Page 61 - 《广西植物》2026年第4期
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4 期              张梅娟等: 对萼猕猴桃 HMGR 基因家族的鉴定及其对淹水胁迫的响应                                         6 1 9

                                               表 1  实时荧光定量 PCR 引物
                                          Table 1  Quantitative real ̄time PCR primers
                    基因名称                        正向引物 (5′→3′)                         反向引物 (5′→3′)
                    Gene name                  Forward primer (5′→3′)              Reverse primer (5′→3′)
                    AvHMGR1a                  TTGCCAGAGGAATGCCGG                   CCTCGTCCTCCTCCGTCA
                    AvHMGR1b                  CAGCCGCAGTGAACTGGA                   TGAGCTCCACCAACGCTG
                    AvHMGR4a                  GAGCGCCGGTTGTTAGGT                   TGGAGCCTCGCAAACCTG
                    AvHMGR4b                  GAGCGCCGGTTGTTAGGT                   TGGAGCCTCGCAAACCTG
                    AvHMGR5a                  CAAGGGTGCGAGCAAGGA                   CAAGCTGGCCTGCTGCTA
                    AvHMGR5b                  ATGGCGGCAAGGACCTTC                   CCTTGCTCGCACCCTTGA
                    AvHMGR6a                  TTCGGTTCCCATGGCCAC                   ACAACACGCTGGTAGCCC
                    AvHMGR6b                  TTCGGTTCCCATGGCCAC                   ACAACACGCTGGTAGCCC
                    AvHMGR9a                  CAAAGCCCCCAAAACCGC                   AGTGGTGCCCGCAACTAC
                    AvHMGR9b                  TTCGGTTCCCATGGCCAC                   ACAACACGCTGGTAGCCC
                    AvHMGR21a                 GCCGCCATCATCTCCCTC                   CGTTGTCCCAGGCTTCGT
                    AvHMGR21b                 GCCGCCATCATCTCCCTC                  GAGGAGGAAGCGATCGGC
                     Av ̄actin                 GATGCTCCCAGGGCAGTG                   TCCTTCTGGCCCATCCCA


                                         表 2  对萼猕猴桃 HMGR 基因家族成员信息
                               Table 2  Information of HMGR gene family members in Actinidia valvata
                                                      氨基酸数量       分子质量
               基因名称         基因 ID         染色体 ID      Number of             等电点            亚细胞定位
                                                                Molecular weight
              Gene name     Gene ID     Chromosome ID  amino acids            pI        Subcellular localization
                                                                   (kDa)
                                                        (aa)
              AvHMGR1a   AVa01g00155.1     Ch1a         514        54.47     5.46     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR1b   AVb01g00158.1     Ch1b         578        61.85     6.35     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR4a   AVa04g00026.1     Ch4a         593        63.56     7.88     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR4b   AVb04g00029.1     Ch4b         591        63.30     8.15     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR5a   AVa05g00175.1     Ch5a         558        59.56     7.08     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR5b   AVb05g00181.1     Ch5b         556        59.23     7.17     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR6a   AVa06g00014.1     Ch6a         578        61.73     6.23     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR6b   AVb06g00011.1     Ch6b         576        61.57     6.13     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR9a   AVa09g00010.1     Ch9a         575        61.68     6.43     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR9b   AVb09g00009.1     Ch9b         577        61.67     6.43     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR21a  AVa21g00027.1     Ch21a        597        64.00     6.39     内质网 Endoplasmic reticulum
              AvHMGR21b  AVb21g00031.1     Ch21b        592        63.31     7.52     内质网 Endoplasmic reticulum


            2.2 AvHMGRs 基因家族成员系统进化分析                           Ⅲꎮ Cluster Ⅲ中 AvHMGR5a / b 与 AvHMGR1a / b 亲
                 为阐明 AvHMGRs 的系统进化关系及功能ꎬ利                      缘关系更近ꎬ而 AvHMGR6a / b 与 AvHMGR9a / b 亲缘
            用 MEGA 软件对拟南芥、烟草、水稻、玉米、对萼猕                         关系更近ꎻ另外ꎬAvHMGRs 与中华猕猴桃‘红阳’ 中
            猴桃以及中华猕猴桃‘ 红阳’ 中的 HMGR 蛋白氨                         的 HMGRs 具有高度同源性且 AvHMGRs 与位于相
            基酸序列进行了多重序列比对ꎬ并构建了系统进                              同染色体的 AcHMGRs 亲缘关系更近ꎮ
            化树(图 1)ꎮ 根据系统进化树的分支ꎬHMGR 共                         2.3 AvHMGRs 基因的系统进化树、蛋白保守基序、
            分为 3 个亚家族:Cluster I 中均为单子叶植物ꎬ无                     保守结构域和基因结构分析
            AvHMGRꎻ Cluster Ⅱ 中 包 含 AvHMGR4a / b 和                 通过对对萼猕猴桃种内系统分析ꎬ发现 12 个
            AvHMGR21a / bꎬ 与 AtHMGR1 聚 为 一 类ꎻ 其 余              AvHMGRs 主要归于两个主要分支( 图 2:A)ꎮ 为探
            AvHMGRs 成 员 与 AtHMGR2 聚 为 一 类ꎬ 为 Cluster           究 AvHMGRs 结 构 的 多 样 性ꎬ 通 过 MEME 对
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