Page 127 - 《广西植物》2022年第10期

１０ 期 陈丽琼等: 质体系统发育基因组解析旋花科系统发育关系 １ ７ ４ ５

枝上数值表示 ｂｏｏｔｓｔｒａｐ 值ꎬ 支持率为 １００ 的分支不标注ꎮ 图 Ａ 中ꎬ 枝上的数值表示 ｂｏｏｔｓｔｒａｐ 值(ＢＳ ＷＣＧ / ＢＳ ＣＤＳ )ꎬ 枝下的数值表示
＝ １.００ / １.００ 的分支不标注ꎮ
贝叶斯后验概率(ＰＰ ＷＣＧ / ＰＰ ＣＤＳ )ꎬ ＢＳ ＷＣＧ / ＢＳ ＣＤＳ ＝ １００ / １００ 和 ＰＰ ＷＣＧ / ＰＰ ＣＤＳ
Ｎｕｍｂｅｒｓ ａｂｏｖｅ ｂｒａｎｃｈｅｓ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｖａｌｕｅ ａｎｄ ｂｒａｎｃｈｅｓ ｗｉｔｈ １００ ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｓｕｐｐｏｒｔ ａｒｅ ｕｎｌａｂｅｌｅｄ. Ｉｎ Ａꎬ ｎｕｍｂｅｒｓ ａｂｏｖｅ ａｎｄ ｂｅｌｏｗ ｂｒａｎｃｈ
＝
ｌａｂｅｌｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ ｂｏｏｔｓｔｒａｐ(ＢＳ ＷＣＧ / ＢＳ ＣＤＳ ) ａｎｄ ｐｏｓｔｅｒｉｏｒ ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ (ＰＰ ＷＣＧ / ＰＰ ＣＤＳ )ꎬ ｂｒａｎｃｈｅｓ ｗｉｔｈ ＢＳ ＷＣＧ / ＢＳ ＣＤＳ ＝ １００/ １００ ｏｒ ＰＰ ＷＣＧ / ＰＰ ＣＤＳ
１.００/ １.００ ｓｕｐｐｏｒｔ ａｒｅ ｕｎｌａｂｅｌｅｄ.
图 １ 基于不同的质体基因组矩阵构建的旋花科的系统发育树
Ｆｉｇ. １ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅｓ ｏｆ Ｃｏｎｖｏｌｖｕｌａｃｅａｅ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｄａｔａ ｍａｔｒｉｘｅｓ ｏｆ ｐｌａｓｔｏｍｅ

１６６ ６９１ ｂｐꎬ具有 ５３ ０９３ 个变异位点(占序列长度
２ 结果与分析 的 ３１.９％)和 ２８ ６７５ 个简约信号位点(占序列长度

的 １７. ２％)ꎬ 序 列 多 样 性 最 高ꎻ ＣＤＳ 区 矩 阵 长 为
２.１ 质体基因组特征 ７６ ８８３ ｂｐꎬ具有 ２１ ７４８ 个变异位点和 １２ ２９２ 个简
旋花科新测序物种均为典型的四分体结构ꎬ由 约信号位点ꎬ分别占 ＷＣＧ 矩阵变异位点和简约信
大单拷贝区(ＬＳＣ)、小单拷贝区(ＳＳＣ) 和 ２ 个反向 号位点的 ４１.０％和 ４２.９％ꎻＩＲ 区矩阵长 ３７ １０７ ｂｐꎬ

重复序列(ＩＲ) 组成ꎮ 质体基因组大小为１１３ ２７３~ 具有 ９ ９０８ 个变异位点和 ５ ５７４ 个简约信号位点ꎻ
１６４ １１２ ｂｐꎬＬＳＣ 区长度为 ７１ ５１８ ~ ８８ ８９６ ｂｐꎬＳＳＣ ＳＳＣ 区矩阵长 ８ ２３２ ｂｐꎬ具有 ３ ５９６ 个变异位点和
区长度为 ３ ０８７ ~ １６ ６７８ ｂｐꎬＩＲ 区长度为 ２２ ４０９ ~ １ ９６６ 个简约信号位点ꎻＬＳＣ 矩阵长 １１２ ９２６ ｂｐꎬ具
２９ ０８１ ｂｐꎬ且 ＧＣ 含量变化范围为 ３７.２％ ~ ４０.１％ ３７ ０５３ 个变异位点和 １９ ６９９ 个简约信号位点ꎮ
(表 １)ꎮ 基因注释结果显示ꎬ除菟丝子属外ꎬ旋花科 ２.３ 系统发育分析

自养类群的蛋白质编码基因含量保守ꎬ数目为 ７８ ~ 在广 义 旋 花 科 内 ( 包 含 菟 丝 子 属 和 马 蹄 金
７９ 个ꎮ 菟丝子属因其独特的寄生习性导致部分基 族)ꎬ除鱼黄草族( 鱼黄草属) 外ꎬ其他 ７ 个族在所

因丢失ꎬ仅含 ６６ 个蛋白质编码基因ꎮ 有分析中均形成单系( 图 １ꎬ图 ２)ꎮ 同时ꎬ盐帚花
２.２ 矩阵数据特征 族和马蹄金族互为姊妹群ꎬ番薯族和鱼黄草族内
在 ５ 个质体基因组比对矩阵中ꎬＷＣＧ 矩阵长 的 Ｍｅｒｒｅｍｉａ ｑｕｉｎｑｕｅｆｏｌｉａ 互为姊妹群ꎬ旋花族和部