Page 33 - 《广西植物》2022年第11期

ϟϟ 期 石 杨 等 ᧥ 水稻 ᧣໧᤹ଧÞϟዞ 基因的克隆及表达分析 ϟ ऐ ԰ ጢ

ዛ঎ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ 基因结构分析ଫ ଧ঎ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ ऊ᧕୩ 扩增产物ଫ ᤹঎᧕ᓂ԰ ԡԡԡ 标记ଫ ᒦ঎ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ 基因 ऊ᧕୩ 扩增产物ᤥ
ዛ঎ ୩ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ ੫ᔀႿᔀଫ ଧ঎ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ ऊ᧕୩ ᑕቝᡱ᤟ᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍʛࣼዹᡷଫ ᤹঎ ᧕ᓂ԰ ԡԡԡ ᥘᑕʢҴᔀʢଫ ᒦ঎ ऊ᧕୩ ᑕቝᡱ᤟ᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍʛࣼዹᡷ ᆍ஦
᧣໧᤹ଧÞϟዞ ੫ᔀႿᔀ঎
图 ϟজ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ 基因结构分析及 ऊ᧕୩ 全长扩增产物
èᔽ੫঎ ϟজ ᥈ᔀႿᔀ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ ᑕႿʛ ᑕቝᡱ᤟ᔽ஦ᔽዹᑕᡷᔽᆍႿ ᡱʢᆍʛࣼዹᡷ ᆍ஦ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ ऊ᧕୩

ԣॹԣ 水稻 ᧣໧᤹ଧÞϓዞ 基因的生物信息学分析
使用 ۪ʢᆍᡷ۪ᑕʢᑕቝ 工具预测分析 ᨃ༁ᥘାèϟዹ 蛋白的

基本理化性质ᤥ 结果显示ᖔᨃ༁ᥘାèϟዹ 蛋白含有 ϟጢጢ
个氨基酸ᖔ分子式为 ऊ ̀ શ ᨃ ୩ ᖔ分子量为
ᤃँऐ ϟϟऐ࿗ ԰԰࿗ ԰ԡँ ሕ
ϟᤃ঎ϟጢ࿗ Ҵ᧕ᑕᖔ理论等电点ྉ۪᧧ɯ 为 ϟԡ঎ᤃᎮᖔ表明此蛋白
质呈碱性ଫ蛋白质不稳定性指数 ሕᎮ঎ጢँᖔ表现为稳定
蛋白ଫ进一步在 ጶ଴ᡱᑕ༁ᢃ 网站上利用 ۪ʢᆍᡷ୩ዹᑕ᤟ᔀ 软件对
ᨃ༁ᥘାèϟዹ 蛋白亲ᣰ 疏水性进行 分 析ᖔ 结果显示ᖔ
ᨃ༁ᥘାèϟዹ 蛋白多肽链的第 ԰࿗ 位分值最低ᖔ 为
ͱ԰঎ϟϟϟଫ第 ϟ԰ᤃ 位分值最高ᖔ为 ϟ঎ऐጢᤃᖔ同时 ᨃ༁ᥘାèϟዹ
亲水区域大于疏水区域ᖔ属于亲水性蛋白ྉ 图 ԰᧥
ዶɯଫ二级结构预测发现ྉ图 ԰᧥ାɯᖔ在 ᨃ༁ᥘାèϟዹ 氨基
ዛ঎ 疏水性区域预测ଫ ଧ঎ 二级结构预测ᤥ 蓝色঎ም᥋螺旋ଫ 红
酸组成中ᖔ以无规则卷曲为主ᖔ占 ࿗ᤃ঎࿗ጢᠮᖔ其次为 色঎ 延伸链ଫ 绿色঎Ꮗ᥋转角ଫ 紫色঎ 无规则卷曲ᤥ
ዛ঎ ̀ᢃʛʢᆍᡱၤᆍᤦᔽዹ ʢᔀ੫ᔽᆍႿ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿଫ ଧ঎ ୩ᔀዹᆍႿʛᑕʢᢃ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ
ም᥋螺旋ᖔ占 ࿗ጢ঎ϟᤃᠮᖔᏇ 转角占比最少ᖔ为 ࿗঎ጢ԰ᠮᤥ
ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ঎ ଧᤀࣩᓣ঎ም᥋ၤᔀ᤟ᔽ଴ଫ ቴᓣʐ঎ጶ଴ᡷᔀႿʛᔀʛ ዹၤᑕᔽႿଫ ᤩʗᓣᓣႥ঎Ꮗ᥋
ԣॹᇺ 水稻 ᧣໧᤹ଧÞϓዞ 基因启动子顺式作用元件分析 ዹᆍʢႿᔀʢଫ ࣩۗʗᡓᤀᓣ঎ ኏ᑕႿʛᆍቝ ዹᆍᔽ᤟঎
通过 ఋାᡷᆍᆍ᤟༁ 对 ᧣໧᤹ଧÞϟዞ 顺式作用元件进行 图 ԰জ ᨃ༁ᥘାèϟዹ 蛋白的生物信息学分析
可视化分析ᖔ结果如图 ሕ 所示ᤥ ᧣໧᤹ଧÞϟዞ 的启动 èᔽ੫঎ ԰জ ାᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᨃ༁ᥘାèϟዹ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ
子序列中含有参与调节厌氧感应的顺式作用元件
ዶ኏ጶܦ᥈ऊ᥋ቝᆍᡷᔽ஦ܦ光响应元件 ᥈᥋ᤦᆍ଴ܦ乙烯响应元件
ጶ኏ጶ 等ᤥ 这些顺式作用元件可能在水稻应对不同
非生物胁迫响应机制中对启动子的调控发挥重要
作用ᖔ其启动子中基序的存在说明该基因有可能

参与不同类型非生物胁迫的应对机制ᤥ
ԣॹ྽ 水稻 ᧣໧᤹ଧÞϓዞ 多重序列比对和同源性分析

将 ᨃ༁ᥘାèϟዹ 氨基酸序列与水稻ܦ大麦ܦ小麦ܦ
高粱和玉米等 ጢ 种禾本科常见物种中同源基因的 图 ሕজ ᨃ༁ᥘାèϟዹ 蛋白的顺式作用元件分析

氨基酸序列进行同源性分析 ྉ 图 ࿗ɯ ᤥ 结果显示 èᔽ੫঎ ሕজ ऊᔽ༁᥋ᑕዹᡷᔽႿ੫ ᔀ᤟ᔀቝᔀႿᡷ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᨃ༁ᥘାèϟዹ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ