Page 144 - 《广西植物》2026年第5期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｍａｙ ２０２６ꎬ ４６(５): ８７６－８９１
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２５０８００８
许丽爱ꎬ 郁有健ꎬ 刘西ꎬ 等ꎬ ２０２６. 濒危植物山豆根全长转录组测序与不同组织比较分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４６(５):
８７６－８９１.
ＸＵ Ｌ Ａꎬ ＹＵ Ｙ Ｊꎬ ＬＩＵ Ｘꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２６. Ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｔｉｓｓｕｅｓ ｉｎ ｔｈｅ
ｅｎｄａｎｇｅｒｅｄ ｐｌａｎｔ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４６(５): ８７６－８９１.
濒危植物山豆根全长转录组测序与不同组织比较分析
许丽爱 ꎬ 郁有健 ꎬ 刘 西 ꎬ 潘向东 ꎬ 雷祖培 １∗
１ꎬ２
１
１
２
( １. 浙江乌岩岭国家级自然保护区管理中心ꎬ 浙江 温州 ３２５５００ꎻ ２. 浙江农林大学 园艺学院ꎬ 杭州 ３１１３００ )
摘 要: 山豆根(Ｅｕｃｈｒｅｓｔａ ｊａｐｏｎｉｃａ)是我国华南和西南地区特有的珍稀濒危豆科植物ꎬ其根部具有抗炎和抗
癌等功能ꎬ但其基因组信息仍属空白ꎮ 该研究通过构建其全长及比较转录组数据库ꎬ旨在为解析其分子调
控网络及活性成分合成机制提供关键数据支撑ꎮ 该文采用 ＰａｃＢｉｏ ＳＭＲＴ 三代测序技术ꎬ对山豆根 ６ 个组织
的混合样品进行全长转录组测序ꎬ并结合 Ｉｌｌｕｍｉｎａ 平台开展不同组织转录组测序ꎬ首次建立了该物种的高质
量转录组资源ꎮ 结果表明:(１)获得 ２１ ７０３ 个高质量 Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ其中 ９９.２６％(２１ ５４３ 个)在七大基因功能注
释数据库中获得注释ꎮ (２) 鉴定到 １ ５４３ 个转录因子ꎬ涵盖 ８７ 个家族ꎻ挖掘到 ７ ６４９ 个 ＳＳＲ 位点ꎬ分布于
６ ２６３个 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 中ꎬ以混合微卫星和三碱基重复类型为主ꎮ (３)多组织比较转录组分析发现 １６ ２２０ 个非冗
余差异表达基因(ＤＥＧｓ)ꎬ果实与花序、侧根与果实间差异最显著ꎬ花序、果实和侧根中存在大量高表达基
因ꎮ (４)超过半数的黄酮类化合物合成相关基因在侧根和 / 或花序中高表达ꎬ与代谢物积累模式一致ꎬ表明
侧根和花序是黄酮类化合物生物合成的关键场所ꎮ 该研究填补了山豆根属转录组信息的空白ꎬ为解析其药
用活性成分的生物合成途径、挖掘关键功能基因及开发分子标记提供了重要遗传资源ꎮ
关键词: 山豆根ꎬ 全长转录组ꎬ 生物信息学分析ꎬ 差异表达基因ꎬ 黄酮类化合物
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２６)０５￣０８７６￣１６
Ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｔｉｓｓｕｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｅｎｄａｎｇｅｒｅｄ
ｐｌａｎｔ Ｅｕｃｈｒｅｓｔａ ｊａｐｏｎｉｃａ
１ꎬ２ ２ １ １ １∗
ＸＵ Ｌｉａｉ ꎬ ＹＵ Ｙｏｕｊｉａｎ ꎬ ＬＩＵ Ｘｉ ꎬ ＰＡＮ Ｘｉａｎｇｄｏｎｇ ꎬ ＬＥＩ Ｚｕｐｅｉ
( １. Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｗｕｙａｎｌｉｎｇ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｓｅｒｖｅ Ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ Ｃｅｎｔｅｒꎬ Ｗｅｎｚｈｏｕ ３２５５００ꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇꎬ Ｃｈｉｎａꎻ
２. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｈｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅꎬ Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ａ ＆ Ｆ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｈａｎｇｚｈｏｕ ３１１３００ꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｅｕｃｈｒｅｓｔａ ｊａｐｏｎｉｃａ ｉｓ ａ ｒａｒｅ ａｎｄ ｅｎｄａｎｇｅｒｅｄ ｌｅｇｕｍｅ ｓｐｅｃｉｅｓ ｅｎｄｅｍｉｃ ｔｏ ｓｏｕｔｈｅｒｎ ａｎｄ ｓｏｕｔｈｗｅｓｔｅｒｎ Ｃｈｉｎａꎬ
ｖａｌｕｅｄ ｆｏｒ ｔｈｅ ａｎｔｉ￣ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙ ａｎｄ ａｎｔｉ￣ｃａｎｃｅｒ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ｏｆ ｉｔｓ ｒｏｏｔｓ. Ｎｅｖｅｒｔｈｅｌｅｓｓꎬ ｇｅｎｏｍｉｃ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｆｏｒ ｔｈｉｓ ｓｐｅｃｉｅｓ
收稿日期: ２０２５－１１－０５ 接受日期: ２０２５－１１－２７
基金项目: 浙 江 省 第 二 批 省 林 业 发 展 和 资 源 保 护 项 目 ( 山 豆 根 珍 稀 濒 危 野 生 植 物 保 护)ꎻ 国 家 自 然 科 学 基 金 青 年 项 目
(３２２０２５０８)ꎮ
第一作者: 许丽爱(１９９１—)ꎬ博士ꎬ讲师ꎬ主要从事园艺植物研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｘｕｌｉａｉ＠ｚａｆｕ.ｅｄｕ.ｃｎꎮ
∗
通信作者: 雷祖培ꎬ正高级工程师ꎬ主要从事园艺植物栽培和自然保护区管理工作ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｌｅｉｚｕｐｅｉ２００７＠１６３.ｃｏｍꎮ
