Page 21 - 《广西植物》2026年第9期
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９ 期 阎侃等: 老虎刺叶绿体基因组解析及其对豆科新分类系统的验证 １ ４ ５ ７
４６１－４７０. Ｎｉｅｔｏ￣Ｂｌáｚｑｕｅｚ Ｍ Ｅꎬ Ａｎｔｏｎｅｌｌｉ Ａꎬ Ｒｏｎｃａｌ Ｊꎬ ２０１７. Ｈｉｓｔｏｒｉｃａｌ
Ｌｉ Ｘ Ｐꎬ Ｚｈａｏ Ｙ Ｍꎬ Ｔｕ Ｘ Ｄꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｂｉｏｇｅｏｇｒａｐｈｙ ｏｆ ｅｎｄｅｍｉｃ ｓｅｅｄ ｐｌａｎｔ ｇｅｎｅｒａ ｉｎ ｔｈｅ Ｃａｒｉｂｂｅａｎ:
ｏｆ ｐｌａｓｔｏｍｅｓ ｉｎ Ｏｘａｌｉｄａｃｅａｅ: Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ａｎｄ Ｄｉｄ ＧＡＡＲｌａｎｄｉａ ｐｌａｙ ａ ｒｏｌｅ? [Ｊ]. Ｅｃｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ
ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ [ Ｊ]. Ｐｌａｎｔ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ ４３(４): ７(２３): １０１５８－１０１７４.
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Ｌｉｎ Ｘ Ｘꎬ Ｌｕ Ｙꎬ Ｌｉ Ｈ Ｌꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｍｉｓｍａｔｃｈｅｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ｐｌａｎｔ ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆａｃｅｔｓ ａｎｄ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｄｅｎｄｒｏｂｉｕｍ ｐｌａｎｔｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｍａｔＫ ａｎｄ ｌｅｇａｃｙ ｉｎ ｔｈｅ ｖｉｃｉｎｉｔｙ ｏｆ ａ ｍａｊｏｒ Ｍｅｄｉｔｅｒｒａｎｅａｎ ｃｉｔｙ [ Ｊ].
ｒｂｃＬ ｇｅｎｅ [Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ ３８(１): ４６－５０. [林晓霞ꎬ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｄｉｃａｔｏｒｓꎬ ６０: ７３６－７４５.
鹿炎ꎬ 李会丽ꎬ 等ꎬ ２０２１. 基于 ｍａｔＫ 和 ｒｂｃＬ 序列的石斛属 Ｒａｍíｒｅｚ￣Ｂａｒａｈｏｎａ Ｓꎬ Ｓａｕｑｕｅｔ Ｈꎬ Ｍａｇａｌｌóｎ Ｓꎬ ２０２０. Ｔｈｅ
植物亲缘关系研究 [Ｊ]. 生物学杂志ꎬ ３８(１): ４６－５０.] ｄｅｌａｙｅｄ ａｎｄ ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌｌｙ ｈｅｔｅｒｏｇｅｎｅｏｕｓ ｄｉｖｅｒｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ
Ｌｉｎ Ｙ Ｘꎬ Ｗａｎｇ Ｑꎬ Ｓｈｅｎ Ｓꎬ ２０１４. Ｎｅｗ ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ ｌｅｇｕｍｅ ｆｌｏｗｅｒｉｎｇ ｐｌａｎｔ ｆａｍｉｌｉｅｓ [Ｊ]. Ｎａｔｕｒｅ Ｅｃｏｌｏｇｙ ＆ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ
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[Ｊ]. 植物学研究ꎬ ３(５): １７９－１８７.] ｉｎ ｔｈｅ Ｃａｅｓａｌｐｉｎｉａ ｇｒｏｕｐ ( Ｃａｅｓａｌｐｉｎｉｏｉｄｅａｅꎬ Ｆａｂａｃｅａｅ):
Ｌｕ Ｇ Ｒꎬ Ｃｈｅｎ Ｆ Ｑꎬ Ｌü Ｋꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２. Ｓｈｒｕｂ ｃｏｍｍｕｎｉｔｉｅｓ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ ｇｅｎｏｍｉｃｓ ｒｅｖｅａｌｓ ｇｅｎｏｍｅ ｄｙｎａｍｉｃｓꎬ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ
ｓｐｅｃｉｅｓ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｉｎ ｔｈｅ ｓｏｕｔｈｅｒｎ ｓｕｂｔｒｏｐｉｃａｌ ｉｎｓｉｇｈｔｓ ａｎｄ ａｄａｐｔｉｖｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ [Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ
ｚｏｎｅ ｉｎ Ｇｕａｎｇｘｉ [Ｊ]. Ｆｏｒｅｓｔ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ Ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ (３): ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ６３(６): １５３６－１５５９.
８９－９５. [鲁光荣ꎬ 陈芳清ꎬ 吕坤ꎬ 等ꎬ ２０２２. 广西南亚热带 Ｒｏｎｑｕｉｓｔ Ｆꎬ Ｔｅｓｌｅｎｋｏ Ｍꎬ ｖａｎ ｄｅｒ Ｍａｒｋ Ｐꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２.
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(３): ８９－９５.] ｍｏｄｅｌ ｃｈｏｉｃｅ ａｃｒｏｓｓ ａ ｌａｒｇｅ ｍｏｄｅｌ ｓｐａｃｅ [ Ｊ]. Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃ
Ｍａｇｅｅ Ａ Ｍꎬ Ａｓｐｉｎａｌｌ Ｓꎬ Ｒｉｃｅ Ｄ Ｗꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１０. Ｌｏｃａｌｉｚｅｄ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ ６１(３): ５３９－５４２.
ｈｙｐｅｒｍｕｔａｔｉｏｎ ａｎｄ ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｇｅｎｅ ｌｏｓｓｅｓ ｉｎ ｌｅｇｕｍｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ Ｓäｒｋｉｎｅｎ Ｔꎬ Ｐｅｎｎｉｎｇｔｏｎ Ｒ Ｔꎬ Ｌａｖｉｎ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１２.
ｇｅｎｏｍｅｓ [Ｊ]. Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ２０(１２): １７００－１７１０. Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｉｓｌａｎｄｓ ｉｎ ｔｈｅ Ａｎｄｅｓ: ｐｅｒｓｉｓｔｅｎｃｅ ａｎｄ ｉｓｏｌａｔｉｏｎ
Ｍａｎｚａｎｉｌｌａ Ｖꎬ Ｂｒｕｎｅａｕ Ａꎬ ２０１２. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ ｉｎ ｅｘｐｌａｉｎ ｈｉｇｈ ｅｎｄｅｍｉｓｍ ｉｎ Ａｎｄｅａｎ ｄｒｙ ｔｒｏｐｉｃａｌ ｆｏｒｅｓｔｓ
ｔｈｅ Ｃａｅｓａｌｐｉｎｉｅａｅ ｇｒａｄｅ (Ｌｅｇｕｍｉｎｏｓａｅ) ｂａｓｅｄ ｏｎ ｄｕｐｌｉｃａｔｅｄ [Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｇｅｏｇｒａｐｈｙꎬ ３９(５): ８８４－９００.
ｃｏｐｉｅｓ ｏｆ ｔｈｅ ｓｕｃｒｏｓｅ ｓｙｎｔｈａｓｅ ｇｅｎｅ ａｎｄ ｐｌａｓｔｉｄ ｍａｒｋｅｒｓ Ｓｃｈｗａｒｚ Ｅ Ｎꎬ Ｒｕｈｌｍａｎ Ｔ Ａꎬ Ｓａｂｉｒ Ｊ Ｓ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. Ｐｌａｓｔｉｄ
[ Ｊ ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ６５(１): ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｌｅｇｕｍｅｓ ｒｅｖｅａｌ ｐａｒａｌｌｅｌ ｉｎｖｅｒｓｉｏｎｓ ａｎｄ
１４９－１６２. ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｌｏｓｓｅｓ ｏｆ ｒｐｓ１６ ｉｎ ｐａｐｉｌｉｏｎｏｉｄｓ [ Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ
Ｍａｒｔｉｎ Ｇ Ｅꎬ Ｒｏｕｓｓｅａｕ￣Ｇｕｅｕｔｉｎ Ｍꎬ Ｃｏｒｄｏｎｎｉｅｒ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ５３(５): ４５８－４６８.
２０１４. Ｔｈｅ ｆｉｒｓｔ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｔｈｅ Ｇｅｎｉｓｔｏｉｄ Ｓｏｕｚａ￣Ｎｅｔｏ Ａ Ｃꎬ Ｃｉａｎｃｉａｒｕｓｏ Ｍ Ｖꎬ Ｃｏｌｌｅｖａｔｔｉ Ｒ Ｇꎬ ２０１６.
ｌｅｇｕｍｅ Ｌｕｐｉｎｕｓ ｌｕｔｅｕｓ: ｅｖｉｄｅｎｃｅ ｆｏｒ ａ ｎｏｖｅｌ ｍａｊｏｒ ｌｉｎｅａｇｅ￣ Ｈａｂｉｔａｔ ｓｈｉｆｔｓ ｓｈａｐｉｎｇ ｔｈｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ａ ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｈｏｔｓｐｏｔ
ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｒｅａｒｒａｎｇｅｍｅｎｔ ａｎｄ ｎｅｗ ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｒｅｇａｒｄｉｎｇ ｐｌａｓｔｏｍｅ ｔｈｒｏｕｇｈ ｔｉｍｅ: ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｆｒｏｍ ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ
ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ ｌｅｇｕｍｅ ｆａｍｉｌｙ [ Ｊ]. Ａｎｎａｌｓ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ Ｃａｅｓａｌｐｉｎｉｏｉｄｅａｅ ｉｎ ｔｈｅ Ｂｒａｚｉｌｉａｎ Ｃｅｒｒａｄｏ [ Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ
１１３(７): １１９７－１２１０. Ｂｉｏｇｅｏｇｒａｐｈｙꎬ ４３(２): ３４０－３５０.
Ｍｅｉｒｅｌｅｓ Ｊ Ｅꎬ Ｃａｖｅｎｄｅｒ￣Ｂａｒｅｓ Ｊꎬ Ｔｏｗｎｓｅｎｄ Ｐ Ａꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ Ｓｕｎ Ｘ Ｃꎬ Ｈｕａｎｇ Ｗ Ｊꎬ Ｌｉ Ｈ Ｒꎬ ２０２５. Ｃｏｄｏｎ ｂｉａｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ
２０２０. Ｌｅａｆ ｒｅｆｌｅｃｔａｎｃｅ ｓｐｅｃｔｒａ ｃａｐｔｕｒｅ ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｈｉｓｔｏｒｙ ＦｃＦ６′Ｈ１ ｇｅｎｅ ｉｎ Ｆｒａｘｉｎｕｓ ｃｈｉｎｅｎｓｉｓ [Ｊ]. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｓｈａｎｘｉ
ｏｆ ｓｅｅｄ ｐｌａｎｔｓ [ Ｊ ]. Ｔｈｅ Ｎｅｗ Ｐｈｙｔｏｌｏｇｉｓｔꎬ ２２８(２): Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ ５３(１): ３５－４７. [孙晓春ꎬ 黄文静ꎬ
４８５－４９３. 李会容ꎬ ２０２５. 白蜡树 ＦｃＦ６′Ｈ１ 基因的密码子偏好性分析
Ｍｉｎｈ Ｂ Ｑꎬ Ｓｃｈｍｉｄｔ Ｈ Ａꎬ Ｃｈｅｒｎｏｍｏｒ Ｏꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２０. ＩＱ￣ＴＲＥＥ [Ｊ]. 山西农业科学ꎬ ５３(１): ３５－４７.]
２: Ｎｅｗ ｍｏｄｅｌｓ ａｎｄ ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ Ｔａｎｇ Ｙ Ｊꎬ Ｚｈａｏ Ｙꎬ Ｈｕａｎｇ Ｇ Ｄꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ｃｏｄｏｎ
ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ ｉｎ ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｉｃ ｅｒａ [ Ｊ]. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｅｓ ｆｒｏｍ ｍａｎｇｏ [ Ｊ]. Ｃｈｉｎｅｓｅ
Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎꎬ ３７(５): １５３０－１５３４. Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｃｒｏｐｓꎬ ４２(８): ２１４３－２１５０. [唐玉娟ꎬ 赵
Ｍｏｏｒｅ Ｍ Ｊꎬ Ｓｏｌｔｉｓ Ｐ Ｓꎬ Ｂｅｌｌ Ｃ Ｄꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１０. Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ 英ꎬ 黄国弟ꎬ 等ꎬ ２０２１. 芒果叶绿体基因组密码子使用偏
ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ８３ ｐｌａｓｔｉｄ ｇｅｎｅｓ ｆｕｒｔｈｅｒ ｒｅｓｏｌｖｅｓ ｔｈｅ ｅａｒｌｙ 好性分析 [Ｊ]. 热带作物学报ꎬ ４２(８): ２１４３－２１５０.]
ｄｉｖｅｒｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｅｕｄｉｃｏｔｓ [Ｊ]. Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｔｉｌｌｉｃｈ Ｍꎬ Ｌｅｈｗａｒｋ Ｐꎬ Ｐｅｌｌｉｚｚｅｒ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. ＧｅＳｅｑ －
Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ ｏｆ Ａｍｅｒｉｃａꎬ ｖｅｒｓａｔｉｌｅ ａｎｄ ａｃｃｕｒａｔｅ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ ｏｒｇａｎｅｌｌｅ ｇｅｎｏｍｅｓ
１０７(１０): ４６２３－４６２８. [Ｊ]. Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈꎬ ４５ ( Ｗｅｂ Ｓｅｒｖｅｒ ｉｓｓｕｅ):
