Page 41 - 《广西植物》2020年第2期

１ ７ ８ 广 西 植 物 ４０ 卷

表 ３ 两种梧桐编码基因密码子相关参数的相关性分析
Ｔａｂｌｅ ３ Ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅ ｐａｒａｍｅｔｅｒｓ ｏｆ ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｆｉｒｍｉａｎａ ｐｕｌｃｈｅｒｒｉｍａ ａｎｄ Ｆ. ｍａｊｏｒ

云南梧桐 Ｆ. ｍａｊｏｒ
美丽梧桐
Ｆ. ｐｕｌｃｈｅｒｒｉｍａ
ＧＣ ＥＮＣ ＳＬ
Ｃ ＧＣ１ Ｃ ＧＣ２ Ｃ ＧＣ３
１.０００ ０.４０１∗∗ ０.２７３ ０.８４１∗∗ ０.２８８∗ －０.１５８
Ｃ ＧＣ１
０.４０４∗∗ １.０００ ０.０８３ ０.７４７∗∗ －０.２５７ －０.３０２∗
Ｃ ＧＣ２
０.２２２ ０.００５ １.０００ ０.５０９∗∗ ０.３１７∗ ０.２１４
Ｃ ＧＣ３
ＧＣ ０.８４０∗∗ ０.７４３∗∗ ０.４５２∗∗ １.０００ ０.１３３ －０.１７０
ＥＮＣ ０.２５３ －０.２６１ ０.３１３∗ ０.１０９ １.０００ ０.２３０
ＳＬ －０.１５５ －０.３０９∗ ０.２６２ －０.１６１ ０.２２０ １.０００
注: ∗表示在 ０.０５ 水平上显著相关ꎻ ∗∗表示在 ０.０１ 水平上显著相关ꎮ
Ｎｏｔｅ: ∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｔ ０.０５ ｌｅｖｅｌꎻ ∗∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｔ ０.０１ ｌｅｖｅｌ.

Ｃ ＧＣ１２ 表示密码子第 １ 位、第 ２ 位碱基 ＧＣ 平均含量ꎬＣ ＧＣ３ 表 美丽梧桐横坐标平均位置为 ０.４５３ ２± ０.０７３ ９ꎬ纵坐标为
０.４５０３ ± ０.１０３ ７ꎻ 云南梧桐横坐标平均位置为 ０.４５４ ４±
示第 ３ 位碱基 ＧＣ 含量ꎮ
Ｃ ＧＣ１２ ｍｅａｎｓ ａｖｅｒａｇｅ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ｏｆ ｔｈｅ ｆｉｒｓｔ ａｎｄ ｔｈｅ ｓｅｃｏｎｄ ０.０７３ ６ꎬ纵坐标为 ０.４５１ ５ ± ０.１０７ ８ꎮ
ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｃｏｄｏｎｓꎬ Ｃ ＧＣ３ ｍｅａｎｓ ｔｈｅ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ ｏｆ ｔｈｅ ｔｈｉｒｄ Ｏｐｅｎ ｃｉｒｃｌｅｓ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｔｈｅ ａｖｅｒａｇｅ ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｆｏｒ ｅａｃｈ ｐｌｏｔ. Ｆｉｒｍｉａｎａ
ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ ｃｏｄｏｎｓ. ｐｕｌｃｈｅｒｒｉｍａ: Ａｖｅｒａｇｅ ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｉｓ ｘ ＝ ０. ４５３ ２ ± ０. ０７３ ９ꎬ ｙ ＝
０.４５０ ３ ± ０.１０３ ７ꎻ Ｆ. ｍａｊｏｒ: Ａｖｅｒａｇｅ ｐｏｓｉｔｉｏｎ ｉｓ ｘ ＝ ０.４５４ ４ ±
图 １ 中性绘图分析
０.０７３ ６ꎬ ｙ ＝ ０.４５１ ５ ± ０.１０７ ８.
Ｆｉｇ. １ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｎｅｕｔｒａｌｉｔｙ ｐｌｏｔ Ｃ ａｇａｉｎｓｔ Ｃ
ＧＣ１２ ＧＣ３
图 ２ ＰＲ２￣ｐｌｏｔ 绘图分析
Ｆｉｇ. ２ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＰＲ２￣ｐｌｏｔ [Ａ３/ (Ａ３＋Ｔ３)]
两种梧桐植物对应密码子 ＲＳＣＵ 值极为接近ꎬ进一 ａｇａｉｎｓｔ [Ｇ３/ (Ｇ３＋Ｃ３)]
步说明其叶绿体基因组密码子使用偏性较为接
近ꎬ叶绿体基因组较为保守ꎬ种间差异较小ꎮ 因库ꎬ其中两种梧桐属叶绿体基因组高表达基因
２.６ 最优密码子分析 为 ｒｐｓ８、ｒｐｓ１４、ｐｅｔＤ、ｒｐｓ１８、ｒｐｌ１６ꎬ平均 ＥＮＣ 值分别
对两种梧桐植物叶绿体基因组基因的 ＥＮＣ 值 为 ３８.４１(Ｆ. ｐｕｌｃｈｅｒｒｉｍａ)、３８.０２(Ｆ. ｍａｊｏｒ)ꎻＦ. ｐｕｌ￣
进行排序ꎬ选出两极的 １０％基因作为高、低表达基 ｃｈｅｒｒｉｍａ 低表达基因为 ｙｃｆ２、ｐｅｔＡ、 ｙｃｆ３、ｎｄｈＪ、ａｔｐＥꎬ