Page 134 - 《广西植物》2026年第5期

８ ６ ６ 广 西 植 物 ４６ 卷
通过 ｂｌａｓｔｘ 将 １１６ ３８９ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 序列与 ＮＲ、 表 ３ ＮＲ 注释物种分布
ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ、ＫＥＧＧ 和 ＣＯＧ/ ＫＯＧ( Ｅ ｖａｌｕｅ <０.０００ ０１) Ｔａｂｌｅ ３ Ｓｐｅｃｉｅｓ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ＮＲ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ
等数 据 库 进 行 同 源 序 列 比 对ꎮ 共 得 到 注 释 的 物种 数量 百分比
Ｐｅｒｃｅｎｔａｇｅ
Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 有 ８０ １３０ 个ꎬ约占总 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 的６８.８５％ꎬ Ｓｐｅｃｉｅｓ Ｎｕｍｂｅｒ (％)
３６ ２５９ 个没有得到注释ꎬ约占总基因３１.１５％ꎮ 结果 阿根廷豆树 Ｐｒｏｓｏｐｉｓ ａｌｂａ １９ ７５２ ２４.９２
显示马大相思在 ＮＲ 数据库中注释到 ７９ ２４９ 个 欧洲栓皮栎 Ｑｕｅｒｃｕｓ ｓｕｂｅｒ １０ ７６７ １３.５９
Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ在 ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ 数据库中注释到 ５９ ６７５ 个 奥氏卡普斯孢菌(ＡＴＣＣ ３０８６４ 菌株)
４ ０５０ ５.１１
Ｃａｐｓａｓｐｏｒａ ｏｗｃｚａｒｚａｋｉ (ＡＴＣＣ ３０８６４ ｓｔｒａｉｎ)
Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ 在 ＫＥＧＧ 数 据 库 中 注 释 到 ６７ ７９０ 个
银叶罗丹木 Ｒｈｏｄａｍｎｉａ ａｒｇｅｎｔｅａ １ ８１４ ２.２９
Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ 在 ＫＯＧ 数 据 库 中 注 释 到 ５１ ０８３ 个
蓝星睡莲 Ｎｙｍｐｈａｅａ ｃｏｌｏｒａｔａ １ ４６９ １.８５
Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ有４７ ２４６个 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 在 ４ 大数据库都能注
费氏洪氏藻 Ｈｏｎｄａｅａ ｆｅｒｍｅｎｔａｌｇｉａｎａ １ ２９９ １.６４
释到(图 １)ꎮ
微小亚得里亚共生藻
Ｓｙｍｂｉｏｄｉｎｉｕｍ ｍｉｃｒｏａｄｒｉａｔｉｃｕｍ １ ２８８ １.６３
密花豆 Ｓｐａｔｈｏｌｏｂｕｓ ｓｕｂｅｒｅｃｔｕｓ １ ０８３ １.３７
红车轴草 Ｔｒｉｆｏｌｉｕｍ ｐｒａｔｅｎｓｅ ９２８ １.１７
其他 Ｏｔｈｅｒ ３６ ７９９ ４６.４３

包含的 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 基 本 持 平ꎬ 分 别 为 ２３ ９８４ 个 和
２２ ９１１个ꎬ占该类比的 ２０.６１％和 １９.６８％ꎮ
２.２.２ 差异表达基因 ＫＥＧＧ 分析 将差异表达基
因(ＤＥＧｓ)经 ＫＥＧＧ 数据库比对后ꎬ共有 ６７ ７９０ 条
Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 能够在 ＫＥＧＧ 数 据 库 得 到 注 释ꎮ ＫＥＧＧ
注释被划分为代谢、遗传信息处理、环境信息处
图 １ Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 的 ４ 大数据库注释韦恩图 理、细胞过程和有机体系统ꎮ 其中ꎬ全局和概览图
Ｆｉｇ. １ Ｖｅｎｎ ｄｉａｇｒａｍ ｏｆ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ ａｃｒｏｓｓ
谱(９ ７７９ 个ꎬ占１４.４３％)的 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 占总 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ
ｆｏｕｒ ｍａｊｏｒ ｄａｔａｂａｓｅｓ ｏｆ Ｕｎｉｇｅｎｅｓ
数最多ꎬ其次是翻译(８ ９６２ 个ꎬ占 １３.２２％) 和碳水
化合物代谢(３ ６８８个ꎬ占 ５.４４％)ꎬ而膜转运(１７８
利用 ＮＲ 数据库对 ７９ ２４９ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 进行同 个)所获得的注释最少(图 ３)ꎮ
源序列对比ꎬ共匹配到 ５２４ 个物种ꎮ 其中ꎬ同源性 ２.３ 差异表达基因筛选与分析
最高的 是 阿 根 廷 豆 树 ( Ｐｒｏｓｏｐｉｓ ａｌｂａ)ꎬ 有 １９ ７５２ 以 Ａ 组根系和叶片为对照组ꎬ与 Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ 组
条ꎬ占 ２４.９２％ꎻ其次为欧洲栓皮栎(Ｑｕｅｒｃｕｓ ｓｕｂｅｒ)ꎬ有 的根系和叶片表达量进行比较ꎬ并以 ｜ ｌｏｇ ＦＣ ｜ 且
２
１０ ７６７条ꎬ占１３.５９％ꎻ密花豆(Ｓｐａｔｈｏｌｏｂｕｓ ｓｕｂｅｒｅｃｔｕｓ)、 ＦＤＲ<０.０５ 作为 ＤＥＧｓ 的筛选条件ꎬ结果在根部筛选
红车轴草(Ｔｒｉｆｏｌｉｕｍ ｐｒａｔｅｎｓｅ) 的同源序列较少ꎬ仅分 出有 ４５ ５８４ 个 ＤＥＧｓꎻ在叶部筛选出 １０ ３９１ 个 ＤＥＧｓꎮ

别占总序列的 １.３７％、１.１７％(表 ３)ꎮ 筛选出的 ＤＥＧｓ 均随着硝态氮含量的增多而增加ꎬ并
２.２.１ 差异表达基因 ＧＯ 分析 由图 ２ 可知ꎬ功能 且根与叶的 ＤＥＧｓ 变化趋势基本一致(图 ４)ꎮ
注释的 Ｕｎｉｇｅｎｅꎬ分别包含在 ５３ 个亚类当中ꎮ 生物 ２.４ 差异表达基因 ＫＥＧＧ 显著富集分析
学过程包含 ２４ 个亚类ꎬ其中细胞过程、代谢过程 ２.４.１ 根差异表达基因 ＫＥＧＧ 显著富集分析 由
富集数量较多ꎬ分别为 ３２ ７９６ 个和 ３２ ２１８ 个ꎬ占 表 ４ 可知ꎬ核糖体相关通路在 ４ 个组比较( ＡＲ￣ｖｓ￣
该类 别 的 ２８. １８％、 ２７. ６８％ꎬ 单 生 物 体 过 程 有 ＢＲ、 ＡＲ￣ｖｓ￣ＣＲ、ＡＲ￣ｖｓ￣ＤＲ、ＡＲ￣ｖｓ￣ＥＲ) 中均显著富

２６ ５３１个 Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ占 ２２.８０％ꎮ 细胞组分包含 １７ 集ꎬ 其 中 ＡＲ￣ｖｓ￣ＥＲ ＤＥＧｓ 最 多 ( ２ ０１６ 个ꎬ Ｐ<
个功能亚类ꎬ其中细胞、细胞部分以及膜结构占比 ０.００１)ꎬＡＲ￣ｖｓ￣ＢＲ ＤＥＧｓ 最少(８７０ 个ꎬＰ<０.００１)ꎮ
较多ꎬ分别为 ３５ ２８１ 个、３３ ８１５ 个和 ２８ １４２ 个ꎬ占 ２.４.２ 叶差异表达基因 ＫＥＧＧ 显著富集分析 由
该类别的 ３０.３１％、２９.０５％ 和 ２４.１８％ꎮ 分子功能 表 ５ 可知ꎬ 代谢途径与次生代谢物生物合成相关
包含 １２ 个功能亚类ꎬ 其中催化活性与结合活性所 通路在 ４ 个组比较(ＡＬ￣ｖｓ￣ＢＬ、ＡＬ￣ｖｓ￣ＣＬ、ＡＬ￣ｖｓ￣ＤＬ、