Page 46 - 《广西植物》2020年第2期
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２ 期                    陆奇丰等: 两种梧桐叶绿体基因组密码子使用偏性分析                                           １ ８ ３

     ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｃａｍｐｈｏｒ ｔｒｅｅ (Ｃｉｎｎａｍｏ￣  ＹＡ ＪＤꎬ ＹＵ ＺＸꎬ ＹＡＮＧ ＹＱꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ
     ｍｕｍ ｃａｍｐｈｏｒａ) [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ３８(１０): １３４６－ １３５５. [秦  ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｆｉｒｍｉａｎａ ｍａｊｏｒ (Ｍａｌｖａｃｅａｅ)ꎬ ａ ｃｒｉｔｉｃａｌｌｙ ｅｎｄａｎ￣
     政ꎬ 郑永杰ꎬ 桂丽静ꎬ 等ꎬ ２０１８. 樟树叶绿体基因组密码                  ｇｅｒｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ ｅｎｄｅｍｉｃ ｔｏ Ｓｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｃｈｉｎａ [ Ｊ]. Ｃｏｎｓｅｒｖ
     子偏好性分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ３８(１０): １３４６－１３５５.]             Ｇｅｎｅｔ Ｒｅｓｏｕｒꎬ １０(４): ７１３－７１５.
   ＲＡＯ Ｙꎬ ＷＵ Ｇꎬ ＷＡＮＧ Ｚꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１. Ｍｕｔａｔｉｏｎ ｂｉａｓ ｉｓ ｔｈｅ  ＹＡＮＧ ＧＦꎬ ＳＵ ＫＬꎬ ＺＨＡＯ ＹＲꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ
     ｄｒｉｖｉｎｇ ｆｏｒｃｅ ｏｆ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｉｎ ｔｈｅ ｇａｌｌｕｓ ｇａｌｌｕｓ ｇｅｎｏｍｅ  ｃｏｎｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｉｎ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｍｅｄｉｃａｇｏ
     [Ｊ]. ＤＮＡ Ｒｅｓꎬ １８(６): ４９９－５１２                      ｔｒｕｎｃａｔｕｌａ [Ｊ]. Ａｔｃａ Ｐｒａｔａｃ Ｓｉｎꎬ ２４(１２): １７１－１７９. [杨国
   ＲＩＢＥＩＲＯ ＡＳꎬ ＨÄＫＫＩＮＥＮ Ａꎬ ＬＬＯＹＤ￣ＰＲＩＣＥ Ｊꎬ ２０１２. Ｅｆｆｅｃｔｓ  锋ꎬ 苏昆龙ꎬ 赵怡然ꎬ 等ꎬ ２０１５. 蒺藜苜蓿叶绿体密码子
     ｏｆ ｇｅｎｅ ｌｅｎｇｔｈ ｏｎ ｔｈｅ ｄｙｎａｍｉｃｓ ｏｆ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ [Ｊ]. Ｃｏｍ￣  偏好性分析 [Ｊ]. 草业学报ꎬ ２４(１２): １７１－１７９.]
     ｐｕｔ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍꎬ ４１(４): １－９.                      ＹＡＮＧ Ｊꎬ ＣＨＥＮ Ｇꎬ ＳＵＮ ＷＢꎬ ２０１８. Ｃｏｎｓｅｒｖｉｎｇ Ｆｉｒｍｉａｎａ
   ＳＡＪＪＡＤ Ａꎬ ＭＵＨＡＭＭＡＤ Ｗꎬ ＡＢＤＵＬ ＬＫꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｔｈｅ   ｍａｊｏｒꎬ ａ ｔｒｅｅ ｓｐｅｃｉｅｓ ｅｎｄｅｍｉｃ ｔｏ Ｃｈｉｎａ [Ｊ]. Ｏｒｙｘꎬ ５２(２):
     ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｗｉｌｄ ｒｉｃｅ (Ｏｒｙｚａ ｍｉｎｕｔａ) ａｎｄ  ２１１－２１３.
     ｉｔｓ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｔｏ ｒｅｌａｔｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ [ Ｊ]. Ｆｒｏｎｔ Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉꎬ  ＹＵ ＺＸꎬ ＹＡＮＧ ＹＱꎬ ＭＯ Ｘꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１３. Ａ ｓｈｕｄｙ ｏｆ ａｒｔｉｆｉｃｉａｌ
     ８: ３０４.                                           ｂｒｅｅｄｉｎｇ ｏｆ ａｎ ｅｎｄａｎｇｅｒｅｄ ｐａｎｌｔ (Ｆｉｒｍｉａｎａ ｍａｊｏｒ) [Ｊ]. Ｊ Ｓｉ￣
   ＳＨＡＮＧ ＭＺꎬ ＬＩＵ Ｆꎬ ＨＵＡ ＪＰꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ ｃｏｄｏｎ  ｃｈｕａｎ Ｆｏｒ Ｓｃｉ Ｔｅｃｈｎｏｌꎬ ３４(２): ６２－６５. [余志祥ꎬ 杨永琼ꎬ
     ｕｓａｇｅ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ Ｇｏｓｓｙｐｉｕｍ ｈｉｒｓｕｔｕｍ [Ｊ]. Ｓｃｉ  莫旭ꎬ 等ꎬ ２０１３. 濒危植物云南梧桐(Ｆｉｒｍｉａｎａ ｍａｊｏｒ)人工
     Ａｇｒｉｃ Ｓｉｎꎬ ４４(２):２４５－２５３. [尚明照ꎬ 刘方ꎬ 华金平ꎬ 等ꎬ       繁育研究 [Ｊ]. 四川林业科技ꎬ ３４(２): ６２－６５.]
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     [Ｊ]. 中国农业科学ꎬ ４４(２):２４５－２５３.]                      ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｅｘｐａｎｓｉｎ ｇｅｎｅ ｃｏｄｏｎｕｓａｇｅ ｐａｔｔｅｒｎｓ ａｍｏｎｇ ｅｉｇｈｔ
   ＳＨＡＲＰ ＰＭ ＥＭＥＲＹ ＬＲꎬ ＺＥＮＧ Ｋꎬ ２０１０. Ｆｏｒｃｅｓ ｔｈａｔ ｉｎｆｌｕｅｎｃｅ  ｐｌａｎｔ ｓｐｅｃｉｅｓ [Ｊ]. Ｊ Ｂｉｏｍｏｌ Ｓｔｒｕｃｔ Ｄｙｎꎬ ７: １－８.
     ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｄｏｎ ｂｉａｓ [ Ｊ]. Ｐｈｉｌ Ｔｒａｎｓ Ｒ Ｓｏｃ Ｂꎬ  ＺＨＡＮＧ ＭＷꎬ ＺＨＡＮＧ ＴＫꎬ ＬＩＵ ＣＹꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｂｉｏｓｙｓｔｈｓｉｓ
     ３６５(１５４４): １２０３－１２１２.                             ｐａｔｈｗａｙ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ａｎｄ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｌｉｇｎｉｎ ｉｎ
   ＳＨＩ ＹＢꎬ ＷＡＮＧ ＧＢꎬ ＹＡＮＧ ＸＭꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ  Ｐｕｎｉｃａ ｇｒａｎａｔｕｎｍ [ Ｊ]. Ｍｏｌ Ｐｌａｎｔ Ｂｒｅｅｄꎬ １６(７): ２１３１ －
     ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｏｆ ＷＲＫＹ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎ Ｇｉｎｋｇｏ ｂｉｌｏｂａ  ２１３８. [张孟伟ꎬ 张太奎ꎬ 刘翠玉ꎬ 等ꎬ ２０１８. 石榴木质素
     [Ｊ]. Ｍｏｌ Ｐｌａｎｔ Ｂｒｅｅｄꎬ ｈｔｔｐ:ｋｎｓ. ｃｎｋｉ. ｎｅｔ/ ｋｃｍｓ/ ｄｅｔａｉｌ/ ４６.  合成途径进化与密码子使用偏好性分析 [Ｊ]. 分子植物育
     １０６８.Ｓ.２０１８０８０９.１４２３.００８.ｈｔｍｌ. [石元豹ꎬ 汪贵斌ꎬ 杨晓      种ꎬ １６(７): ２１３１－２１３８.]
     明ꎬ 等ꎬ ２０１８. 银杏 ＷＲＫＹ 家族基因密码子使用偏向性分               ＺＨＡＮＧ ＴＫꎬ ＱＩ ＧＨꎬ ＹＥ ＨＬꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１７. Ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ｉｎ
     析 [Ｊ]. 分子植物育种ꎬ ｈｔｔｐ:/ / ｋｎｓ.ｃｎｋｉ.ｎｅｔ/ ｋｃｍｓ/ ｄｅｔａｉｌ/  ｐｏｍｅｇｒａｎａｔｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ [Ｊ]. Ａｃｔａ Ｈｏｒｔｉｃ Ｓｉｎꎬ ４４ (４):
     ４６.１０６８.Ｓ.２０１８０８０９.１４２３.００８.ｈｔｍｌ.]                ６７５－６９０. [张太奎ꎬ 起国海ꎬ 叶红莲ꎬ 等ꎬ ２０１７. 石榴转录
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     ｇｅｎｅ ｌｅｎｇｔｈ ａｎｄ ｏｐｔｉｍａｌ ｃｏｄｏｎ ｕｓｅ￣ｄｉｓｅｎｔａｎｇｌｉｎｇ ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ  ＺＨＥＮＧ ＷＷꎬ ＣＨＥＮ ＪＨꎬ ＨＡＯ ＺＤꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６. Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ
     ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｆｒｏｍ ＧＣ￣ｂｉａｓｅｄ ｇｅｎｅ ｃｏｎｖｅｒｓｉｏｎ ｉｎ ｙｅａｓｔ [Ｊ]. ＢＭＣ  ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｂｉａｓ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｅｓ ｆｒｏｍ ｆｉｖｅ ｃｏｎｉｆｅｒｓ ｉｎｃｌｕ￣
     Ｅｖｏｌ Ｂｉｏｌꎬ １１(１): １１７９－１１８７.                      ｄｉｎｇ Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍｉａ ｌａｎｃｅｏｌａｔａ [ Ｊ ]. Ｍｏｌ Ｐｌａｎｔ Ｂｒｅｅｄꎬ
   ＳＵＥＯＫＡ Ｎꎬ ２００１. Ｎｅａｒ ｈｏｍｏｇｅｎｅｉｔｙ ｏｆ ＰＲ２￣ｂｉａｓ ｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔｓ  １４(５): １０９１ － １０９７. [ 郑 薇 玮ꎬ 陈 金 慧ꎬ 郝 兆 东ꎬ 等ꎬ
     ｉｎ ｔｈｅ ｈｕｍａｎ ｇｅｎｏｍｅ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｉｍｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｐｈｙｌｏｇｅ￣ｎｅｔｉｃ  ２０１６. 杉木 等 ５ 种 针 叶 树 叶 绿 体 密 码 子 偏 好 性 分 析
     ａｎａｌｙｓｅｓ [Ｊ]. Ｊ Ｍｏｌ Ｅｖｏｌꎬ ５３: ４６９ – ４７６.          [Ｊ]. 分子植物育种ꎬ １４(５): １０９１－１０９７.]
   ＳＵＺＵＫＩ Ｙꎬ ２０１１. Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ ｎａｔｕｒａｌ ｓｅ￣  ＺＨＯＵ ＹＤꎬ ＺＨＯＵ ＹＢꎬ ＹＡＮ ＳＬꎬｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１３. Ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ
     ｌｅｃｔｉｏｎ ｆｒｏｍ ｇｅｎｏｍｉｃ ｄａｔａ [Ｊ]. Ｇｅｎｅｓ Ｇｅｎｅｔ Ｓｙｓｔꎬ ８５(６):  ｓｕｂｓｔｒａｔｅｓ ｏｎ ｓｅｅｄ ｇｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ａｎｄ ｓｅｅｄｉｎｇ ｇｒｏｗｔｈ ｏｆ Ｆｉｒｍｉａｎａ
     ３５９－３７６.                                          ｐｕｌｃｈｅｒｒｉｍａ Ｈｓｕｅ [Ｊ]. Ｊ Ｔｒｏｐ Ｂｉｏｌꎬ ４(４): ３２２－３２６. [周亚东ꎬ
   ＷＡＮＧ ＪＨꎬ ＣＡＩ ＹＣꎬ ＺＨＡＯ ＫＫꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  周有标ꎬ 颜速亮ꎬ 等ꎬ ２０１３. 不同基质对美丽梧桐种子育苗
     ｏｆ ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ Ｆｉｒｍｉａｎａ ｐｕｌ￣  的影响 [Ｊ]. 热带生物学报ꎬ ４(４): ３２２－３２６.]
     ｃｈｅｒｒｉｍａ (Ｍａｌｖａｃｅａｅ) [Ｊ]. Ｃｏｎｓｅｒｖ Ｇｅｎｅｔ Ｒｅｓｏｕｒꎬ １０(３):  ＺＨＯＵ ＺＰꎬ ＤＡＮＧ ＹＫꎬ ＺＨＯＵ Ｍꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６. Ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ ｉｓ
     ４４５－４４８.                                          ａｎ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｄｅｔｅｒｍｉｎａｎｔ ｏｆ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｌｅｖｅｌｓ ｌａｒｇｅｌｙ
   ＷＡＮＧ ＰＬꎬ ＹＡＮＧ ＬＰꎬ ＷＵ ＨＹꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８. Ｃｏｄｏｎ        ｔｈｒｏｕｇｈ ｉｔｓ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｎ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ [Ｊ]. Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ
     ｐｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｏｆ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｉｎ Ｃａｍｅｌｌｉａ ｏｌｅｉｆｅｒａ  ＵＳＡꎬ ２６: ｅ６１１７－ｅ６１２５.
     [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ３８(２): １３５－１４４. [王鹏良ꎬ 杨利平ꎬ 吴红
     英ꎬ 等ꎬ ２０１８. 普通油茶叶绿体基因组密码子偏好性分析                                                (责任编辑  蒋巧媛)
     [Ｊ]. 广西植物ꎬ ３８(２): １３５－１４４.]
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