Page 49 - 《广西植物》2026年第9期
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9 期               王泽寻等: 马先蒿属粗野-缘毛分支叶绿体基因组变异与演化研究                                          1 4 8 5

                                        表 1  马先蒿属及外类群叶绿体基因组的特征
                            Table 1  Characteristics of chloroplast genomes of Pedicularis and its outgroups
                                                                                       基因数量         假基因 /
                                     基因组大小        反向重复区       大单拷贝区        小单拷贝区
                      样本                                                             Number of genes  基因丢失∗
                                     Genome size   IR region   LSC region  SSC region
                     Sample                                                           (PCGs/ tRNA /  Pseudogenes/
                                       (bp)         (bp)        (bp)         (bp)
                                                                                        rRNA)      Gene loss∗
                  外类群 Outgroup
                Lindenbergia philippensis  155 103(37.78)  25 812(43.22)  85 594(35.81)  17 885(31.86)  80 / 30 / 4  —
               Phtheirospermum japonicum  153 372(38.27)  25 608(43.38)  84 478(36.43)  17 678(32.28)  80 / 30 / 4  —
             其他马先蒿 Other Pedicularis

                P. angustilabris S16559  151 614(38.31)  25 744(43.31)  82 836(36.42)  17 290(32.45)  78 / 30 / 4  ccsAꎻ accD
                 P. grandiflora P118  152 061(38.39)  25 779(43.32)  83 238(36.53)  17 265(32.62)  79 / 30 / 4  ccsA
                P. kangtingensis P062  151 577(38.32)  25 743(43.31)  82 805(36.44)  17 286(32.42)  78 / 30 / 4  ccsAꎻ accD
                 P. tsekouensis P121  145 626(38.31)  23 883(43.71)  83 453(36.30)  14 407(32.01)  68 / 30 / 4  ccsAꎻ ndhAꎬ B∗ꎬ
                                                                                                 Cꎬ Dꎬ Eꎬ F∗ꎬ
                                                                                                 G∗ꎬ Hꎬ Iꎬ Jꎬ K
             粗野-缘毛分支 Rudes ̄Craspedotrichae Clade
                 P. cinerascens P114  151 885(38.31)  25 620(43.33)  83 281(36.43)  17 364(32.52)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                P. craspedotricha S11013  151 832(38.32)  25 521(43.41)  83 446(36.42)  17 344(32.53)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                P. decora LR202072210  151 944(38.30)  25 741(43.25)  83 125(36.44)  17 337(32.48)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                 P. decora W2021033  151 578(38.34)  25 718(43.27)  82 831(36.50)  17 311(32.51)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                 P. decora W2021034  151 857(38.32)  25 711(43.27)  83 099(36.47)  17 336(32.47)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                P. decora WY2023043  151 578(38.34)  25 718(43.27)  82 831(36.50)  17 311(32.51)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                P. decora WY2023056  151 892(38.31)  25 717(43.28)  83 112(36.45)  17 346(32.45)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                P. dolichocymba P115  165 182(37.82)  40 856(39.23)  83 083(36.47)  387(31.09)  75 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsAꎻ
                                                                                                  ndhDꎬ Eꎬ F∗
                 P. dunniana S10447  151 900(38.32)  25 717(43.28)  83 117(36.47)  17 349(32.45)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                  P. galeata P989   164 204(37.84)  40 265(39.36)  83 239(36.43)  435(28.80)  73 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsAꎻ ndhAꎬ
                                                                                                  Dꎬ F∗ꎬ Hꎬ I
                P. ingens LR202072006  151 819(38.32)  25 624(43.35)  83 214(36.43)  17 357(32.51)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                 P. ingens W2021046  151 819(38.32)  25 624(43.35)  83 214(36.43)  17 357(32.51)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
               P. kongboensis WY202235  151 793(38.32)  25 622(43.36)  83 218(36.43)  17 331(32.53)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                  P. lasiophrys P116  151 709(38.30)  25 586(43.32)  83 214(36.42)  17 323(32.47)  77 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsAꎻ accD
                P. lophotricha S06765  151 642(38.33)  25 517(43.37)  83 169(36.44)  17 439(32.58)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                 P. prainiana S15401  151 887(38.32)  25 717(43.28)  83 142(36.46)  17 311(32.49)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
             P. pseudosteiningeri LR202071107 151 823(38.32)  25 624(43.34)  83 226(36.43)  17 349(32.51)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                P. retingensis WY202243  152 058(38.26)  25 608(43.34)  83 459(36.37)  17 383(32.40)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
              P. rhodotricha LR202071504  151 880(38.32)  25 636(43.35)  83 234(36.45)  17 374(32.45)  76 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsAꎻ
                                                                                                    ndhFꎬ G
                P. rhodotricha S10908  151 892(38.33)  25 632(43.35)  83 255(36.46)  17 373(32.49)  76 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsAꎻ
                                                                                                    ndhDꎬ I
                P. rhodotricha S11794  149 496(38.38)  25 478(43.40)  83 434(36.39)  15 106(32.46)  75 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsAꎻ
                                                                                                  ndhAꎬ Dꎬ F∗
               P. rhodotricha WY2023070  151 833(38.32)  25 642(43.35)  83 160(36.45)  17 389(32.44)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                 P. rudis W2021072  151 578(38.34)  25 718(43.27)  82 831(36.50)  17 311(32.51)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
                 P. steiningeri S04326  151 908(38.31)  25 624(43.34)  83 261(36.42)  17 399(32.54)  78 / 30 / 4  ycf15ꎻ ccsA
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