Page 59 - 《广西植物》2020年第4期

４ 期 李冰怡等: 地黄核苷二磷酸激酶基因的克隆及生物信息学分析 ４ ９ ７

图 ３ ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ蛋白的疏水性预测 图 ４ ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ蛋白的亚细胞定位预测
Ｆｉｇ. ３ Ｈｙｄｒｏｐｈｏｂｉｃｉｔｙ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ＲｇＮＤＰＫⅠｐｒｏｔｅｉｎ Ｆｉｇ. ４ Ｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒ ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ＲｇＮＤＰＫⅠｐｒｏｔｅｉｎ

Ａ. 二级结构预测ꎻ Ｂ. 三级结构预测ꎮ
Ａ. Ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎꎻ Ｂ. Ｔｅｒｔｉａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ.
图 ５ ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ蛋白的结构预测
Ｆｉｇ. ５ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ＲｇＮＤＰＫⅠｐｒｏｔｅｉｎ

主要有 ＮＤＰＫⅠ、ＮＤＰＫⅡ、ＮＤＰＫⅢ三种ꎮ 一些研 激酶结构域和其他磷酸化活性位点ꎬ其结构域与
究发现植物 ＮＤＰＫⅠ、ＮＤＰＫⅡ、ＮＤＰＫⅢ具有不同 ＮＤＰＫⅠ的保守结构域高度相似ꎬ而且亚细胞定位

的亚细胞定位ꎬ其中 ＮＤＰＫⅠ通常定位于细胞质、 于细胞质ꎬ表明ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ是核苷二磷酸激酶超
细 胞 核ꎬ ＮＤＰＫ Ⅲ 定 位 于 叶 绿 体、 线 粒 体ꎬ 而 家 族 成 员ꎬ 且 属 于 ＮＤＰＫ Ⅰ 类ꎮ 因 此ꎬ 推 测
ＮＤＰＫⅡ可能定位于叶绿体(王文斌等ꎬ２０１１)ꎮ 本 ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ基因可能在植物生长发育和感病应激
研究利用地黄的转录组学数据ꎬ通过电子克隆法 等信息传递、非生物胁迫、淀粉和纤维素的合成等
(高兴春等ꎬ２００５)首次从地黄中克隆得到的核苷 方面发挥作用(朱馨妮等ꎬ２０１７)ꎮ
二磷酸激酶基因ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ的 ｃＤＮＡ 序列ꎬ开放阅 进一步分析发现地黄ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ与芝麻、紫
读 框 长 度 为 ４４７ ｂｐꎬ 共 编 码 １４８ 个 氨 基 酸ꎬ 花风铃 的 核 苷 二 磷 酸 激 酶 相 似 性 较 高ꎬ 分 别 为
ＲｇＮＤＰＫ Ⅰ基因编码蛋白含有保守的核苷二磷酸 ９７％和 ９６％ꎬ而且不同植物的核苷二磷酸激酶存