Page 122 - 《广西植物》2022年第10期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｏｃｔ. ２０２２ꎬ ４２(１０): １７４０－１７４９
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２１０３０６６
陈丽琼ꎬ 张志荣ꎬ 杨俊波ꎬ 等. 质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ２０２２ꎬ ４２(１０): １７４０－１７４９.
ＣＨＥＮ ＬＱꎬ ＺＨＡＮＧ ＺＲꎬ ＹＡＮＧ ＪＢꎬ ｅｔ ａｌ. Ｐｌａｓｔｉｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｏｍｉｃ ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｉｎｔｏ ｔｈｅ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ｃｏｎｖｏｌｖｕｌａｃｅａｅ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ２０２２ꎬ
４２(１０): １７４０－１７４９.
质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系
陈丽琼 １ꎬ２ ꎬ 张志荣 ꎬ 杨俊波 ꎬ 李德铢 ꎬ 郁文彬 １ꎬ４ꎬ５∗
３
３
３
( １. 中国科学院西双版纳热带植物园 综合保护中心ꎬ 云南 勐腊 ６６６３０３ꎻ ２. 中国科学院大学ꎬ 北京 １０００４９ꎻ ３. 中国科学院
昆明植物研究所 中国西南野生生物种质资源库ꎬ 昆明 ６５０２０１ꎻ ４. 中国科学院核心植物园保护生物学协同中心ꎬ
云南 勐腊 ６６６３０３ꎻ ５. 中国科学院东南亚生物多样性研究中心ꎬ 云南 勐腊 ６６６３０３ )
摘 要: 旋花科是一个世界广布的类群ꎬ具有丰富的形态特征和重要的经济价值ꎮ 然而ꎬ目前该科主要分支
或族间的系统发育关系问题一直未解决ꎮ 为解析旋花科内系统发育关系ꎬ该研究代表性选取旋花科内 ８ 个族
４０ 个物种ꎬ基于质体全基因组数据ꎬ使用最大似然法和贝叶斯推论进行系统发育分析ꎮ 结果表明:(１)旋花科
质体基因组均为四分体结构ꎬ质体基因组大小为 １１３ ２７３~１６４ １１２ ｂｐꎬ蛋白质编码基因数目为 ６６~７９ 个ꎮ (２)
基于五种 ＤＮＡ 矩阵(即 ＷＣＧ、ＣＤＳ、ＬＳＣ、ＩＲ、ＳＳＣ)的系统发育分析结果显示ꎬＷＣＧ 矩阵和 ＣＤＳ 矩阵的拓扑结
构基本一致ꎬ仅少数分支的支持率略有差异ꎻＬＳＣ 矩阵和 ＷＣＧ 矩阵的拓扑结构差异在于菟丝子族、马蹄金族
和盐帚花族的系统位置ꎻＡＵ 检验和 ＳＨ 检验结果显示ꎬＷＣＧ 矩阵和 ＳＳＣ 矩阵与 ＩＲ 矩阵的拓扑结构有显著冲
突ꎮ (３)所有系统发育分析结果均显示ꎬ菟丝子属和马蹄金族都包括在旋花亚科内ꎬ应处理为族等级ꎮ (４)基
于 ＷＣＧ 矩阵和 ＣＤＳ 矩阵较好地解决了旋花科 ８ 个族之间的系统发育关系ꎬ即心被藤族和丁公藤族聚为一
支ꎬ最先从旋花亚科分化出来ꎬ随后是菟丝子族ꎬ剩下的 ５ 个族分成 ２ 个分支ꎮ (５)系统发育基因组分析证实ꎬ
由于鱼黄草族特别是鱼黄草属是一个多系类群ꎬ因此需重新修订该族的分类地位和鱼黄草属的划分ꎮ
关键词: 旋花科ꎬ 系统发育关系ꎬ 质体基因组ꎬ 菟丝子属ꎬ 鱼黄草族
中图分类号: Ｑ９４９ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２２)１０￣１７４０￣１０
Ｐｌａｓｔｉｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｏｍｉｃ ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｉｎｔｏ ｔｈｅ
ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ｃｏｎｖｏｌｖｕｌａｃｅａｅ
１ꎬ２ ３ ３ ３ １ꎬ４ꎬ５∗
ＣＨＥＮ Ｌｉｑｉｏｎｇ ꎬ ＺＨＡＮＧ Ｚｈｉｒｏｎｇ ꎬ ＹＡＮＧ Ｊｕｎｂｏ ꎬ ＬＩ Ｄｅｚｈｕ ꎬ ＹＵ Ｗｅｎｂｉｎ
( １. Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｉｎｔｅｇｒａｔｉｖｅ Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎꎬ Ｘｉｓｈｕａｎｇｂａｎｎａ Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｂｏｔａｎｉｃａｌ Ｇａｒｄｅｎꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｍｅｎｇｌａ ６６６３０３ꎬ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａꎻ
２. Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００４９ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ３. Ｔｈｅ Ｇｅｒｍｐｌａｓｍ Ｂａｎｋ ｏｆ Ｗｉｌｄ Ｓｐｅｃｉｅｓꎬ Ｋｕｎｍｉｎｇ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｂｏｔａｎｙꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ
Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｋｕｎｍｉｎｇ ６５０２０１ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ４. Ｃｅｎｔｅｒ ｏｆ Ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ Ｂｉｏｌｏｇｙꎬ Ｃｏｒｅ Ｂｏｔａｎｉｃａｌ Ｇａｒｄｅｎｓꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｍｅｎｇｌａ
６６６３０３ꎬ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ５. Ｓｏｕｔｈｅａｓｔ Ａｓｉａ Ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅꎬ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ Ｍｅｎｇｌａ ６６６３０３ꎬ Ｙｕｎｎａｎꎬ Ｃｈｉｎａ )
收稿日期: ２０２１－０７－１９
基金项目: 中国科学院重大科技基础设施开放研究项目 (２０１７￣ＬＳＦ￣ＧＢＯＷＳ￣０２)ꎻ 云南省万人计划“青年拔尖人才”项目 [Ｓｕｐｐｏｒｔｅｄ
ｂｙ ｔｈｅ Ｌａｒｇｅ￣Ｓｃａｌｅ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｆａｃｉｌｉｔｉｅｓ ｏｆ Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ (２０１７￣ＬＳＦ￣ＧＢＯＷＳ￣０２)ꎻ Ｔｅｎ Ｔｈｏｕｓａｎｄ Ｔａｌｅｎｔｓ Ｐｒｏｇｒａｍ ｏｆ Ｙｕｎｎａｎ
ｆｏｒ Ｔｏｐ￣ｎｏｔｃｈ Ｙｏｕｎｇ Ｔａｌｅｎｔｓ]ꎮ
第一作者: 陈丽琼(１９９６－)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为保护生物学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｃｈｅｎｌｉｑｉｏｎｇ＠ ｘｔｂｇ.ａｃ.ｃｎꎮ
∗
通信作者: 郁文彬ꎬ博士ꎬ研究员ꎬ研究方向为植物系统与演化ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｙｕｗｅｎｂｉｎ＠ ｘｔｂｇ.ａｃ.ｃｎꎮ
