Page 70 - 《广西植物》2020年第10期
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10 期 刘明涛等: 世纬苣苔模式产地的考证 1 4 5 3
图 2 世纬苣苔模式标本(左)和模式产地标本(右)
Fig. 2 Type specimen(left) and type locality specimen(right) of Petrocodon scopulorum (Chun) Y. Z. Wang
GAAGTCACACGATACGTGGTGGTTGGATTCCTCAA 表 1 NCBI 中下载的 ITS 序列
Table 1 ITS sequence retrieved from NCBI
CTTGCGAGCTGTCGTGTAGGACTGCATCGAGCCAC
GGGCACGACCCAATGGCGAAAGGTCGCCCTCGATC 物种 序列号
Species Accession
GCGACCCCAGGTCAGGCGGGATCACCCGCTGAGTT
Petrocodon ainsliifolius W. H. Chen & Y. M. Shui HQ633038
TAAꎮ
Petrocodon dealbatus Hance KY786301
3.3 系统发育树构建
Petrocodon hancei (Hemsl.) A.Weber & KY796057
利用最新获取的安顺平坝 ITS 序列ꎬ根据已有 Mich. Möller
Petrocodon hispidus (W. T. Wang) A. Weber & KF202294
的研究结果(Wang et al.ꎬ 2011ꎻ Weber & Middletonꎬ
Mich. Möller
2011)ꎬ选取报春苣苔属的烟叶苣苔为外类群ꎬ选取 Petrocodon integrifolius (D. Fang & L. Zeng) HQ633037
10 个石山苣苔属物种为内类群ꎬ从 NCBI 上获取 A. Weber & Mich. Möller
Petrocodon lithophilus Y. M. Shuiꎬ W. H. Chen & KF202296
相关物种的 ITS 序列(表 1)ꎮ ITS 序列首先使用软 Mich. Moeller
件 Clustal W( Larkin et al.ꎬ 2007) 自动比对ꎬ然后 Petrocodon lui (Yan Liu & W. B. Xu) HQ633035
A. Weber & Mich. Möller
在软件 Geneious v.7.1.8(Biomattersꎬ 2014) 中手动 Petrocodon retroflexus Q. Zhang & J. Guo KX579060
校正ꎮ 最后将数据上传至 CIPRES 网站ꎬ利用软件 Petrocodon scopulorum (Chun) Y. Z. Wang KR337023
RAxML(Stamatakisꎬ 2014) 进行最大似然树的构 Petrocodon viridescens W. H. Chenꎬ Mich. HQ633036
Moller & Y. M. Shui
建(图 4)ꎮ Primulina heterotricha (Merr.) Y. Dong & KY394899
Y. Z. Wang
从系统树可以看出ꎬ 所取样的石山苣苔属物