Page 148 - 《广西植物》2026年第5期
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A. 环状一致性序列(CCS)ꎻ B. 全长非嵌合(FLNC)序列ꎻ C. 一致性转录本序列(CTS)ꎻ D. 高质量 Isoformsꎮ
A. Circular consensus sequence (CCS)ꎻ B. Full ̄length non ̄chimeric (FLNC) sequenceꎻ C. Consensus transcripts sequence (CTS)ꎻ D. High ̄
quality Isoforms.
图 1 山豆根全长转录组测序关键数据集的长度分布
Fig. 1 Length distribution of key datasets in the full ̄length transcriptome sequencing of Euchresta japonica
suberectus) 匹 配 到 2 044 个 Unigenesꎬ 与 大 豆 解剖结构(17 423 个) 和蛋白质复合物(3 609 个)
( Glycine max) 和木豆( Cajanus cajan) 分别匹配到 两类ꎮ 分子功能以结合活性(12 677 个) 和催化活
879 个和 731 个 Unigenesꎮ 上 述 同 源 关 系 显 示ꎬ 性(10 026个) 为主ꎬ符合其次生代谢产物合成的
山豆根在进化上与羽扇豆属植物亲缘关系最近ꎬ 功能需求ꎮ 此外ꎬ转运蛋白活性(1 624 个)、ATP
其次为红豆属和密花豆属植物ꎬ该结果为其分子 依赖 性 活 性 ( 1 528 个) 和 转 录 调 控 因 子 活 性
进化和功能基因保守性研究提供了重要依据ꎮ (1 159个)等虽然注释数量较少ꎬ但对理解药用成
2.2.2 GO 功能分类 通过对 19 796 个 Unigenes 进 分转运、能量代谢和基因表达调控具有重要价值ꎮ
行 GO 功能注释ꎬ共将其归类至生物过程、细胞组 系统的 GO 注释为解析山豆根的分子功能和代谢
分和分子功能三大本体类别下的 45 个功能组( 图 特征提供了坚实基础ꎮ
4)ꎮ 在 生 物 过 程 的 22 个 功 能 组 中ꎬ 细 胞 过 程 2.2.3 KOG 功能分类 基于 KOG 数据库的功能
(14 388 个 ) 和 代 谢 过 程 ( 12 249 个 ) 注 释 的 注释分析显示ꎬ山豆根转录组中共 有 14 268 个
Unigenes 较多ꎬ体现了其基础生命活动的活跃性ꎻ Unigenes 被归类到 25 个功能类群( 图 5) ꎮ 其中ꎬ
其次为刺激响应(6 404 个)、生物调控(6 120 个) 注释 为 仅 一 般 功 能 预 测 的 Unigenes 数 量 最 多
和生物进程调控(5 676 个)等功能组ꎬ反映了山豆 (2 526个ꎬ17.7%) ꎬ与蛋白质加工相关的功能类
根对环境适应的分子基础ꎮ 细胞组分仅包含细胞 群翻译 后 修 饰、 蛋 白 质 周 转 与 分 子 伴 侣 ( 1 675

