Page 54 - 《广西植物》2020年第9期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｓｅｐｔ. ２０２０ꎬ ４０(９): １２６９－１２８０
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０１９０７０３８
王芬ꎬ 裴会敏ꎬ 文狄ꎬ 等. 基于高通量测序的都匀地区福鼎大白种茶树根茎叶分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ２０２０ꎬ ４０(９): １２６９－１２８０.
ＷＡＮＧ Ｆꎬ ＰＥＩ ＨＭꎬ ＷＥＮ Ｄꎬ ｅｔ ａｌ. Ｈｉｇｈ￣ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｒｏｏｔꎬ ｓｔｅｍ ａｎｄ ｌｅａｆ ｉｎ Ｆｕｄｉｎｇｄａｂａｉ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ２０２０ꎬ ４０(９):
１２６９－１２８０.
基于高通量测序的都匀地区福鼎大白种茶树根茎叶分析
王 芬 ꎬ 裴会敏ꎬ 文 狄ꎬ 陈 志ꎬ 刘 荣ꎬ 姚玉仙ꎬ 马 媛
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( 黔南民族师范学院 生物科学与农学院ꎬ 贵州 都匀 ５５８０００ )
摘 要: 为探究茶树中茶多酚等产物代谢途径的相关基因ꎬ该研究以贵州都匀地区福鼎大白种茶树的根茎
叶为对象ꎬ利用高通量测序技术构建茶的转录组数据库并筛选其根茎叶差异表达基因ꎮ 结果表明:共获得
７０.８８ Ｇｂ Ｃｌｅａｎ Ｄａｔａꎬ各样品 Ｃｌｅａｎ Ｄａｔａ 均达到 ６.３３ ＧｂꎬＱ３０ 碱基百分比在 ９３.２２％以上ꎮ 将 Ｃｌｅａｎ Ｒｅａｄｓ 与
中国种茶树参考基因组进行序列比对ꎬ比对效率从 ８７.８３％到 ９１.１４％ꎮ 基于比对结果ꎬ进行可变剪接预测
分析和基因结构优化分析ꎬ发掘新基因 １３ ５３１ 个ꎬ其中 １０ ２４４ 个得到功能注释ꎮ 利用 ＦＰＫＭ 进行基因表达
量分析ꎬ根据基因在不同样品中表达量识别差异表达基因ꎮ 叶与茎的差异基因有 ５ ５９５ 个ꎬ其中 ２ ７６９ 个在
茎中上调ꎬ２ ８２６ 个下调ꎬ叶与根有 ９ ６５０ 个差异基因ꎬ５ ０５６ 个上调ꎬ４ ５９４ 个下调ꎬ茎与根中有 ５ ６４４ 个差异
基因ꎬ２ ９３８ 个上调ꎬ２ ７０６ 个下调ꎬ并通过 ＧＯ 和 ＫＥＧＧ 分析ꎬ将差异基因进行功能注释和富集分析ꎮ 上述结
果为揭示都匀地区福鼎大白种茶参与类黄酮、茶氨酸和咖啡碱等代谢途径相关的基因提供了参考ꎬ为选育
优良品种等提供了理论依据ꎮ
关键词: 都匀地区ꎬ 福鼎大白种ꎬ 根茎叶ꎬ 高通量测序ꎬ 差异基因
中图分类号: Ｑ９４５ 文献标识码: Ａ
文章编号: １０００￣３１４２(２０２０)０９￣１２６９￣１２ 开放科学(资源服务)标识码(ＯＳＩＤ):
Ｈｉｇｈ￣ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｒｏｏｔꎬ
ｓｔｅｍ ａｎｄ ｌｅａｆ ｉｎ Ｆｕｄｉｎｇｄａｂａｉ
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ＷＡＮＧ Ｆｅｎ ꎬ ＰＥＩ Ｈｕｉｍｉｎꎬ ＷＥＮ Ｄｉꎬ ＣＨＥＮ Ｚｈｉꎬ ＬＩＵ Ｒｏｎｇꎬ ＹＡＯ Ｙｕｘｉａｎꎬ Ｍａ Ｙｕａｎ
( Ｔｈｅ Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅꎬ Ｑｉａｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓꎬ Ｄｕｙｕｎ ５５８０００ꎬ Ｇｕｉｚｈｏｕꎬ Ｃｈｉｎａ )
收稿日期: ２０１９－１０－２５
基金项目: 国家自然科学基金(３１９００４８６)ꎻ贵州省科技厅基础研究计划项目(黔科合基础[２０１９]１２９８)ꎻ贵州省教育厅青年科技
人才成长项目(黔教合 ＫＹ 字[２０１８]４２０)ꎻ黔南民族师范学院科研创新团队项目(Ｑｎｓｙｋ２０１６０５ꎬ ＱＮＹＳＫＹＴＤ２０１８０１１)ꎻ黔南民族
师范学院高层次人才引进研究专项项目(ｑｎｓｙｒｃ２０１６１１)ꎻ黔南州科技计划项目(黔南科合学科建设农学(２０１８)５ 号和黔南科合农
字(２０１７)２３)ꎻ贵州省 教 育 厅 项 目 ( 黔 教 合 人 才 团 队 字 [ ２０１５] ６８)ꎻ 黔 南 民 族 师 范 学 院 重 大 科 研 创 新 基 金 博 士 专 项 基 金
(ＱＮＳＹ２０１８ＢＳ０１８)ꎻ贵 州 省 植 物 学 重 点 支 持 学 科 开 放 基 金 ( ｑｎｓｙｚｗ１８０９ )ꎻ 黔 南 民 族 师 范 学 院 继 续 教 育 基 地 项 目
(ＱＮＳＹ２０１８ＺＪ００６)[Ｓｕｐｐｏｒｔｅｄ ｂｙ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｈｉｎａ(３１９００４８６)ꎻ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｐｒｏｖｉｎｃｉａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈ￣
ｎｏｌｏｇｙ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ[(ＱＫＨ Ｂａｓｉｃ ｒｅｓｅａｒｃｈ) [２０１９]１２９８]ꎻ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｐｒｏｖｉｎｃｉａｌ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ(ＱＪＨ￣ＫＹ￣Ｚ [２０１８]４２０)ꎻ Ｒｅｓｅａｒｃｈ
ａｎｄ Ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ Ｔｅａｍ ｏｆ Ｑｉａｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ(Ｑｎｓｙｋ２０１６０５ꎬ ＱＮＹＳＫＹＴＤ２０１８０１１)ꎻ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｊｅｃｔ ｏｆ
Ｑｉａｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ ( ｑｎｓｙｒｃ２０１６１１)ꎻ Ｑｉａｎｎａｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｂｕｒｅａｕ ( ＱＮＫＨＸＫＪＳＮＸ ( ２０１８) ５ ａｎｄ
[ＱＮＫＨＮＺ(２０１７)２３]ꎻ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｐｒｏｖｉｎｃｉａｌ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ([２０１５]６８)ꎻ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｊｅｃｔ ｏｆ Ｑｉａｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ
ｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ(ＱＮＳＹ２０１８ＢＳ０１８)ꎻ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｊｅｃｔ ｏｆ Ｑｉａｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ(ｑｎｓｙｚｗ１８０９)ꎻ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ
Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｊｅｃｔ ｏｆ Ｑｉａｎｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ (ＱＮＳＹ２０１８ＺＪ００６)]ꎮ
作者简介: 王芬(１９８４－)ꎬ女ꎬ山西运城人ꎬ博士ꎬ讲师ꎬ主要从事茶树转录组学研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ) ｆｅｎｍｉｎ５２１＠ １６３.ｃｏｍꎮ
通信作者
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