Page 17 - 《广西植物》2026年第9期
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９ 期 阎侃等: 老虎刺叶绿体基因组解析及其对豆科新分类系统的验证 １ ４ ５ ３
图 ９ 基于贝叶斯推断法构建的豆科系统发育树
Ｆｉｇ. ９ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ ｏｆ Ｆａｂａｃｅａｅ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ ｂａｓｅｄ ｏｎ Ｂａｙｅｓｉａｎ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ
塑造基因组结构的重要机制(Ｄｕｇａｓ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５)ꎮ 跨越特征的缺失ꎬ这种相似的边界特征在一定程
ＩＲ 区的扩张可能改变相关基因的拷贝数( 鲁光荣 度上反映了 ２ 个物种在进化过程中的趋同性或紧
等ꎬ２０２２)ꎬ但其对基因表达及环境适应的影响仍 密的亲缘关系ꎬ从基因组结构层面进一步支持了
需进一步验证ꎮ 二者互为姐妹群的系统发育结论ꎮ
非等位同源重组被认为是 ＩＲ 边界变异的主要 ３.３ 密码子使用偏好与特异性分子标记
机制( Ｃａｉ ｅｔ ａｌ.ꎬ２００８ꎻ Ｓｃｈｗａｒｚ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０１５)ꎮ Ｃａｉ 密码子使用偏好是植物叶绿体蛋白编码基因
等( ２００８ ) 研 究 指 出ꎬ 豆 科 植 物 [ 如 地 三 叶 进化中的关键因素ꎬ深受突变、自然选择与随机遗
(Ｔｒｉｆｏｌｉｕｍ ｓｕｂｔｅｒｒａｎｅｕｍ)] 基因组中富含分散重复 传漂变的共同影响(Ｄｏｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０２１)ꎮ 本研究提
序列ꎬ且这些重复与重排端点紧密关联ꎮ 本研究 示ꎬ自然选择等非突变因素可能参与老虎刺叶绿
发现ꎬ阿拉伯金合欢印度亚种同样存在重复序列 体基因密码子使用偏好的形成ꎬ这一结论与杨涌
富集现象ꎬ推测其 ＩＲ 扩张可能由边界附近重复序 等(２０２５) 对 大 豆 ( Ｇｌｙｃｉｎｅ ｍａｘ)、 刀 豆 ( Ｃａｎａｖａｌｉａ
列通过同源重组引发ꎮ 此外ꎬ在 ＩＲｂ / ＳＳＣ( ＪＳＢ) 边 ｇｌａｄｉａｔａ)等豆科植物ꎬ以及孙晓春等 (２０２５) 对白
界处ꎬ老虎刺与阿拉伯金合欢均表现出 ｙｃｆ１ 基因 蜡树(Ｆｒａｘｉｎｕｓ ｃｈｉｎｅｎｓｉｓ)的研究结果相近ꎮ 通过综
