Page 49 - 《广西植物》2026年第9期
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9 期 王泽寻等: 马先蒿属粗野-缘毛分支叶绿体基因组变异与演化研究 1 4 8 5
表 1 马先蒿属及外类群叶绿体基因组的特征
Table 1 Characteristics of chloroplast genomes of Pedicularis and its outgroups
基因数量 假基因 /
基因组大小 反向重复区 大单拷贝区 小单拷贝区
样本 Number of genes 基因丢失∗
Genome size IR region LSC region SSC region
Sample (PCGs/ tRNA / Pseudogenes/
(bp) (bp) (bp) (bp)
rRNA) Gene loss∗
外类群 Outgroup
Lindenbergia philippensis 155 103(37.78) 25 812(43.22) 85 594(35.81) 17 885(31.86) 80 / 30 / 4 —
Phtheirospermum japonicum 153 372(38.27) 25 608(43.38) 84 478(36.43) 17 678(32.28) 80 / 30 / 4 —
其他马先蒿 Other Pedicularis
P. angustilabris S16559 151 614(38.31) 25 744(43.31) 82 836(36.42) 17 290(32.45) 78 / 30 / 4 ccsAꎻ accD
P. grandiflora P118 152 061(38.39) 25 779(43.32) 83 238(36.53) 17 265(32.62) 79 / 30 / 4 ccsA
P. kangtingensis P062 151 577(38.32) 25 743(43.31) 82 805(36.44) 17 286(32.42) 78 / 30 / 4 ccsAꎻ accD
P. tsekouensis P121 145 626(38.31) 23 883(43.71) 83 453(36.30) 14 407(32.01) 68 / 30 / 4 ccsAꎻ ndhAꎬ B∗ꎬ
Cꎬ Dꎬ Eꎬ F∗ꎬ
G∗ꎬ Hꎬ Iꎬ Jꎬ K
粗野-缘毛分支 Rudes ̄Craspedotrichae Clade
P. cinerascens P114 151 885(38.31) 25 620(43.33) 83 281(36.43) 17 364(32.52) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. craspedotricha S11013 151 832(38.32) 25 521(43.41) 83 446(36.42) 17 344(32.53) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. decora LR202072210 151 944(38.30) 25 741(43.25) 83 125(36.44) 17 337(32.48) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. decora W2021033 151 578(38.34) 25 718(43.27) 82 831(36.50) 17 311(32.51) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. decora W2021034 151 857(38.32) 25 711(43.27) 83 099(36.47) 17 336(32.47) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. decora WY2023043 151 578(38.34) 25 718(43.27) 82 831(36.50) 17 311(32.51) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. decora WY2023056 151 892(38.31) 25 717(43.28) 83 112(36.45) 17 346(32.45) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. dolichocymba P115 165 182(37.82) 40 856(39.23) 83 083(36.47) 387(31.09) 75 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsAꎻ
ndhDꎬ Eꎬ F∗
P. dunniana S10447 151 900(38.32) 25 717(43.28) 83 117(36.47) 17 349(32.45) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. galeata P989 164 204(37.84) 40 265(39.36) 83 239(36.43) 435(28.80) 73 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsAꎻ ndhAꎬ
Dꎬ F∗ꎬ Hꎬ I
P. ingens LR202072006 151 819(38.32) 25 624(43.35) 83 214(36.43) 17 357(32.51) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. ingens W2021046 151 819(38.32) 25 624(43.35) 83 214(36.43) 17 357(32.51) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. kongboensis WY202235 151 793(38.32) 25 622(43.36) 83 218(36.43) 17 331(32.53) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. lasiophrys P116 151 709(38.30) 25 586(43.32) 83 214(36.42) 17 323(32.47) 77 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsAꎻ accD
P. lophotricha S06765 151 642(38.33) 25 517(43.37) 83 169(36.44) 17 439(32.58) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. prainiana S15401 151 887(38.32) 25 717(43.28) 83 142(36.46) 17 311(32.49) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. pseudosteiningeri LR202071107 151 823(38.32) 25 624(43.34) 83 226(36.43) 17 349(32.51) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. retingensis WY202243 152 058(38.26) 25 608(43.34) 83 459(36.37) 17 383(32.40) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. rhodotricha LR202071504 151 880(38.32) 25 636(43.35) 83 234(36.45) 17 374(32.45) 76 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsAꎻ
ndhFꎬ G
P. rhodotricha S10908 151 892(38.33) 25 632(43.35) 83 255(36.46) 17 373(32.49) 76 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsAꎻ
ndhDꎬ I
P. rhodotricha S11794 149 496(38.38) 25 478(43.40) 83 434(36.39) 15 106(32.46) 75 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsAꎻ
ndhAꎬ Dꎬ F∗
P. rhodotricha WY2023070 151 833(38.32) 25 642(43.35) 83 160(36.45) 17 389(32.44) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. rudis W2021072 151 578(38.34) 25 718(43.27) 82 831(36.50) 17 311(32.51) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA
P. steiningeri S04326 151 908(38.31) 25 624(43.34) 83 261(36.42) 17 399(32.54) 78 / 30 / 4 ycf15ꎻ ccsA

