Page 38 - 《广西植物》2022年第11期

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吴朝昕ᖔ 刘雪薇ᖔ 李祖军ᖔ 等঎ 大粒香水稻叶绿体基因组特征分析 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ ԰ԡ԰԰ᖔ ࿗԰ྉϟϟɯ᧥ ϟऐሕԡͱϟऐሕँ঎
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大粒香水稻叶绿体基因组特征分析

吴朝昕ᕷ 刘雪薇 ᕷ 李祖军ᕷ 龙武华ᕷ 宫彦龙ᕷ 朱速松
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ྉ 贵州省农业科学院 水稻研究所ᖔ 贵阳 ጢጢԡԡԡᤃ ɯ

摘জ 要ᧅ 大粒香作为贵州重要的优质稻资源ᖔ推广种植面积大ᖔ并且在乡村振兴过程中为社会带来了较高的
经济效益ᤥ 然而ᖔ目前对大粒香基因组学的理论研究报道较少ᤥ 为揭示大粒香水稻叶绿体基因组ྉዹᡱ᧕શዶɯ特
征及系统发育关系ᖔ该研究对大粒香叶绿体进行测序ᖔ并分析其基因组特征ᤥ 结果表明᧥ྉϟɯ 大粒香水稻
ዹᡱ᧕શዶ 全长 ϟሕ࿗ ጢᤃሕ ᤦᡱᖔ包括 ϟ 个大单拷贝区ྉᓂ୩ऊᖔऐԡ ऐᤃ࿗ ᤦᡱɯܦϟ 个小单拷贝区ྉ୩୩ऊᖔϟ԰ ሕ࿗Ꭾ ᤦᡱɯ和 ԰ 个反向
重复序列区ྉ᧧኏ ᖔ԰ԡ ᤃᎮᤃ ᤦᡱɯᤥ ྉ԰ɯ注释到 ϟ԰ँ 个基因ᖔ可分为蛋白编码ܦᡷ኏શዶ 和 ʢ኏શዶ 三类基因ᖔ数量分别为
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ऐጢ 个ܦሕᤃ 个和 ऐ 个ᤥྉሕɯ密码子偏好分析显示ᖔ大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 密码子偏好 ዶ 碱基或 Вྉఋɯ碱基ᖔ亮氨酸密码子
使用了ϟँ࿗࿗次ᖔ使用次数最多ଫ半胱氨酸的密码子仅使用 ϟँऐ 次ᖔ使用次数最少ᤥྉ࿗ɯ检测到 ϟ԰ँ 个 ୩୩኏ᖔ其中
有 ँጢ 个单核苷酸重复且大部分 ୩୩኏ 序列由 ዶᣰ ఋ 碱基组成ᤥྉጢɯ系统发育分析结果显示ᖔ大粒香与热带粳稻
亲缘关系最近ᖔ聚为一类ᤥ 该研究结果揭示了大粒香叶绿体基因组信息ᖔ并确定了大粒香系统发育所属分支ᤥ
关键词ᧅ 水稻ᖔ 大粒香ᖔ 叶绿体基因ᖔ୩୩኏ᖔ 系统发育分析
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰԰ɯϟϟ᥋ϟऐሕԡ᥋ϟԡ

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收稿日期ᧅ ԰ԡ԰԰ͱԡሕͱ԰ϟ
基金项目ᧅ 黔农科院青年基金ྉЏ԰ԡϟऐ૒ϟԡϟ 号ɯଫ 贵州省科技基础项目ྉ黔科合基础Џ԰ԡ԰ԡ૒ϟɟϟԡϟɯଫ 黔农科院引导项目Џ԰ԡϟऐ૒ԡሕ 号ଫ
黔科合支撑项目ྉЏ԰ԡϟँ૒԰ሕԡ࿗ 号ɯଫ 黔科中引地项目ྉЏ԰ԡϟँ૒࿗ԡԡϟɯଫ黔科合平台人才项目ྉЏ԰ԡϟᎮ૒ጢᎮϟँɯଫ 黔科合基础ྉԻ᣽Џ԰ԡ԰ϟ૒
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第一作者ᧅ 吴朝昕ྉϟँँጢͱ ɯᖔ硕士ᖔ主要从事水稻分子育种研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯऔࣼዹၤᑕᆍ଴ᔽႿϟँँጢ݀ ϟᤃሕ঎ዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 刘雪薇ᖔ硕士ᖔ主要从事水稻分子育种ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯᤃ԰ᎮᤃԡጢሕᎮጢ݀ ीी঎ዹᆍቝᤥ