Page 157 - 《广西植物》2025年第8期
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8 期               杨龙姣等: 二穗短柄草 BdFKF1 基因调控烟草开花的转录组学分析                                      1 5 2 3

                                             表 3  转录组数据质控与比对统计
                                Table 3  Transcriptome data quality control and comparison statistics
                样品            Reads 数        高质量序列 Reads 数        总比对率             唯一比对率        碱基识别正确率
                Sample      Reads number     Clean_Reads number  Total_mapped (%)  Uniquely_mapped (%)  Q30 (%)
               FKF1_1        38 646 086         36 339 668          95.95            96.82          93.70
               FKF1_2        44 249 346         41 569 778          95.86            96.92          93.79
               FKF1_3        45 227 638         42 600 358          96.28            96.87          93.68
                SR1_1        45 840 284         43 111 238          96.43            97.02          94.15
                SR1_2        39 273 338         36 961 722          96.31            96.76          94.14

                SR1_3        44 908 696         42 239 876          96.32            96.81          93.68
              注:FKF1_1、FKF1_2、FKF1_3. 转基因烟草的 3 个重复ꎻ SR1_1、SR1_2、SR1_3. 野生型烟草的 3 个重复ꎮ
              Note: FKF1_1ꎬ FKF1_2ꎬ FKF1_3. Three replicates of transgenic tobaccoꎻ SR1_1ꎬ SR1_2ꎬ SR1_3. Three replicates of wild ̄type
            tobacco.







































                                        图 3  SR1 vs FKF1 差异表达基因火山图分析
                               Fig. 3  SR1vs FKF1 volcano map analysis of differentially expressed genes



            基因会影响烟草开花时间ꎮ
            2.5 RT ̄qPCR 数据验证                                   3  讨论与结论

                 为验证转录组测序数据可靠性ꎬ随机挑选出 6
            个基因进行 RT ̄qPCR 验证ꎮ 验证结果如图 10 所                          烟草开花时间由多个基因相互协调调控ꎬ其
            示ꎬ其中选取的 6 个基因的表达量上调或下调趋                            基因调控网络十分复杂ꎮ Cheng 等(2022) 对野生
            势与转 录 组 测 序 数 据 一 致ꎬ 说 明 测 序 结 果 是 可               型和转 GhSAMDC1 基因 2 种体系烟草进行转录组
            靠的ꎮ                                                分析ꎬ 共发现 938 个差异表达基因(上调基因 569
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