Page 136 - 《广西植物》2026年第5期
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                                           图 3  Unigenes 的 KEGG 代谢通路分类
                                     Fig. 3  KEGG metabolic pathway classification of Unigenes


                                                               基因进行了表达量检测ꎮ 结果如图 10 所示ꎬ检测
                                                               的 4 个基因转录组测序得到的表达量与 RT ̄qPCR
                                                               得到的 表 达 量 相 关 系 数 均 大 于 0. 79ꎬ 甚 至 达 到
                                                               0.95ꎬP 值均小于 0.05ꎬ表明转录组数据可靠真实ꎮ

                                                               3  讨论与结论



                                                                   为深入研究植物的生理机制ꎬ高通量转录组
                                                               测序技术被应用于植物的多个研究领域ꎬ包括新
                                                               基因的挖掘、基因组功能分析、物种基因文库构
                                                               建、SNP 标记开发等方面ꎮ 本研究通过转录组测
                                              ∶ NH 4 配 比 为
                                             -    +
              横坐标 轴 的 字 母 从 A - E 分 别 代 表 NO 3
                                                               序技术ꎬ共获得了 116 389 个 Unigenesꎬ其中成功
              0 ∶ 10、3 ∶ 7、5 ∶ 5、7 ∶ 3、10 ∶ 0ꎬR 与 L 分别代表根和叶ꎮ
                                                               注释了 8 0130 个基因ꎬ占总基因数的 68.85%ꎮ 基
              Letters from A to E on the horizontal axis represent the
                 -    +
              NO 3 ∶ NH 4 ratios of 0 ∶ 10ꎬ 3 ∶ 7ꎬ 5 ∶ 5ꎬ 7 ∶ 3 and 10 ∶ 0ꎬ  于 Unigene 数 据ꎬ 利 用 NR 数 据 库 对 79 249 个
              respectivelyꎬ R and L represent roots and leavesꎬ respectively.  Unigenes 进行同源序列对比ꎬ共匹配到 524 个物
                           图 4  差异表达基因                         种ꎬ其中同源性最高的是同为豆科木本植物的阿
                     Fig. 4  Differentially expressed genes    根廷豆树ꎮ 在进行差异表达基因筛选时发现ꎬ随
                                                               着硝态氮比例的增加ꎬ根和叶的差异表达基因显
            2.7 RT ̄qPCR 验证转录组数据测序结果                            著增加ꎬ并且根部差异表达基因远多于叶部ꎮ
                 采用实时荧光定量 PCR( RT ̄qPCR) 对本次转                       通过 KEGG 富集分析发现根部的差异表达基

            录组测序的准确性进行了验证ꎬ对 4 个 Unigenes                       因主要集中在核糖体途径上ꎬ 而叶部的差异表达
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