Page 61 - 《广西植物》2026年第4期
P. 61
4 期 张梅娟等: 对萼猕猴桃 HMGR 基因家族的鉴定及其对淹水胁迫的响应 6 1 9
表 1 实时荧光定量 PCR 引物
Table 1 Quantitative real ̄time PCR primers
基因名称 正向引物 (5′→3′) 反向引物 (5′→3′)
Gene name Forward primer (5′→3′) Reverse primer (5′→3′)
AvHMGR1a TTGCCAGAGGAATGCCGG CCTCGTCCTCCTCCGTCA
AvHMGR1b CAGCCGCAGTGAACTGGA TGAGCTCCACCAACGCTG
AvHMGR4a GAGCGCCGGTTGTTAGGT TGGAGCCTCGCAAACCTG
AvHMGR4b GAGCGCCGGTTGTTAGGT TGGAGCCTCGCAAACCTG
AvHMGR5a CAAGGGTGCGAGCAAGGA CAAGCTGGCCTGCTGCTA
AvHMGR5b ATGGCGGCAAGGACCTTC CCTTGCTCGCACCCTTGA
AvHMGR6a TTCGGTTCCCATGGCCAC ACAACACGCTGGTAGCCC
AvHMGR6b TTCGGTTCCCATGGCCAC ACAACACGCTGGTAGCCC
AvHMGR9a CAAAGCCCCCAAAACCGC AGTGGTGCCCGCAACTAC
AvHMGR9b TTCGGTTCCCATGGCCAC ACAACACGCTGGTAGCCC
AvHMGR21a GCCGCCATCATCTCCCTC CGTTGTCCCAGGCTTCGT
AvHMGR21b GCCGCCATCATCTCCCTC GAGGAGGAAGCGATCGGC
Av ̄actin GATGCTCCCAGGGCAGTG TCCTTCTGGCCCATCCCA
表 2 对萼猕猴桃 HMGR 基因家族成员信息
Table 2 Information of HMGR gene family members in Actinidia valvata
氨基酸数量 分子质量
基因名称 基因 ID 染色体 ID Number of 等电点 亚细胞定位
Molecular weight
Gene name Gene ID Chromosome ID amino acids pI Subcellular localization
(kDa)
(aa)
AvHMGR1a AVa01g00155.1 Ch1a 514 54.47 5.46 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR1b AVb01g00158.1 Ch1b 578 61.85 6.35 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR4a AVa04g00026.1 Ch4a 593 63.56 7.88 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR4b AVb04g00029.1 Ch4b 591 63.30 8.15 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR5a AVa05g00175.1 Ch5a 558 59.56 7.08 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR5b AVb05g00181.1 Ch5b 556 59.23 7.17 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR6a AVa06g00014.1 Ch6a 578 61.73 6.23 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR6b AVb06g00011.1 Ch6b 576 61.57 6.13 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR9a AVa09g00010.1 Ch9a 575 61.68 6.43 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR9b AVb09g00009.1 Ch9b 577 61.67 6.43 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR21a AVa21g00027.1 Ch21a 597 64.00 6.39 内质网 Endoplasmic reticulum
AvHMGR21b AVb21g00031.1 Ch21b 592 63.31 7.52 内质网 Endoplasmic reticulum
2.2 AvHMGRs 基因家族成员系统进化分析 Ⅲꎮ Cluster Ⅲ中 AvHMGR5a / b 与 AvHMGR1a / b 亲
为阐明 AvHMGRs 的系统进化关系及功能ꎬ利 缘关系更近ꎬ而 AvHMGR6a / b 与 AvHMGR9a / b 亲缘
用 MEGA 软件对拟南芥、烟草、水稻、玉米、对萼猕 关系更近ꎻ另外ꎬAvHMGRs 与中华猕猴桃‘红阳’ 中
猴桃以及中华猕猴桃‘ 红阳’ 中的 HMGR 蛋白氨 的 HMGRs 具有高度同源性且 AvHMGRs 与位于相
基酸序列进行了多重序列比对ꎬ并构建了系统进 同染色体的 AcHMGRs 亲缘关系更近ꎮ
化树(图 1)ꎮ 根据系统进化树的分支ꎬHMGR 共 2.3 AvHMGRs 基因的系统进化树、蛋白保守基序、
分为 3 个亚家族:Cluster I 中均为单子叶植物ꎬ无 保守结构域和基因结构分析
AvHMGRꎻ Cluster Ⅱ 中 包 含 AvHMGR4a / b 和 通过对对萼猕猴桃种内系统分析ꎬ发现 12 个
AvHMGR21a / bꎬ 与 AtHMGR1 聚 为 一 类ꎻ 其 余 AvHMGRs 主要归于两个主要分支( 图 2:A)ꎮ 为探
AvHMGRs 成 员 与 AtHMGR2 聚 为 一 类ꎬ 为 Cluster 究 AvHMGRs 结 构 的 多 样 性ꎬ 通 过 MEME 对

