Page 5 - 《广西植物》2026年第9期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｓｅｐｔ. ２０２６ꎬ ４６(９): １４４１－１４５８
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２５１０００９
阎侃ꎬ 周雪琼ꎬ 赵润东ꎬ 等ꎬ ２０２６. 老虎刺叶绿体基因组解析及其对豆科新分类系统的验证 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４６(９):
１４４１－１４５８.
Ｙａｎ Ｋꎬ Ｚｈｏｕ Ｘ Ｑꎬ Ｚｈａｏ Ｒ Ｄꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２６. Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｐｔｅｒｏｌｏｂｉｕｍ ｐｕｎｃｔａｔｕｍ ａｎｄ ｉｔｓ ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ
ｎｅｗ Ｆａｂａｃｅａｅ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４６(９): １４４１－１４５８.
老虎刺叶绿体基因组解析及其对豆科新分类系统的验证
阎 侃 ꎬ 周雪琼 ꎬ 赵润东 ꎬ 王悠悠 ꎬ 马哲学 ꎬ 冉 娟 ꎬ 孙 超 ３
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( １. 兰州交通大学 生物与制药工程学院ꎬ 兰州 ７３００７０ꎻ ２. 重庆工贸职业技术学院ꎬ
重庆 ４０８０００ꎻ ３. 甘肃农业大学 农学院ꎬ 兰州 ７３００７０ )
摘 要: 豆科系统分类的最新修订将含羞草亚科并入广义云实亚科ꎬ但其可靠性仍需多遗传系统的独立验
证ꎮ 为了阐明云实亚科代表类群老虎刺(Ｐｔｅｒｏｌｏｂｉｕｍ ｐｕｎｃｔａｔｕｍ)的叶绿体基因组特征及其系统发育位置ꎬ该
研究利用 Ｉｌｌｕｍｉｎａ 测序技术组装并注释了老虎刺叶绿体基因组ꎬ分析了其密码子偏好性ꎻ同时ꎬ联合 １９ 个近
缘物种进行比较基因组学研究ꎬ并整合云实亚科代表物种的基因组数据进行系统发育重建及分化时间估
算ꎮ 结果表明:(１)老虎刺叶绿体基因组全长 １５９ ０６３ ｂｐꎬ编码 １２８ 个基因ꎬ呈现典型的环状四分体结构ꎬ反
向重复(ＩＲ)区 ＧＣ 含量(４２.６１％)显著高于单拷贝(ＳＣ)区ꎮ (２)比较基因组学分析显示ꎬ老虎刺及其近缘物
种 ＩＲ / ＳＣ 边界呈现动态演变ꎬ以 Ａ / Ｔ 碱基为主导的单核苷酸简单重复序列是最常见的 ＳＳＲ 类型ꎮ (３)密码
子偏好性分析显示ꎬ自然选择是主要驱动力ꎬ并筛选出 ｙｃｆ１ 等高变区作为潜在 ＤＮＡ 条形码ꎮ (４)系统发育
分析强烈支持老虎刺与阿拉伯金合欢印度亚种(Ｖａｃｈｅｌｌｉａ ｎｉｌｏｔｉｃａ ｓｕｂｓｐ. ｉｎｄｉｃａ) 互为姐妹群ꎬ从叶绿体基因
组层面为豆科新分类系统提供了关键验证ꎻ分化时间估算表明老虎刺属分化于渐新世晚期(约 ２４.１ 百万年
前)ꎮ 该研究系统解析了老虎刺叶绿体基因组特征ꎬ确证了其在广义云实亚科中的系统位置ꎬ为理解叶绿体
基因组结构进化及云实亚科资源的保护利用提供了重要的科学依据ꎮ
关键词: 老虎刺ꎬ 叶绿体基因组ꎬ 系统发育ꎬ 密码子偏好性ꎬ 序列变异
中图分类号: Ｑ９４９ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２６)０９￣１４４１￣１８
Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｐｔｅｒｏｌｏｂｉｕｍ ｐｕｎｃｔａｔｕｍ
ａｎｄ ｉｔｓ ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｎｅｗ Ｆａｂａｃｅａｅ
ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ
１∗ １ １ １
ＹＡＮ Ｋａｎ ꎬ ＺＨＯＵ Ｘｕｅｑｉｏｎｇ ꎬ ＺＨＡＯ Ｒｕｎｄｏｎｇ ꎬ ＷＡＮＧ Ｙｏｕｙｏｕ ꎬ
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ＭＡ Ｚｈｅｘｕｅ ꎬ ＲＡＮ Ｊｕａｎ ꎬ ＳＵＮ Ｃｈａｏ
收稿日期: ２０２６－０１－２０ 接受日期: ２０２６－０３－３１
基金项目: 干旱生境作物学国家重点实验室开放基金项目(ＧＳＣＳ￣２０２４￣０８)ꎻ 甘肃省高等教育教学改革研究项目(ＧＪＪＧＢ１４０)ꎻ 兰
州交通大学实验教学研究与改革项目(２０２５００８)ꎻ 兰州市人才创新创业项目(２０１７￣ＲＣ￣３９)ꎻ 甘肃农业大学伏羲人才资助项目
(Ｇａｕｆｘ￣０５Ｙ０３)ꎮ
第一作者: 阎侃(１９８４—)ꎬ博士ꎬ副教授ꎬ主要从事植物叶绿体基因组研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｈａｐｐｙｔｉｇｅｒ８＠ １６３.ｃｏｍꎻ ｙａｎｋ＠ ｍａｉｌ.ｌｚｊｔｕ.ｃｎ ꎮ
通信作者
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