Page 149 - 《广西植物》2026年第5期

５ 期 许丽爱等: 濒危植物山豆根全长转录组测序与不同组织比较分析 ８ ８ １

Ａ. 不同重叠关系组合下的 Ｕｎｉｇｅｎｅ 数量分布( 纵轴为 Ｕｎｉｇｅｎｅ 数量ꎬ横轴为数据库组合类别ꎬ表征共有注释基因集的规模)ꎻ
Ｂ. 各数据库中成功注释的 Ｕｎｉｇｅｎｅ 数量分布ꎻ Ｃ. 数据库间注释基因的重叠关系(连线表示基因注释的共享情况)ꎮ
Ａ. Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ Ｕｎｉｇｅｎｅｓ ｕｎｄｅｒ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｏｖｅｒｌａｐｐｉｎｇ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｓ (Ｔｈｅ ｙ￣ａｘｉｓ ｉｓ ｔｈｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ ａｎｄ ｔｈｅ ｘ￣ａｘｉｓ ｉｓ ｔｈｅ
ｃａｔｅｇｏｒｉｅｓ ｏｆ ｄａｔａｂａｓｅ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｓꎬ ｒｅｆｌｅｃｔｉｎｇ ｔｈｅ ｓｃａｌｅ ｏｆ ｓｈａｒｅｄ ａｎｎｏｔａｔｅｄ ｇｅｎｅ ｓｅｔｓ)ꎻ Ｂ. Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｓｕｃｃｅｓｓｆｕｌｌｙ ａｎｎｏｔａｔｅｄ
Ｕｎｉｇｅｎｅｓ ａｃｒｏｓｓ ｄａｔａｂａｓｅｓꎻ Ｃ. Ｏｖｅｒｌａｐｐｉｎｇ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｏｆ ａｎｎｏｔａｔｅｄ Ｕｎｉｇｅｎｅｓ ａｍｏｎｇ ｄａｔａｂａｓｅｓ ( ｃｏｎｎｅｃｔｉｎｇ ｌｉｎｅｓ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｓｈａｒｅｄ ｇｅｎｅ
ａｎｎｏｔａｔｉｏｎｓ).
图 ２ 基于 ７ 个功能注释数据库的 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 注释情况统计

Ｆｉｇ. ２ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ ｏｆ Ｕｎｉｇｅｎｅｓ ａｎｎｏｔａｔｉｎｇ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｓｅｖｅｎ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｄａｔａｂａｓｅｓ

个ꎬ１１.７％) 和信号转导机制( １ ６０２ 个ꎬ１１. ２％) ２.２.４ ＫＥＧＧ 代谢途径分析 ＫＥＧＧ 分析显示ꎬ山
也具有较高的注释频率ꎮ 代谢相关类群中ꎬ碳水 豆根转录组中共有 １８ ４５５ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 获得功能注
化合物转运与代谢( ９５２ 个ꎬ６.７％) 占比最高ꎬ其 释ꎬ其中 １０ ０７３ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 被定位到 ＫＥＧＧ 代谢
次为次生代谢物合成、转运与分解及能量产生与 通路中ꎬ主要富集于代谢、遗传信息处理、环境信
转换 ( 均 为 ６２０ 个ꎬ４. ３％) 、 氨 基 酸 转 运 与 代 谢 息处理、细胞过程和有机体系统五大类别下的 １４５

(５９６ 个ꎬ ４. ２％) 和 脂 质 转 运 与 代 谢 ( ５９４ 个ꎬ 个代谢通路ꎬ涵盖 ２２ 个亚类( 图 ６)ꎮ 代谢类别注
４.２％) ꎮ 尽管占比较低ꎬ但这些代谢相关基因可 释基因数量最多ꎬ覆盖了从基础代谢到次生代谢
能与其独特药用价值密切相关ꎬ尤其是次生代谢 的 １１ 个亚类ꎬ包括全局及概览图谱、碳水化合物
物合成相关基因为解析其活性成分的生物合成 代谢、氨基酸代谢和脂质代谢等核心代谢途径ꎮ

提供了重要线索ꎮ 此外ꎬ核苷酸转运与代谢( １４８ 值得注意的是ꎬ在与药用价值相关的次生代谢通
个ꎬ１.０％) 和辅酶转运与代谢( １２２ 个ꎬ０.８％) 等 路(如 萜 类 与 聚 酮 化 合 物 代 谢) 中 注 释 到 大 量
基础代谢类群的注释ꎬ也为理解其整体代谢网络 Ｕｎｉｇｅｎｅｓꎬ为解析山豆根药用活性成分的生物合成
提供了依据ꎮ ＫＯＧ 注释结果系统揭示了山豆根 提供了重要线索ꎮ 遗传信息处理类别包含蛋白质
基因功能的多样性ꎬ为深入研究其药用成分合成 折叠、分选与降解等 ６ 个亚类ꎮ 细胞过程类别的
机制提供了方向ꎮ Ｕｎｉｇｅｎｅｓ 则富集在转运与分解代谢和细胞运动 ２