Page 66 - 《广西植物》2020年第9期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｓｅｐｔ. ２０２０ꎬ ４０(９): １２８１－１２８７
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０１９０７０６０
周延清ꎬ 邵露营ꎬ 郭萌萌ꎬ 等. 地黄 Ｃ３Ｈ 基因的克隆及生物信息学分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ２０２０ꎬ ４０(９): １２８１－１２８７.
ＺＨＯＵ ＹＱꎬ ＳＨＡＯ ＬＹꎬ ＧＵＯ ＭＭꎬ ｅｔ ａｌ. Ｃｌｏｎｉｎｇ ａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｃ３Ｈ ｇｅｎｅ ｉｎ Ｒｅｈｍａｎｎｉａ ｇｌｕｔｉｎｏｓａ [ Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ２０２０ꎬ
４０(９): １２８１－１２８７.
地黄 Ｃ３Ｈ 基因的克隆及生物信息学分析
周延清 ꎬ 邵露营ꎬ 郭萌萌ꎬ 朱佳琳
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( 河南师范大学 生命科学学院ꎬ 河南 新乡 ４５３０００ )
摘 要: 香豆酸￣３￣羟化酶属于植物中最大的蛋白酶细胞色素 Ｐ４５０ 家族之一ꎬ在植物生命活动中发挥着重
要作用ꎮ 为了解地黄香豆酸￣３￣羟化酶基因 ＲｇＣ３Ｈ 合成毛蕊花糖苷的功能ꎬ该研究基于地黄代谢组学分析
获得 ＫＥＧＧ 途径中的 Ｃ３Ｈꎬ采用多重比对在 ＮＣＢＩ 中获得同源基因的一个保守序列ꎬ并基于该保守序列和地
黄 ＳＲＡ 数据库ꎬ采用电子克隆和 ＲＴ￣ＰＣＲ 克隆技术获得地黄 Ｃ３Ｈ 基因全长 ＣＤＳ(ＲｇＣ３Ｈ)ꎬ对其进行生物信
息学分析ꎮ 结果表明:ＲｇＣ３Ｈ 基因全长为 １ ５３０ ｂｐꎬ且编码一个含 ５０９ 个氨基酸、分子量为 ５７.９１ ｋＤ、无信号
肽的蛋白质ꎻ基于氨基酸序列的结构分析显示ꎬＲｇＣ３Ｈ 有一个保守区域￣Ｐ４５０ 结构域ꎻ系统进化分析结果显
示ꎬＲｇＣ３Ｈ 与芝麻和猴面花的 Ｃ３Ｈ 基因具有很高的同源性ꎮ 上述结果为进一步研究 ＲｇＣ３Ｈ 基因在地黄毛
蕊花糖苷生物合成途径中的作用奠定了基础ꎮ
关键词: 地黄ꎬ Ｃ３Ｈ 基因ꎬ 基因克隆ꎬ 生物信息学分析
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ
文章编号: １０００￣３１４２(２０２０)０９￣１２８１￣０７ 开放科学(资源服务)标识码(ＯＳＩＤ):
Ｃｌｏｎｉｎｇ ａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｃ３Ｈ
ｇｅｎｅ ｉｎ Ｒｅｈｍａｎｎｉａ ｇｌｕｔｉｎｏｓａ
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ＺＨＯＵ Ｙａｎｑｉｎｇ ꎬ ＳＨＡＯ Ｌｕｙｉｎｇꎬ ＧＵＯ Ｍｅｎｇｍｅｎｇꎬ ＺＨＵ Ｊｉａｌｉｎ
( Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｈｅｎａｎ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｘｉｎｘｉａｎｇ ４５３０００ꎬ Ｈｅｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: Ｃｏｕｍａｒｉｎ￣３￣ｈｙｄｒｏｘｙｌａｓｅ ｂｅｌｏｎｇｓ ｔｏ ｔｈｅ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ Ｐ４５０ ｆａｍｉｌｙꎬ ｏｎｅ ｏｆ ｔｈｅ ｌａｒｇｅｓｔ ｐｒｏｔｅａｓｅ ｆａｍｉｌｉｅｓꎬａｎｄ ｐｌａｙｓ ａｎ
ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｒｏｌｅ ｉｎ ｐｌａｎｔｓ. Ｈｏｗｅｖｅｒꎬｉｔｓ ｒｏｌｅ ｆｏｒ ｖｅｒｂａｓｃｏｓｉｄｅ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｒｅｍａｉｎｓ ｄｅｆｉｃｉｅｎｔ. Ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄ ｔｈｅ ｒｏｌｅ ｏｆ
Ｐ￣ｃｏｕｍａｒａｔｅ ３￣ｈｙｄｒｏｘｙｌａｓｅ ｆｏｒ ｖｅｒｂａｓｃｏｓｉｄｅ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｉｎ Ｒｅｈｍａｎｎｉａ ｇｌｕｔｉｎｏｓａ (ＲｇＣ３Ｈ)ꎬＣ３Ｈ ｗａｓ ｍｉｎｅｄ ｆｒｏｍ ａ ｃａｎｄｉ￣
ｄａｔｅ ＫＥＧＧ ｐａｔｈｗａｙ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｈｅ ｍｅｔａｂｏｌｏｍｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｒ. ｇｌｕｔｉｎｏｓａꎬ ａｎｄ ａ ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ ｇｅｎｅ ｗａｓ
ｏｂｔａｉｎｅｄ ｉｎ ＮＣＢＩ ｂｙ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ａｌｉｇｎｍｅｎｔ. Ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ ｉｔｓ ｆｒａｇｍｅｎｔ ａｎｄ ＳＲＡ ｄａｔａｂａｓｅ ｏｆ Ｒ. ｇｌｕｔｉｎｏｓａꎬ ｗｅ ｃｌｏｎｅｄ ｉｔｓ ｆｕｌｌ
ｌｅｎｇｔｈ ＣＤＳ (ＲｇＣ３Ｈ) ｂｙ ｅｌｅｃｔｒｏ ｃｌｏｎｉｎｇ ａｎｄ ＲＴ￣ＰＣＲꎬ ａｎｄ ｐｅｒｆｏｒｍｅｄ ｉｔｓ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｅｓ. Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｗｅｒｅ ａｓ ｆｏｌ￣
收稿日期: ２０１９－０７－２６
基金项目: 国家级项目培育基金(２０１６ＰＬ１１)ꎻ河南省自然科学基金(１８２３００４１００１８)ꎻ校内结余项目(５２０１０４９１７０５５６) [Ｓｕｐｐｏｒｔｅｄ
ｂｙ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｐｒｏｊｅｃｔ Ｃｕｌｔｉｖａｔｉｏｎ Ｆｕｎｄ Ｐｒｏｊｅｃｔ(２０１６ＰＬ１１)ꎻ Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ ｏｆ Ｈｅｎａｎ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ(１８２３００４１００１８)ꎻＣａｍｐｕｓ
Ｂａｌａｎｃｅ Ｐｒｏｊｅｃｔ(５２０１０４９１７０５５６)]ꎮ
作者简介: 周延清(１９６３ －)ꎬ男ꎬ河南邓州人ꎬ博士ꎬ教授ꎬ主要从事遗传学和生物学专业英语教学及植物分子遗传学研究ꎬ
(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｙｑｚｈｏｕ＠ ｈｔｕ.ｃｎꎮ
通信作者
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