Page 16 - 《广西植物》2026年第9期
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3.2 叶绿体基因组结构变异
本研究在云实亚科中观察到显著的 IR / SC 边
界变异ꎬ尤以阿拉伯金合欢印度亚种的 IR 区扩张
最为突出ꎮ 其 IR 区长度增至 39 437 bpꎬ将 LSC 区
的 rpl23 基因与 rps19 基因纳入其中ꎬ该现象与豆
科植物叶绿体基因组中报道的结构变异相呼应
(Jansen et al.ꎬ2007ꎻ Magee et al.ꎬ2010)ꎮ 例如ꎬ蝶
形花亚科黄羽扇豆(Lupinus luteus)中发生的 36 kb
倒置( Martin et al.ꎬ2014)ꎬ以及含羞草分支 Inga
leiocalycina 中 IR 区向 SSC 区的延伸( Wang et al.ꎬ
2017)ꎬ均体现了豆科不同类群叶绿体基因组结构
图 7 20 个物种叶绿体全基因组核苷酸 的变异ꎬ但其形成机制未必相同ꎮ 这些研究表明
多样性(Pi)的滑移窗口分析
尽管大多数被子植物的 IR 区长度相对保守( Yan
Fig. 7 Sliding window analysis of nucleotide diversity
et al.ꎬ2025aꎬb)ꎬ但其动态扩张或收缩已被证明是
(Pi) across the complete chloroplast genomes of 20 species
图 8 基于最大似然法构建的豆科系统发育树
Fig. 8 Phylogenetic tree of Fabaceae constructed based on maximum likelihood

