Page 59 - 《广西植物》2020年第9期
P. 59

1 2 7 4                               广  西  植  物                                         40 卷
































































    1. 可变 5′或 3′端剪切ꎻ 2. 单内含子滞留ꎻ 3. 多内含子滞留ꎻ 4. 多外显子跳跃ꎻ 5. 单外显子跳跃ꎻ 6. 第一个外显子可变剪切ꎻ
    7. 最后一个外显子可变剪切ꎻ 8. 可变 5′或 3′端剪切(模糊边界)ꎻ 9. 单内含子滞留(模糊边界)ꎻ 10. 多内含子滞留(模糊边界)ꎻ
    11. 多外显子跳跃(模糊边界)ꎻ 12. 单外显子跳跃(模糊边界)ꎮ
    1. Aeꎻ 2. Irꎻ 3. Mirꎻ 4. Mskipꎻ 5. Skipꎻ 6. Tssꎻ 7. Ttsꎻ 8. Xaeꎻ 9. Xirꎻ 10. Xmirꎻ 11. Xmskipꎻ 12. Xskip.
                                      图 2  可变剪接事件数量统计
                                 Fig. 2  Number statistics of alternative splicing


   Million fragments mapped) 作为衡量基因表达量高                  福鼎大白种茶根茎叶三个部位的基因表达量
   低的标准ꎬFPKM 计算公式如下:                                 的密度分布对比( 图 3) 表明ꎬ能够测序到的编码
                       cDNA Fragments
      FPKM =                                 ꎮ                                   ̄2    4
           Mapped Fragments (Millions) ×Transcript Length (kb)  蛋白的基因 FPKM 值跨越 10 到 10 六个数量级ꎮ
   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64