Page 98 - 《广西植物》2020年第7期
P. 98
9 9 4 广 西 植 物 40 卷
图 3 鹅掌楸 AOX 家族系统进化树
Fig. 3 Phylogenetic tree analysis of LcAOXs family
2.4 鹅掌楸 AOX 家族基因表达蛋白系统进化分析 楸在进化关系上与胡萝卜更为密切ꎬ另一方面ꎬ也
从 NCBI 蛋白质数据库中搜索已发表的拟南芥 符合 AOX 家族在 AOX1 和 AOX2 亚家族分类事实ꎮ
( NP _ 188876. 1、 NP _ 188875. 1、 NP _ 189399. 1、 2.5 鹅掌楸 AOX 家族基因亚细胞定位预测
NP_201226.2)、 水 稻 ( Oryza sativaꎬ O. glaberrima) 用 TargetP 在线软件进行亚细胞定位预测( 表
(BAA28773.1、BAB71945.1)、胡萝卜( Daucus carota 2)ꎬ结果显示 LcAOX1a 蛋白可能较多分布在除叶
var. sativa) (ALI57378.1、ABZ81229.2、ABZ81230.2)、 绿体、 线 粒 体 和 分 泌 通 路 之 外 的 其 他 位 置ꎻ
葡萄(Vitis vinifera) (ACI28876.1、NP_001268001.1)、 LcAOX2 蛋白定位于线粒体ꎬ且可信度等级为 2ꎬ
番茄(Lycopersicon esculentum)(NP_001234117.2、NP_ 具有较高可信度ꎻLcAOX1b 虽然在线粒体中分值
001309890. 1)、 大 豆 ( Glycine max ) ( KHN42869. 1、 最高ꎬ但其具体定位信息并不明确ꎮ 为了使预测
KHN39226.1)、西瓜(Citrullus lanatus)(ADD84880.1) 结果更加准确ꎬ我们使用 Wolfpsort 在线软件再一
等 19 个 AOX 家族同源蛋白ꎬ利用 MEGA5.0 软件 次进行 LcAOX 蛋白亚细胞定位预测( 表 3)ꎬ结果
将 3 个鹅掌楸 AOX 蛋白与数据库检索的蛋白序列 显示 LcAOX1a 蛋白最有可能定位于细胞质区域ꎻ
进行多重序列比对ꎬ并用极大似然法构建系统进 LcAOX2 蛋白最有可能定位于线粒体中ꎻLcAOX1b
化树(图 3)ꎬAOX 蛋白明显分为两大支ꎬ即 AOX1 蛋白在线粒体和叶绿体中均有定位ꎬ其具体定位
和 AOX2ꎬ从亲缘关系来看ꎬLcAOX1a 和 LcAOX1b 信息仍需进一步实验验证ꎮ
聚为一个小的分支ꎬ与胡萝卜 DcAOX1 蛋白亲缘 2.6 鹅掌楸 AOX 家族基因组织表达特性分析
关系最近ꎻ而 LcAOX2 与胡萝卜 DcAOX2a 等蛋白 分别提取鹅掌楸的 8 个组织总 RNAꎬ以其反转
亲缘关系较近ꎮ 因此ꎬ该结果一方面说明了鹅掌 录 cDNA 为模板ꎬ参考之前已发表的鹅掌楸 Actin97