Page 41 - 《广西植物》2022年第11期

ϟϟ 期 吴朝昕等᧥ 大粒香水稻叶绿体基因组特征分析 ϟ ऐ ሕ ሕ
表 ϓই 大粒香 ዞᡓᦵટዛ 注释基因列表
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功能 基因类别 基因名称
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核酮糖᥋ϟᖔጢ᥋二磷酸羧化酶大亚基 ʗᤇዞᒦ
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自我复制 ኏શዶ 聚合酶 ኏શዶ ᡱᆍ᤟ᢃቝᔀʢᑕ༁ᔀ ʗᡓᅳࣷϟᖔ ʗᡓᅳࣷ԰ᖔ ʗᡓᅳዛᖔ ʗᡓᅳଧ
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转运 ኏શዶ ఋʢᑕႿ༁஦ᔀʢ ኏શዶ༁ ᡙʗႥͅ᤬ІІᤩᖔᡙʗႥႬ᤬Іዛࣷᖔ ᡙʗႥટ᤬ᤩІІ ᖔ ᡙʗႥࣷ᤬ᤩࣷዛᖔ ᡙʗႥ̵᤬ᤩІᤩ ᖔᡙʗႥ௴᤬ІᤩІᖔᡙʗႥዛ᤬
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核糖体 ኏શዶ ኏ᔽᤦᆍ༁ᆍቝᑕ᤟ ኏શዶ༁ ʗʗႥ԰ሕ୒ ᖔ ʗʗႥ࿗ॹጢ୒ ᖔ ʗʗႥϟᤃ୒ ᖔ ʗʗႥጢ୒
其他基因 成熟酶 ቝᑕᡷ᣽ ੫ᔀႿᔀ ቂᐹᡙᣞ
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起始因子 ᔠႥஏዛ
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合成 ऊ 型细胞色素的基因 ዞዞ໧ዛ
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乙酰辅酶 ዶ 羧化酶 ᐹዞዞᦵ
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被膜蛋白 ጶႿ׹ᔀ᤟ᆍᡱ ቝᔀቝᤦʢᑕႿᔀ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ዞᓣቂዛ
蛋白酶 ۪ʢᆍᡷᔀᑕ༁ᔀ ዞᤀᡓۗ
未知功能 保守假定阅读框 ᡥዞஏϟ ᖔ ᡥዞஏሕᖔ ᡥዞஏ࿗
ВႿҴႿᆍऔႿ ஦ࣼႿዹᡷᔽᆍႿ ऊᆍႿ༁ᔀʢ׹ᔀʛ ၤᢃᡱᆍᡷၤᔀᡷᔽዹᑕ᤟ ʢᔀᑕʛᔽႿ੫ ஦ʢᑕቝᔀ
জ 注᧥᥍表示该基因位于反向重复区内ᤥ
জ શᆍᡷᔀ᧥ ᥍ ᔽႿʛᔽዹᑕᡷᔀ༁ ᡷၤᔀ ੫ᔀႿᔀ༁ ᑕʢᔀ ᤟ᆍዹᑕᡷᔀʛ ᔽႿ ᡷၤᔀ ᔽႿ׹ᔀʢᡷᔀʛ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ༁঎

表 ԣই 大粒香 ዞᡓᦵટዛ 含有内含子的基因 ᡙʗႥዛ᤬ІᤩࣷܦᡙʗႥᒦ᤬ࣷዛዛܦᡙʗႥ௴᤬ࣷᤩІܦᡙʗႥႬ᤬ᤩዛࣷܦᡙʗႥቴ᤬ዛࣷᤩܦ
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ᡙʗႥ᤹᤬ࣷዛІ ऐ 个转运 ኏શዶྉ 表 ϟɯᤥ 统计结果显示ᖔ
基因名称 外显子 ᧧ 内含子 ᧧ 外显子֒ 内含子֒ 外显子ᎏ 大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 中有内含子的基因共 ϟᎮ 个ᖔ其中
᥈ᔀႿᔀ Ⴟᑕቝᔀ ጶ଴ᆍႿ ᧧ ᧧ႿᡷʢᆍႿ ᧧ ጶ଴ᆍႿ ֒ ᧧ႿᡷʢᆍႿ ֒ ጶ଴ᆍႿ ᎏ
ᡥዞஏሕ 有 ԰ 个ᖔ剩余 ϟᤃ 个基因只有 ϟ 个ᤥ ᡙʗႥᣞ᤬ІІІ
ʗᡓᤀ԰ྉ଴԰ɯ ሕँሕ ᤃᤃϟ ࿗԰Ꭾ
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ʗᡓᤀϟᤃ ࿗ԡϟ ϟ ԡᤃԡ ऐ ԣॹԣ 大粒香 ዞᡓᦵટዛ 密码子使用分析
ᡙʗႥ௴᤬ࣷᤩІྉ଴԰ɯ ሕϟ ँ԰ँ ጢऐ
在大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 密码子中ᖔ亮氨酸密码子使
ᡙʗႥዛ᤬Іᤩࣷྉ଴԰ɯ ሕᤃ ऐϟ԰ ሕጢ
用了 ϟ ँ࿗࿗ 次ᖔ为最多ଫ半胱氨酸的密码子仅使用
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ᡙʗႥᣞ᤬ІІІ ሕጢ ԰ ࿗ऐऐ ሕᎮ ϟँऐ 次ᖔ为最少ᤥ 在编码大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 的密码子
ᡙʗႥႬ᤬Іዛࣷ ጢ԰ ँ԰ँ ሕϟ 中有 ሕԡ 个密码子偏好性ᢦϟᖔ其中以 ዶ 结尾的有
ᡙʗႥᒦ᤬Іዛዛ ሕጢ ጢ࿗ԡ ጢԡ
ϟ԰ 个ᖔ以 Вྉ ఋɯ 结尾的有 ϟᤃ 个ᖔ 这表明大粒香
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ዹᡱ᧕શዶ 密码子偏好 ዶᣰ Вྉ ఋɯ 碱基ᖔ这种情况常出
Ⴅʐ၊ዛ ጢ࿗ϟ ँऐᤃ ጢ࿗ँ
ᐹᡙᡓÞ ϟጢँ ऐϟ࿗ ࿗ԡᤃ 现在杜梨ܦ 益母草等多种高等植物中 ྉ 张慧等ᖔ
ᡥዞஏሕ ϟጢጢ Ꭾ԰ऐ ԰԰ँ Ꭾ࿗ሕ ϟ԰ሕ ԰ԡϟऐଫ李泳潭等ᖔ԰ԡ԰ԡଫ郑祎等ᖔ԰ԡ԰ԡɯྉ表 ሕɯᤥ