐｌｅｘ(３ ２８１)ꎻ １８. Ｂｉｎｄｉｎｇ(１４ ３７６)ꎻ １９. Ｃａｔａｌｙｔｉｃ
ａｃｔｉｖｉｔｙ (１１ ９２０)ꎻ ２０. Ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ (１ ７８７)ꎻ ２１. ＡＴＰ￣ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ ａｃｔｉｖｉｔｙ (１ ５９０)ꎻ ２２. Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ (１ ４４１)ꎻ
２３. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｔｒａｎｓｄｕｃｅｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ ( ５５８)ꎻ ２４. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ ( ４６５)ꎻ ２５. Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｍｏｌｅｃｕｌｅ ａｃｔｉｖｉｔｙ ( ３７４)ꎻ ２６.
Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ(２８６)ꎻ ２７. Ｃｙｔｏｓｋｅｌｅｔａｌ ｍｏｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ(１４１)ꎻ ２８. Ｐｒｏｔｅｉｎ ｆｏｌｄｉｎｇ ｃｈａｐｅｒｏｎｅ(１３４)ꎻ ２９. Ａｎｔｉｏｘｉｄａｎｔ ａｃｔｉｖｉｔｙ(１１０)ꎻ
３０. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｄａｐｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ(８８)ꎻ ３１. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｃａｒｒｉｅｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ(６４)ꎻ ３２. Ｓｍａｌｌ ｍｏｌｅｃｕｌｅ ｓｅｎｓｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙ(６４).
图 ５ ＧＯ 功能分类
Ｆｉｇ. ５ ＧＯ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ

究鉴定出 １２ ５８８ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ利用 Ｐｒｉｍｅｒ ３ 软件 ＷＤ４０、ＷＲＫＹ、ｚｉｎｃ ｆｉｎｇｅｒ、ＭＡＤＳ ｂｏｘ ｐｒｏｔｅｉｎｓ) 参与
进行刺梨 ＳＳＲ 的引物设计ꎬ共筛得 １０ ５４５ 对 ＳＳＲ 到黄 酮 类 化 合 物 的 生 物 合 成 ( Ｌｅｐｉｎｉｅｃ ｅｔ ａｌ.ꎬ
引物ꎬ这一结果显示了刺梨 ＳＳＲ 位点的多态性ꎮ ２００６)ꎮ 在蔷薇科植物花青素生物合成的研究中
我国野生刺梨资源非常丰富ꎬ但遗传改良成果并 发现ꎬＭＹＢ１０ 的表达与果实和花朵中花青素的水
不理想(刘粉粉等ꎬ ２０２４)ꎮ 这些 ＳＳＲ 及引物将为 平相互关联ꎬ并且其功能已在烟草、草莓和苹果中
后续掌握刺梨野生种质资源收集、遗传背景信息 得到验证( Ｌｉｎ￣Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１０)ꎻ在关于菊花的
完善、关键基因挖掘及遗传改良研究奠定一定的 研究中ꎬＧｈＭＹＢ１ａ 通过直接调控黄酮途径的早期
理论基础ꎮ 基因(如查耳酮合成酶和黄酮醇合成酶) 的表达来
转录因子通过与靶基因启动子的顺式元件相 影响黄酮醇的积累(Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０)ꎻ在高温环
互作用或通过蛋白质－蛋白质相互作用来发挥其 境中 ＣｍＭＹＢ０１２ 被诱导表达ꎬ并直接调控黄酮合
功能ꎬ调控主要生物合成和发育途径的关键基因 酶 基 因 从 而 抑 制 黄 酮 生 物 合 成 ( Ｚｈｏｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ

的表达水平ꎬ对植物的正常生长和生存至关重要ꎮ ２０２１)ꎮ 对银杏中 ｂＨＬＨ 家族基因进行了全基因
此外ꎬ转录因子还在植物对生物和非生物胁迫条 组鉴定和表征ꎬ发现有 ７ 个 ｂＨＬＨ 参与到黄酮的生
件的 反 应 中 发 挥 重 要 作 用ꎬ 并 调 节 次 生 代 谢 物合成( Ｚｈｏｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０)ꎮ 在短莛飞蓬 ＷＲＫＹ

(Ｃｈｏｗｄｈａｒｙ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３)ꎮ 本研究共鉴定出 １ ９３０ 转录因子调控类黄酮生物合成的机制研究中发
个基因分属 ８２ 种转录因子家族ꎮ 此前针对拟南 现ꎬ有 ５ 种 ＥｂＷＲＫＹ 参与类黄酮生物合成(Ｓｏｎｇ ｅｔ
芥的研究表明ꎬ至少 ６ 种转录因子( ＭＹＢ、ｂＨＬＨ、 ａｌ.ꎬ ２０２４)ꎮ 本研究鉴定出 ５５ 个参与调节刺梨黄